Análise filogenética molecular de subespécies de Crotalus durissus (Viperidae: Crotalinae): inferência a partir do DNA mitocondrial (2004)
- Authors:
- Autor USP: YASSAKA, RICARDO TSUNEO - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIF
- Subjects: COBRAS; VIPERIDAE; DNA MITOCONDRIAL
- Language: Português
- Abstract: O presente trabalho busca compreender melhor a sistemátia de subespécies de Crotalus durissus, com base de dados moleculares de DNA mitocondrial. Para isto, foram amostradas 4 das 14 subespécies: 21 espécimes de C. d. terrificus, 7 de C. d. collilineatus, 4 de C. d. cascavella, 1 de C. d. ruruima e 4 da espécie C. durissus. O DNA total foi extraído a partir de tecido sanguíneo empregando SDS/proteinase K. segmentos dos genes do citocromo b(758 pb) e do NADH desidrogenase subunidade 4 (900 pb) foram amplificados por PCR e seqüenciados. Seus eletroferogramas foram analisados no "Sequence Navigator" e o alinhamento dos segmentos efetuados com o "CLUSTAL X". A edição das seqüências alinhadas foi realizada em "McClade 4.03", segundo o código de leitura do produto protéico. A homogeneidade de bases foi testada com "Tree Puzzzle 50". Com a finalidade de testar a saturação de bases, froam relacionados as substituições com a distância par a par não corrigida, em cada posição do cólon. As reconstruções filogenéticas foram conduzidas no PAUP*, empregando a parcimônia e a máxima verossimilança. O suporte dos ramos foi testado por "bootstrap" e por probabilidade posteriores de análise bayesianas. Os fragmentos de genes do DNA mitocondrial corroboram às análises morfológicas, auxiliando na sistemática do grupo. Fragmentos dos genes cytb e ND4 se mostraram úteis para elucidar as relações filogenéticas entre espécies, contudo entre as subespécies de Crotalus durissus, astopologias resultantes indicam que os sinais filogenéticos são escassos. Genes mitocondriais como, ATP-ase 6 e ATP-ase 8, além de outros táxons devem ser incorporados na análise posteriormente, para auxiliar na resolução desta taxa
- Imprenta:
- Data da defesa: 13.10.2004
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ABNT
YASSAKA, Ricardo Tsuneo. Análise filogenética molecular de subespécies de Crotalus durissus (Viperidae: Crotalinae). 2004. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2004. . Acesso em: 03 maio 2024. -
APA
Yassaka, R. T. (2004). Análise filogenética molecular de subespécies de Crotalus durissus (Viperidae: Crotalinae): inferência a partir do DNA mitocondrial (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. -
NLM
Yassaka RT. Análise filogenética molecular de subespécies de Crotalus durissus (Viperidae: Crotalinae): inferência a partir do DNA mitocondrial. 2004 ;[citado 2024 maio 03 ] -
Vancouver
Yassaka RT. Análise filogenética molecular de subespécies de Crotalus durissus (Viperidae: Crotalinae): inferência a partir do DNA mitocondrial. 2004 ;[citado 2024 maio 03 ]
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