Proteínas envovidas na etapa de brotamento de vírus HIV-1: estudos por simulação molecular (2008)
- Authors:
- Autor USP: MAZZÉ, FERNANDA MARUR - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 593
- Subjects: HIV; PROTEÍNAS (INTERAÇÃO); HIDROGÊNIO; LIGAÇÕES QUÍMICAS
- Language: Português
- Abstract: Há mais de duas décadas, as pesquisas sobre o vírus HIV-1, causador da AIDS, visam o conhecimento dos mecanismos moleculares utilizados durante o seu ciclo de vida. Cerca de 40.000.000 de seres humanos estão atualmente infectados pelo vírus HIV-1 sendo que cerca de 6.000.000 deles estão em perigo de morte imediata. Um passo essencial na replicação do vírus HIV -1 é a etapa de brotamento que promove a saída das novas partículas virais da célula hospedeira. A proteína viral envolvida neste processo é a proteína Gag p6, que apresenta uma região bem conservada em forma de curva, o L-domínio (pT APP). O vírus HIV -1 utiliza a maquinaria celular para executar o seu processo de replicação. Neste contexto, a proteína viral Gag p6 recruta, no hospedeiro, pelo menos duas proteínas celulares, o Tsg101 e a ubiquitina. Na ausência da proteína Tsg101, as novas partículas virais ficam presas à membrana plasmática de tal sorte que a etapa de brotamento não pode ser concluída. Evidências mostram que a ubiquitina está relacionada à etapa de brotamento porque as novas partículas virais contêm centenas dela, denotando a importância desta proteína na etapa de saída dos novos vírus da célula hospedeira. Uma das funções das proteínas Tsg 10 1 e ubiquitina diz respeito à formação de vesículas no interior da célula, vesículas que encerram proteínas que serão submetidas à degradação posteriormente. Há grande similaridade entre este mecanismo e a formação de novas partículas virais. O objetivodo presente trabalho é identificar alguns fatores que conferem estabilidade às estruturas terciárias das proteínas Tsg101, ubiquitina e Gag p6 e quaternárias das suas associações. Para tal, simulações moleculares de sistemas contendo cada uma das proteínas Tsg101, ubiquitina e Gag p6, dos dímeros Tsg101- ubiquitina e Tsg101-Gag p6 e do trímero Tsg101-ubiquitina-Gag p6 foram realizadas em condições fisiológicas com descrição explícita de todos os ) componentes em nível atômico. Os resultados estabelecem que a manutenção das estruturas terciárias e quaternárias é promovida por ligações de hidrogênio intra e intermoleculares. Ademais, contribuem também para a manutenção das estruturas quaternárias, ligações de hidrogênio proteína-proteína e águas estruturais, em processos de sinergia nos quais ocorre a associação simultânea destes vários fatores que contribuem para uma ação coordenada. Alguns grupos de resíduos, em todas as proteínas quando associadas, preservam ligações de hidrogênio proteína-proteína e as águas estruturais que, portanto, devem apresentar grande relevância na estabilidade das estruturas quaternárias indispensáveis ao sucesso da consecução do brotamento do vírus. Em seguimento, diversos modelos de inibição do processo de brotamento do vírus HIV-1 podem ser propostos com o intuito de diminuir a afinidade entre as proteínas Tsg101, ubiquitina e Gag p6. Todavia, o papel preciso de cada uma das proteínas deve ser considerado de modo aminimizar a citotoxicidade. Assim, o foco de inibição deve ser centralizado na proteína viral Gag p6 cuja região 3-11, que inclui o L-domínio, parece ser o alvo mais apropriado devido à rigidez da sua estrutura que parece ser fundamental na fixação do Gag p6 ao Tsg101
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2008
- Data da defesa: 14.02.2008
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ABNT
MAZZÉ, Fernanda Marur. Proteínas envovidas na etapa de brotamento de vírus HIV-1: estudos por simulação molecular. 2008. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2008. . Acesso em: 20 abr. 2024. -
APA
Mazzé, F. M. (2008). Proteínas envovidas na etapa de brotamento de vírus HIV-1: estudos por simulação molecular (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Mazzé FM. Proteínas envovidas na etapa de brotamento de vírus HIV-1: estudos por simulação molecular. 2008 ;[citado 2024 abr. 20 ] -
Vancouver
Mazzé FM. Proteínas envovidas na etapa de brotamento de vírus HIV-1: estudos por simulação molecular. 2008 ;[citado 2024 abr. 20 ]
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