Tese

Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas (2007)

• Authors:
  • Trepode, Nestor Walter
  • Barrera, Júnior (Orientador)
• Autor USP: TREPODE, NESTOR WALTER - BIOINFORMÁTICA
• Unidade: BIOINFORMÁTICA
• Subjects: ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS; BIOINFORMÁTICA
• Agências de fomento:
  • Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
  • Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
• Language: Português
• Abstract: O ciclo de divisão celular compreende uma seqüência de fenômenos controlados por una complexa rede de regulação gênica muito estável e robusta. Aplicamos as Redes Genéticas Probabilísticas (PGNs) para construir um modelo cuja dinâmica e robustez se assemelham às observadas no ciclo celular biológico. A estrutura de nosso modelo PGN foi inspirada em fatos biológicos bem estabelecidos tais como a existência de subsistemas integradores, realimentação negativa e positiva e caminhos de sinalização redundantes. Nosso modelo representa as interações entre genes como processos estocásticos e apresenta uma forte robustez na presença de ruido e variações moderadas dos parâmetros. Um modelo determinístico recentemente publicado do ciclo celular da levedura não resiste a condições de ruido que nosso modelo suporta bem. A adição de mecanismos de auto excitação, permite a nosso modelo apresentar uma atividade oscilatória similar à observada no ciclo celular embrionário. Nossa abordagem de modelar e simular o comportamento observado usando mecanismos de controle biológico conhecidos fornece hipóteses plausíveis de como a regulação subjacente pode ser realizada na célula. A pesquisa atualmente em curso procura identificar tais mecanismos de regulação no ciclo celular da levedura, usando dados de expressão gênica provenientes de medições seqüenciais de microarray
• Imprenta:
  • Publisher place: São Paulo
  • Date published: 2007
• Data da defesa: 27.06.2007


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How to cite

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• ABNT

  TREPODE, Nestor Walter. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas. 2007. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2007. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122007-130518/. Acesso em: 21 maio 2024.

• APA

  Trepode, N. W. (2007). Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122007-130518/

• NLM

  Trepode NW. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas [Internet]. 2007 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122007-130518/

• Vancouver

  Trepode NW. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas [Internet]. 2007 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14122007-130518/

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