SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibtor 1): análise in silico da sequência genômica de Nicotiana tabacum e estudo de parceiros de interação proteína-proteína (2010)
- Authors:
- Autor USP: STRINI, EDWARD JOSÉ - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: FUMO; GENÉTICA VEGETAL; CICLO CELULAR; PROTEÍNAS DE PLANTAS (INTERAÇÃO)
- Language: Português
- Abstract: O sucesso reprodutivo das plantas é dependente do carreto desenvolvimento dos órgãos sexuais, como o pistilo, o qual é coordenado por vias moleculares complexas que controlam a proliferação e a diferenciação celular. Em nosso laboratório foi caracterizado o gene SCI1 de Nicotiana tabacum, que codifica um inibidor de ciclo celular, importante no controle da proliferação/diferenciação celular nos tecidos do estigma e estilete, nos estádios iniciais do desenvolvimento floral. A sequência de aminoácidos revela que o gene codifica uma pequena proteína rica em lisina, com dois domínios putativos de interação com ciclistas e 15 sítios putativos de fosforilação. Experimentas com a proteína Visionada a GFP demonstraram que a proteína apresenta localização nuclear (DePaoli et al., submetido). Para compreender a estrutura gênica de SCI1, sua sequência genômica foi estudada. A análise desta sequência revelou a presença de 4 exons e 3 introns, assim como seu homólogo em Arabidopsis thaliana. A comparação das sequências dos cDNAs disponíveis com as sequências genômicas permite concluir que existem 2 sequências muito similares, mas distintas, para o gene SCI1 em N. tabacum. Esta espécie é alotetraplóide e, provavelmente, estas 2 sequências correspondem a genes homeólogos originados das espécies ancestrais N. syivestris e N. tomentosiformis. A presença de muitos elementos eis regulatórios, dispersos pela sequência genômica, sugere que SCI1 é regulado de forma complexa, incluindo as vias de controle do ciclo celular e de resposta à auxina. Com a finalidade de entender como SCI1 exerce suas funções no controle da proliferação/diferenciação celular, foram realizados ensaios de duplo-híbrido e pull-down para investigar proteínas-candidatas a interagirem com SCI1. Em ensaios de duplo-híbrido, testes foram conduzidos utilizando-se SCI1 como isca e seus possíveis parceirosde interação como presas. Dentre estas, foram testadas: proteínas do ciclo celular, como MAPK, ciclinaA1;1, ciclinaA2;2, ciclinaA2;2 (com D-box delatado), ciclinaD3;2 e CDKA. Além destas, a proteína AGAMOUS também foi utilizada devido o seu importante papel na diferenciação do pistilo. Apesar de pouco conclusivos, os testes de duplo-híbrido, utilizando SCI1 como isca, indicaram uma interação fraca desta proteína com MAPK, sugerindo que SCI1 possa ser fosforilado por esta quinase. A interação da proteína recombinante SCI, sintetizada em células de E. coli BL31 (DE)Rosetta, com proteínas extraídas de estigmas e estiletes de plantas transgênicas de N. tabacum com SCI1 silenciado, foi investigada a partir de ensaios de pull-down. As proteínas que formaram complexos com SCI1 foram identificadas por espectrometria de massa, revelando resultados interessantes. A identificação de uma fosfatase ácida é mais um indicativo de que SCI1 possa ser regulado pela adição e subtração de grupamentos fosfato. Em suma, os resultados obtidos neste trabalho superem que a expressão do gene SCI1 é regulada pelas vias de controle do ciclo celular e de resposta à auxilia, e que a proteína SCI1 sofra fosforilações e defosforilações para realizar suas funções no controle da proliferação/diferenciação celular nos tecidos do estigma e estilete, durante o desenvolvimento do pistilo
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2010
- Data da defesa: 23.04.2010
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ABNT
STRINI, Edward José. SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibtor 1): análise in silico da sequência genômica de Nicotiana tabacum e estudo de parceiros de interação proteína-proteína. 2010. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2010. . Acesso em: 04 jun. 2024. -
APA
Strini, E. J. (2010). SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibtor 1): análise in silico da sequência genômica de Nicotiana tabacum e estudo de parceiros de interação proteína-proteína (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Strini EJ. SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibtor 1): análise in silico da sequência genômica de Nicotiana tabacum e estudo de parceiros de interação proteína-proteína. 2010 ;[citado 2024 jun. 04 ] -
Vancouver
Strini EJ. SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibtor 1): análise in silico da sequência genômica de Nicotiana tabacum e estudo de parceiros de interação proteína-proteína. 2010 ;[citado 2024 jun. 04 ]
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