Estudos estruturais e de interações proteína-proteína envolvendo componentes de um sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv. citri (2010)
- Authors:
- Autor USP: SOUZA, DIORGE PAULO DE - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QBQ
- Subjects: XANTHOMONAS; ESPECTROSCOPIA DE RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR; DIFRAÇÃO POR RAIOS X
- Language: Português
- Abstract: Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) é o causador do cancro de plantas cítricas. Entre os potenciais fatores de virulência codificados por Xac, está o Sistema de Secreção do Tipo IV (T4SS), um grande complexo multiprotéico que atravessa o periplasma e as membranas interna e externa de bactérias Gram-negativas. O T4SS está envolvido com secreção de proteínas e/ou DNA para o meio extracelular ou diretamente no interior da célula do hospedeiro. Este Sistema requer tipicamente 12 proteínas para realizar suas funções: VirB1-VirB11 e VirD4. O T4SS codificado pelo cromossomo de Xac está aparentemente incompleto, devido a não codificar nenhuma proteína com similaridade de seqüência a VirB7. Os objetivos deste trabalho são estudar a estrutura, função e interações das proteínas do T4SS de Xanthomonas. Foram clonados 23 genes que codificam proteínas ou domínios relacionados ao T4SS, e os polipeptídeos foram produzidos de forma recombinante em E. coli. Treze deles foram purificados e submetidos a estudos estruturais, espectroscópicos e de interações proteína-proteína. A estrutura em solução de ´Xac2622IND.24-139´ foi resolvida, apresentando uma região N-terminal desenovelada de aproximadamente 30 resíduos e um domínio globular. Este polipeptídeo oligomeriza em troca química rápida na escala de tempo de RMN e o seu N-terminal desenovelado reconhece o domínio C-terminal de VirB9 (´VirB9IND.154-255´) em troca lenta. Análise de RMN demonstrou que ´Vir9IND.154-255´ possui uma estrutura flexível em solução,sofrendo uma marcante mudança conformacional na presença de 'Xac2622IND.24-139'. Ambas proteínas se tornam rígidas após a interação. Xac2622 é o equivalente a VirB7 em Xanthomonas, baseado na localização do seu gene no lócus do T4SS, localização subcelular predita do polipeptídeo codificado e sua interação com VirB9. Porém, diferente de outras proteínas da família VirB7, Xac2622 possui um domínio globular adicional, com topologia e estrutura similares a domínios presentes apenas em proteínas associadas à membrana externa de bactérias Gram-negativas. Nocaute do gene xac2622, contudo, não afetou a virulência de Xac na infecção de plantas de laranja pêra. O domínio enovelado de Xac2622 foi cristalizado, e os cristais obtidos difrataram até uma resolução de 1,0 Å, pertencendo ao grupo espacial ´C222IND.1´. O modelo preliminar possui 'RIND.factor' de 0,121 e ´RIND.free´ de 0,147. Foram obtidos cristais de outras 3 proteínas relacionadas ao T4SS de Xac, porém somente um deles difratou em alta resolução (2,0 Å, pertencendo ao grupo espacial C2). O potencial sinal de secreção pelo T4SS de Xanthomonas é um domínio Cterminal conservado de aproximadamente 115 resíduos, encontrado nos substratos putativos do T4SS. Caracterizamos um destes domínios, presente na proteína Xac2609, e ele é intrinsicamente desestruturado. Essa observação pode ter implicações funcionais, visto que os substratos são desenovelados antes de sua passagem pelo canal de secreção do T4SS
- Imprenta:
- Data da defesa: 25.05.2010
-
ABNT
SOUZA, Diorge Paulo de. Estudos estruturais e de interações proteína-proteína envolvendo componentes de um sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2010. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2010. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-08112010-092717/. Acesso em: 22 maio 2024. -
APA
Souza, D. P. de. (2010). Estudos estruturais e de interações proteína-proteína envolvendo componentes de um sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv. citri (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-08112010-092717/ -
NLM
Souza DP de. Estudos estruturais e de interações proteína-proteína envolvendo componentes de um sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2010 ;[citado 2024 maio 22 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-08112010-092717/ -
Vancouver
Souza DP de. Estudos estruturais e de interações proteína-proteína envolvendo componentes de um sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2010 ;[citado 2024 maio 22 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-08112010-092717/
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
