Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla (2012)
- Authors:
- Autor USP: ANONI, CARINA DE OLIVEIRA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; MAPEAMENTO GENÉTICO; MARCADOR MOLECULAR; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL
- Keywords: Poliploidia
- Language: Português
- Abstract: O mapeamento de QTLs em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é de grande importância para entendimento da arquitetura genética de caracteres quantitativos e aperfeiçoamento dos programas de melhoramento. Entretanto uma situação comum é a ocorrência de genótipos de marcadores não observados, ocasionando viés na estimativa e localização de possíveis QTLs. Portanto, métodos que consideram a informação de genótipos não observados devem ser utilizados. O presente trabalho teve como objetivo detectar QTLs em uma população de irmão completos de cana-de-açúcar utilizando o método de mapeamento por intervalo com a implementação da abordagem da imputação múltipla. A população de mapeamento foi composta por 220 indivíduos oriundos do cruzamento entre os genitores IACSP95-3018 e IACSP93-3046. Os caracteres avaliados foram : percentual de fibra (Fibra), conteúdo de sacarose (POL), produção de cana por parcela (PC) e produção de açúcar por parcela (PP). Foram utilizadas dez imputações para gerar pseudomarcadores a cada 1cM no mapa de ligação que totalizou 4370 cM. Observou-se que ao total, 57 QTLs foram mapeados nos 113 grupos de ligação avaliados, sendo 14 QTLs para o caráter Fibra, 19 para POL, 12 para PC e 12 para PP. O valor de LOD Score e R2 variaram entre 3,82-7,52 e 6,49%-16,61%, respectivamente. Foi observado que em geral, os efeitos aditivos e de dominância foram significativos, predominando os efeitos aditivos. Além de reduzir o viés ocasionado pelos genótipos não observados, aabordagem da imputação múltipla aumentou o poder de detecção de QTLs, mapeando QTLs com sucesso. Assim, acredita-se que os resultados do presente trabalho, contribuiram para futuros estudos que objetivem a melhor compreensão da arquitetura genética dos caracteres quantitativos da cana-de-açúcar
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2012
- Data da defesa: 30.01.2012
-
ABNT
ANONI, Carina de Oliveira. Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla. 2012. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09022012-155712/. Acesso em: 01 maio 2024. -
APA
Anoni, C. de O. (2012). Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09022012-155712/ -
NLM
Anoni C de O. Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla [Internet]. 2012 ;[citado 2024 maio 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09022012-155712/ -
Vancouver
Anoni C de O. Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla [Internet]. 2012 ;[citado 2024 maio 01 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-09022012-155712/
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