Variações raras no genoma de pacientes com transtorno obsessivo-compulsivo (2013)
- Authors:
- Autor USP: CAPPI, CAROLINA - FM
- Unidade: FM
- Sigla do Departamento: MPS
- Subjects: DNA (ANÁLISE); MUTAÇÃO GENÉTICA; TRANSTORNO OBSESSIVO-COMPULSIVO (GENÉTICA); BIOLOGIA MOLECULAR
- Keywords: Análise mutacional de DNA; DNA mutacional analysis; Exoma; Exome; High-throughput nucleotide sequencing; Obsessive-compulsive disorder/genetics; Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala; Transtorno obsessivo-compulsivo/genética
- Language: Português
- Abstract: Estudos de variações genéticas raras têm caracterizado com sucesso regiões do genoma e processos biológicos envolvidos no risco de desenvolver transtornos psiquiátricos. Dentro deste contexto, o sequenciamento de nucleotídeos em larga escala de exons do genoma inteiro para a observação de variações raras, conhecidas em inglês como single-nucleotide variation (SNV), e mutações espontâneas (\"de novo\" - DNM) tornou-se uma abordagem essencial na descoberta de novos genes de risco para transtornos psiquiátricos. Até o presente momento, nenhum estudo de SNV e variações de novo com sequenciamento de todas as regiões codificantes foi relatado no transtorno obsessivo-compulsivo (TOC). No presente estudo, este sequenciamento foi feito em 20 casos esporádicos de TOC e seus pais, para investigar a presença de variações raras de novo e herdadas nos probandos. A partir da observação de que os produtos de genes (proteínas) associados a uma mesma doença interagem em uma rede de interação proteína-proteína (IPP), foi feita uma rede de IPP com os genes (proteína) que apresentaram variações de novo não sinônimas, para observar dentre estes genes o de maior importância na rede de IPP. A fim de investigar a relevância desta rede, foi aplicado um algoritmo de grau informativo para redes, baseado na priorização de genes relacionados com doenças (Degree-Aware Algorithms for Network-Based Disease Gene Prioritization - DADA) que ordenou os genes com variações de novo não sinônimas, embasado naassociação destes com uma lista de genes envolvidos em conferir risco para TOC provenientes de uma meta-análise de genética em TOC. Além disso, foi feita uma análise de processos biológicos envolvidos com os genes que apresentavam variações raras herdadas. No total, 10 variações de novo não sinônimas (9 missense e 1 nonsense) foram validadas utilizando-se o sequenciamento Sanger. Os genes WWP1, AP1G1 e CR1, advindos da lista inicial de genes com variações não sinônimas, foram altamente conectados na rede de IPP. O gene WWP1 foi o gene com maior pontuação no ranking de resultados do algoritmo DADA. Os resultados de processos biológicos envolvendo estes genes sugerem o envolvimento do sistema imunológico em TOC. Além disso, todos os genes com variações de novo não sinônimas, exceto um, são genes com expressão no cérebro e envolvidos com sinaptogênese e morte neuronal
- Imprenta:
- Data da defesa: 07.08.2013
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ABNT
CAPPI, Carolina. Variações raras no genoma de pacientes com transtorno obsessivo-compulsivo. 2013. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-09092013-160344/. Acesso em: 28 maio 2024. -
APA
Cappi, C. (2013). Variações raras no genoma de pacientes com transtorno obsessivo-compulsivo (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-09092013-160344/ -
NLM
Cappi C. Variações raras no genoma de pacientes com transtorno obsessivo-compulsivo [Internet]. 2013 ;[citado 2024 maio 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-09092013-160344/ -
Vancouver
Cappi C. Variações raras no genoma de pacientes com transtorno obsessivo-compulsivo [Internet]. 2013 ;[citado 2024 maio 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5142/tde-09092013-160344/
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