Identificação de enzimas lignocelulolíticas no microbioma do rúmen de ovinos usando metagenômica shotgun (2013)
- Authors:
- Autor USP: ABDALLA, ADIBE LUIZ - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: OVINOS; RÚMEN; ENZIMAS CELULOLÍTICAS
- Language: Português
- Abstract: Os combustíveis fósseis estão gradativamente sendo substituídos por fontes de energia renováveis e não poluentes, como os biocombustíveis. Porém, há um entrave na produção destes, pois a fração mais recalcitrante da biomassa vegetal não é degradada durante o processo fermentativo, resultando em resíduo aquilo que poderia estar sendo convertido em etanol. Para solucionar tal problema, tem-se procurado novas enzimas para a aplicação no resíduo, permitindo assim a produção de etanol de segunda geração. O sistema digestivo dos ruminantes é um ambiente naturalmente enriquecido para a degradação de biomassa. Estes animais abrigam um complexo microbioma em seus rúmens, onde os compostos lignocelulósicos são degradados graças a enzimas microbianas. Portanto, o presente estudo utilizou a plataforma Ion Torrent (PGM) para o sequenciamento do microbioma do rúmen de ovinos, com o objetivo de identificar enzimas lignocelulolíticas. Foram coletadas amostras de rúmen de quatro carneiros da raça Santa Inês. O DNA total isolado de cada amostra foi agrupado em uma amostra composta, para depois ser inteiramente sequenciado pela abordagem metagenômica. O sequenciamento gerou ~2,26 milhões de reads , com um comprimento médio de 99 pb. Os reads foram anotados por dois bancos de dados de proteína (Swissprot e Subsystems). Foram identificadas várias enzimas relacionadas à degradação de hemicelulose, celulose e até lignina, como endoglucanases (5 hits), β-glicosidases (6 hits), β- xilanases (2 hits), entre outras. Além dos resultados funcionais, o sequenciamento revelou a composição taxonômica bacteriana, dominada por Bacteroidetes (80%), Firmicutes (10%), Proteobacteria (2%) e vários outros filos menos abundantes. Em adição às enzimas já conhecidas, outras foram designadas como putativas, prováveis ou hipotéticas, o que mostra o grande potencial do rúmen
- Imprenta:
- Publisher: Sociedade Brasileira de Microbiologia
- Publisher place: Natal
- Date published: 2013
- Conference titles: Congresso Brasileiro de Microbiologia
-
ABNT
LOPES, L D et al. Identificação de enzimas lignocelulolíticas no microbioma do rúmen de ovinos usando metagenômica shotgun. 2013, Anais.. Natal: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2013. . Acesso em: 27 abr. 2024. -
APA
Lopes, L. D., Lima, A. O. S., Silva, L. R. F., Romagnoli, E. M., Taketani, R. G., Ferreira, C., et al. (2013). Identificação de enzimas lignocelulolíticas no microbioma do rúmen de ovinos usando metagenômica shotgun. In . Natal: Sociedade Brasileira de Microbiologia. -
NLM
Lopes LD, Lima AOS, Silva LRF, Romagnoli EM, Taketani RG, Ferreira C, Abdalla AL, Mendes R. Identificação de enzimas lignocelulolíticas no microbioma do rúmen de ovinos usando metagenômica shotgun. 2013 ;[citado 2024 abr. 27 ] -
Vancouver
Lopes LD, Lima AOS, Silva LRF, Romagnoli EM, Taketani RG, Ferreira C, Abdalla AL, Mendes R. Identificação de enzimas lignocelulolíticas no microbioma do rúmen de ovinos usando metagenômica shotgun. 2013 ;[citado 2024 abr. 27 ] - Effect of polyols blend supplementation to high grain diet on rumen fermentation and methane production in vitro
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