Diversidade genética e mapeamento associativo de caracteres associados à tolerância do arroz ao déficit hídrico (2014)
- Authors:
- Autor USP: SAVIO, FILIPE LUÍS - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: ARROZ; DIVERSIDADE GENÉTICA; MAPEAMENTO GENÉTICO
- Keywords: Tolerância a estresse hídrico
- Language: Português
- Abstract: A caracterização e o entendimento das variações genômicas e morfológicas, bem como a estrutura genética de variedades locais armazenadas em bancos de germoplasma é importante para sua efetiva utilização em programas de melhoramento visando tolerância a estresses. Neste trabalho um conjunto de 192 variedades oriundas de diferentes regiões geoclimáticas do Japão foram testadas quanto à suas características morfológicas e produtivas, utilizando ensaios de campo e metodogias de fenotipagem de alto desempenho. A fenotipagem por meio da metodologia de camadas de herbicida (Aminotriazol+Diuron+2,4D, 100mg/plant) alocado a 30 centímetros de profundidade foi possível detectar variação entre as variedades para comprimento de raiz e velocidade de emissão de raiz sendo possível a distinção de variedades com sistema radicular profundo e sistema radicular superficial baseando-se na sua pontuação no ensaio de herbicida, destacando-se 20 genótipos como possíveis doadores de genes para comprimento, densidade e velocidade de emissão de raízes. Ensaios a campo foram conduzidos em 4 localidades expondo as variedades as mais distintas condições climáticas, buscando analisar a diversidade fenotípica para caracteres agromorfológicos. Os dados fenotípicos obtidos pelos marcadores morfológicos geraram um total de 15 grupos de acessos quando utilizados os 13 caracteres avaliados. A média do índice de sensibilidade a seca foi de 0,99 havendo materiais tolerantes com índices próximos a 0,6 e materiaissensíveis com índice próximos a 1,12. Os 384 marcadores SNP detectaram um total de 73728 alelos indicando alta porcentagem de A (40,8%) e G (34,6%) comparado com C (15,6%) e T (3,6%). Quanto aos heterozigotos, a maior porcentagem foi observada de A/G (0,54%) e a menor porcentagem de A/T (0,04%), sendo a maior parte dos heterozigotos observados nos cromossomos 3 e 8 comparado com outros cromossomos. As análises caracterizaram os acessos japoneses como 98,4% pertencentes à subespécie Japônica. Para associação entre marcadores e fenótipos, foi utilizada a abordagem de modelo linear misto (MLM), o qual incorpora informações de estrutura populacional e parentesco. Os resultados obtidos deverão ser investigados futuramente a fim de confirmar as associações em diferentes populações. O aumento do estresse hídrico teve efeito significativo no desempenho dos acessos, e a interação genótipo e estresse hídrico foi significativa para rendimento final e tamanho de panícula. Entre os acessos estudados foi observada variação genética para as características relacionadas com a tolerância a estresse hídrico e encontraram-se acessos com reduções no rendimento devido ao déficit hídrico comparáveis com o das testemunhas, embora com tamanho de panícula menor, inclusive em condições ótimas. Dos 384 marcadores utilizados, 10 foram responsáveis por associações significativas com o índice de sensibilidade a seca, com base nos diferentes métodos de correção para múltiplos testes. Estas associaçõesforam selecionadas para verificar o efeito alélico sobre o genótipo observado, gerando informações preliminares para a aplicação futura de seleção assistida por marcadores (SAM). O tamanho dos blocos de ligação foram estimados em ~100 kb (r < 0,05) e ~75kb (r < 0,1).
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2014
- Data da defesa: 03.10.2014
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ABNT
SAVIO, Filipe Luís. Diversidade genética e mapeamento associativo de caracteres associados à tolerância do arroz ao déficit hídrico. 2014. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11112014-145926/. Acesso em: 04 maio 2024. -
APA
Savio, F. L. (2014). Diversidade genética e mapeamento associativo de caracteres associados à tolerância do arroz ao déficit hídrico (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11112014-145926/ -
NLM
Savio FL. Diversidade genética e mapeamento associativo de caracteres associados à tolerância do arroz ao déficit hídrico [Internet]. 2014 ;[citado 2024 maio 04 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11112014-145926/ -
Vancouver
Savio FL. Diversidade genética e mapeamento associativo de caracteres associados à tolerância do arroz ao déficit hídrico [Internet]. 2014 ;[citado 2024 maio 04 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11112014-145926/
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