Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico (2015)
- Authors:
- Autor USP: RECCHIA, GUSTAVO HENRIQUE - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; GENÔMICA; MICORRIZA; MICROSCOPIA; MUTUALISMO (BIOLOGIA); RIZOSFERA; RNA; SECA; TRANSCRIÇÃO GÊNICA
- Keywords: Arbuscular Mycorrhizal Fungi; Drought; Fungos micorrízicos arbuculares; Phaseolus vulgaris; Seca; Transcriptome; Transcritoma
- Language: Português
- Abstract: A seca é um dos principais problemas que afetam a produção do feijoeiro. A despeito da importância de caracteres fenotípicos radiculares, muitos dos esforços de melhoramento genético da cultura tem focado na seleção de cultivares com maior produção de grãos. A simbiose estabelecida entre plantas e FMA aumentam o potencial de captação de água no solo através das extensas redes formadas pelas hifas e alteram vias metabólicas vitais para a manutenção das relações hídricas da planta. O modelo de interação feijoeiro (BAT 477) colonizado por uma mistura de FMA (Glomus clarum, Acaulospora scrobiculata e Gigaspora rosea) foi submetido a um déficit hídrico de 96 h durante o pré-florescimento. O transcritoma global de raízes inoculadas e não-inoculadas, sujeitas ou não à seca, foi comparado por RNA-Seq. Um conjunto de 71 transcritos foram induzidos por FMA durante a seca. Comparando-se os tratamentos estresse e controle, 12.086 unigenes foram regulados em plantas inoculadas e 11.938 em não-inoculadas, refletindo o alto potencial de tolerância da linhagem BAT 477 e indicando que a presença de FMA produz uma regulação fina no perfil de expressão de genes regularmente envolvidos na resposta da planta ao estresse. Foram selecionados 15 fatores de transcrição e seus perfis de expressão foram caracterizados por RT-qPCR tomando-se três períodos, 48, 72 e 96 h de déficit hídrico. Plantas inoculadas ativaram a expressão destes genes mais tardiamente (após 72 h), refletindo melhorias nascondições hídricas da planta que adiam a percepção do estresse. Adicionalmente, a expressão de 23 transcritos foi avaliada em três amostras teciduais diferentes obtidas por microscopia de microdissecção a laser. Glucan 1,3 ?-Glucosidase e PIP2,3, foram detectados somente em células do córtex radicular contendo arbúsculos indicando uma possível indução tecido específica dependente da presença dos fungos. Análises complementares apontaram a regulação de 171 unigenes envolvidos na resposta das FMA ao estresse. Estes resultados validam a hipótese inicial de que a inoculação com FMA altera os perfis de expressão de genes vitais para a resposta da planta ao déficit hídrico
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2015
- Data da defesa: 04.12.2015
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ABNT
RECCHIA, Gustavo Henrique. Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico. 2015. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2015. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-02022016-103359/. Acesso em: 21 maio 2024. -
APA
Recchia, G. H. (2015). Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-02022016-103359/ -
NLM
Recchia GH. Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico [Internet]. 2015 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-02022016-103359/ -
Vancouver
Recchia GH. Análise da expressão gênica diferencial causada pela interação de feijoeiros (Phaseolus vulgaris L.) e fungos micorrízicos arbusculares sob efeito de déficit hídrico [Internet]. 2015 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-02022016-103359/
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