Sequenciamento do genoma da serpente Bothrops jararaca para caracterização da estrutura gênica de toxinas (2016)
- Authors:
- Autor USP: ALMEIDA, DIEGO DANTAS - BIOTECNOLOGIA
- Unidade: BIOTECNOLOGIA
- Subjects: SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; SERPENTES; TOXINAS EM ANIMAL; GENOMAS; VENENOS DE ORIGEM ANIMAL; EXPRESSÃO GÊNICA
- Keywords: Bothrops jararaca; Bothrops jararaca; Genômica; Genomics; Toxinas; Toxins; Veneno; Venom
- Language: Português
- Abstract: A Bothrops jararaca é a serpente de maior importância médica no Brasil. Vários estudos foram realizados com o objetivo de caracterizar os componentes do veneno de serpentes, entretanto, a base molecular dos genomas das serpentes é pouco conhecida. Assim, foi realizado o sequenciamento e montagem do genoma da serpente Bothrops jararaca. Foram construídas bibliotecas tipo shotgun e mate-pair para realização de corridas de sequenciamento usando a tecnologia Illumina e sequências complementares foram obtidas em equipamento PACBIO RS II. Uma biblioteca de BACs também foi construída e 768 pools de 12 BACs foram sequenciados. Um grande conjunto de segmentos genômicos foi obtido e foi possível identificar genes de várias toxinas, entre elas SVMPs, SVSPs, BPPs, CRISPs e VEGF. Ainda foi possível depreender o contexto genômico de muitos destes genes e identificamos os principais elementos repetitivos genômicos. Estes achados são relevantes para o entendimento da função e evolução do sistema venenífero e podem servir de base para outros estudos futuramente
- Imprenta:
- Data da defesa: 07.12.2016
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ABNT
ALMEIDA, Diego Dantas. Sequenciamento do genoma da serpente Bothrops jararaca para caracterização da estrutura gênica de toxinas. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2016. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-06042017-133600/. Acesso em: 20 maio 2024. -
APA
Almeida, D. D. (2016). Sequenciamento do genoma da serpente Bothrops jararaca para caracterização da estrutura gênica de toxinas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-06042017-133600/ -
NLM
Almeida DD. Sequenciamento do genoma da serpente Bothrops jararaca para caracterização da estrutura gênica de toxinas [Internet]. 2016 ;[citado 2024 maio 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-06042017-133600/ -
Vancouver
Almeida DD. Sequenciamento do genoma da serpente Bothrops jararaca para caracterização da estrutura gênica de toxinas [Internet]. 2016 ;[citado 2024 maio 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-06042017-133600/
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