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Tese

Diversidade das regiões regulatórias e exônias dos genes ASIP, MC1R e TYRP1 determinada por sequenciamento de nova geração em amostra da população brasileira e seu envolvimento na biossíntese de melanina (2017)

  • Authors:
  • Autor USP: PEREIRA, ÁLISON LUÍS EBURNÊO - FFCLRP
  • Unidade: FFCLRP
  • Sigla do Departamento: 593
  • Subjects: DIVERSIDADE GENÉTICA; MELANINAS; POPULAÇÃO
  • Language: Português
  • Abstract: Por ser a característica mais explícita do ser humano, e por possuir uma regulação extremamente complexa (com mais de 120 genes participantes da regulação), o estudo da pigmentação da pele é alvo de estudos em diversas áreas, como as ciências forenses ou medicina personalizada. A diferença de pigmentação nos seres humanos ao redor do mundo se dá aos diferentes níveis do pigmento melanina, o qual se apresenta em dois tipos principais: a eumelanina, pigmento de tonalidade que varia do marrom ao preto, e a feomelanina, pigmento que varia do amarelo ao vermelho. Estas melaninas são produzidas em células especializadas chamadas melanócitos e, na pele, são distribuídas para as células ao redor, denominadas queratinócitos. Nos olhos, o pigmento permanece retido em melanócitos que compõem a íris. A proteína ASIP, ao se ligar à proteína transmembrana MC1R, inibe uma série de reações que irão culminar na redução de cAMP intracelular e produção de feomelanina apenas. Por outro lado, a ligação do hormônio α-MSH ao receptor MC1R aumenta os níveis de cAMP intracelular, o que induz a produção de eumelanina. Durante a sequência de reações de produção de eumelanina, há a atuação de uma proteína chamada TYRP1, a qual é responsável pela oxidação de DHICA a eumelanina. A diversidade nas sequências dos genes envolvidos na biossíntese de melanina pode influenciar nas proporções produzidas de eumelanina e feomelanina, influenciando diretamente no fenótipo resultante. A análise das regiões gênicas individuais, tanto regiões codificantes quanto reguladoras (promotora e 3'UTR), e associação de variações (SNPs e indels) nessas regiões com determinados fenótipos foi o objetivo geral deste estudo. Foram avaliados 340 indivíduos amostrados junto ao Hemocentro de Ribeirão Preto (SP), que foram classificados de acordo com fenótipos de olhos, cabelos epele. Bibliotecas de DNA (HaloPlex, Agilent) incluindo as sequências regulatórias e codificantes dos três genes foram preparadas e submetidas a análise por metodologia de sequenciamento de nova geração (MiSeq, Illumina). Foram detectados 340 sítios polimórficos (63, 120 e 157 nos genes ASIP, MC1R e TYRP1, respectivamente) que, após a utilização de um filtro rigoroso, além de remoção de singletons, permitiu definir a fase física de 152 polimorfismos nos três genes. Destes, 63 (15, 18 e 30 nos genes ASIP, MC1R e TYRP1, respectivamente) apresentaram associações a algum fenótipo amostrado, sendo que foram encontradas associações à pigmentação da pele, dos olhos e/ou dos cabelos, assim como à presença de sardas. Entre as associações encontradas, algumas já haviam sido relatadas na literatura, como o SNP rsl805007 do gene MC1R e o SNP rs6058017 do gene ASIP. As associações identificadas neste estudo foram altamente significantes, resultando em valores de probabilidade estimada pelo Teste Exato de Fisher de até 1,79xl0^-21 e valores de Odds Ratio de até 382,500. Além de associações dos sítios polimórficos individuais, foram encontradas associações de haplótipos completos dos genes ASIP e MC1R a olhos azuis e cabelos ruivos, respectivamente. Além disso, para os três genes foram identificados polimorfismos na região 3'UTR, os quais podem estar diretamente envolvidos na alteração da regulação por miRNAs. Desta forma, os resultados obtidos neste estudo colaboram com o conhecimento sobre a melanogênese ao caracterizar profundamente as regiões codificantes e regulatórias de três genes que estão diretamente envolvidos na via de pigmentação humana, destacando o impacto das variantes de cada gene na pigmentação dos indivíduos da população brasileira
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 16.03.2017
    • How to cite
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    • ABNT

      PEREIRA, Alison Luis Eburneo. Diversidade das regiões regulatórias e exônias dos genes ASIP, MC1R e TYRP1 determinada por sequenciamento de nova geração em amostra da população brasileira e seu envolvimento na biossíntese de melanina. 2017. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2017. . Acesso em: 09 maio 2024.

    • APA

      Pereira, A. L. E. (2017). Diversidade das regiões regulatórias e exônias dos genes ASIP, MC1R e TYRP1 determinada por sequenciamento de nova geração em amostra da população brasileira e seu envolvimento na biossíntese de melanina (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.

    • NLM

      Pereira ALE. Diversidade das regiões regulatórias e exônias dos genes ASIP, MC1R e TYRP1 determinada por sequenciamento de nova geração em amostra da população brasileira e seu envolvimento na biossíntese de melanina. 2017 ;[citado 2024 maio 09 ]

    • Vancouver

      Pereira ALE. Diversidade das regiões regulatórias e exônias dos genes ASIP, MC1R e TYRP1 determinada por sequenciamento de nova geração em amostra da população brasileira e seu envolvimento na biossíntese de melanina. 2017 ;[citado 2024 maio 09 ]

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