SCI1 (Stigma/style Cell cycle Inhibitor 1) interage com a maquinaria de splicing e seu silenciamento afeta o transcriptoma do pistilo de Nicotiana tabacum L (2016)
- Authors:
- Autor USP: PINOTI, VÍTOR FAVARETTO - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Subjects: GENÉTICA; CICLO CELULAR; RNA; CICLINAS; SOLANACEAE
- Language: Português
- Abstract: A biologia da reprodução de plantas é um campo de grande interesse, já que a maioria dos alimentos consumidos pelo homem é composta de partes reprodutivas das plantas (frutos e sementes). O pistilo é o órgão reprodutivo feminino, composto de estigma, estilete e ovário. Devido à importância central do pistilo no sucesso da reprodução de plantas, faz-se necessário um melhor conhecimento dos genes e processos que regulam seu desenvolvimento e funcionamento. Nosso grupo de pesquisa identificou e caracterizou o gene SCI1 (Stigma/style Cell-cycle Inhibitor 1), que controla a proliferação celular no estigma e estilete de Nicotiana tabacum e de Arabidopsis thaliana (DePaoli et al., 2011; DePaoli et al., 2014). Em tabaco, plantas transgênicas de silenciamento de SCI1 apresentaram pistilos com aumento no comprimento do estilete e no tamanho do estigma, se comparados com pistilos de plantas selvagens. Por outro lado, as plantas de superexpressão apresentaram estigmas menores em relação às plantas selvagens. Análises histológicas demonstraram que estes fenótipos foram decorrentes do aumento no número de células constituintes do tecido transmissor do estilete e da zona secretária do estigma em plantas de silenciamento e a diminuição no número destas células em plantas de superexpressão (DePaoli et al., 2011; DePaoli et al., 2014). Com o intuito de elucidar a regulação exercida por SCI1, a localização subcelular da proteína SCI1GFP foi estudada. Ensaios de colocalização mostraram que a proteína SCI1-GFP localiza em nucléolo, splicing speckles e cyclophilin-containing speckles. Além disso, foram realizadas buscas pelos parceiros de interação proteína-proteína de SCI1. Interessantemente, proteínas relacionadas ao processo de splicing foram identificadas, sendo elas uma putativa helicase de RNA DEAD-BOX (homóloga de At5g51280 de Arabidopsis - RNA helicase DEAD-BOX35),uma CDK (homóloga de At1g67580 de Arabidopsis - CDKG;2), uma ciclina (homóloga de At2g26430 de Arabidopsis - Arginine-rich cyclin 1/Cyclin-Ll) e uma proteína, de função ainda desconhecida, portadora de um domínio SWAP/SURP (homólogo de At5g55100 de Arabidopsis - SWAP (Suppressor-of-White-APricot)/surp domain-containing protein) (Strini, 2014). No presente trabalho, a associação de SCI1 e os parceiros de interação, DEAD-box e Ciclina-L1 ao processo de splicing foi analisada. Através de ensaios de colocalização, foi verificado que DEAD-box e Ciclina-L1 localizam em splicing speckles e cyclophilin-containing speckles. Adicionalmente, ensaios de interação mostraram que SCI1, DEAD-box e Ciclina-L1 interagem com a proteína spliceossomal U2a' e os fatores de splicing RS2Z33 e SR45. Também foi mostrado que SCI1, DEAD-box e Ciclina-L1 interagem com o cofator nucleoplásmico do Exossomo, a helicase de RNA DExH-box HEN2. Além disso, plantas transgênicas de silenciamento de SCI1 apresentaram níveis alterados de lncRNAs similares a regiões centroméricas, elementos transponíveis e regiões não-gênicas, mostrando o envolvimento de SCI1 no metabolismo de RNAs. Estes resultados indicam a participação de SCI1 na formação do centrômero e nas atividades do Exossomo. Por fim, um modelo de regulação do ciclo celular envolvendo SCI1, o processamento de transcritos centroméricos e o complexo SAC (Spindle Assembly Checkpoint) foi proposto, discutindo como proteínas envolvidas no processamento de RNAs podem controlar o ciclo celular
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2016
- Data da defesa: 23.05.2016
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ABNT
PINOTI, Vitor Favaretto. SCI1 (Stigma/style Cell cycle Inhibitor 1) interage com a maquinaria de splicing e seu silenciamento afeta o transcriptoma do pistilo de Nicotiana tabacum L. 2016. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2016. . Acesso em: 11 maio 2024. -
APA
Pinoti, V. F. (2016). SCI1 (Stigma/style Cell cycle Inhibitor 1) interage com a maquinaria de splicing e seu silenciamento afeta o transcriptoma do pistilo de Nicotiana tabacum L (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Pinoti VF. SCI1 (Stigma/style Cell cycle Inhibitor 1) interage com a maquinaria de splicing e seu silenciamento afeta o transcriptoma do pistilo de Nicotiana tabacum L. 2016 ;[citado 2024 maio 11 ] -
Vancouver
Pinoti VF. SCI1 (Stigma/style Cell cycle Inhibitor 1) interage com a maquinaria de splicing e seu silenciamento afeta o transcriptoma do pistilo de Nicotiana tabacum L. 2016 ;[citado 2024 maio 11 ] - Uma nova DEAD-box RNA helicase de plantas associada a fatores de transcrição
- The Nicotiana tabacum CDKG;2 is involved in flowering, transcription, splicing and cell cycle control
- SCI1 is a direct target of AGAMOUS and WUSCHEL and is specifically expressed in the floral meristematic cells
- SCI1 expression in Nicotiana tabacum floral meristems is regulated by the transcription factors WUSCHEL, aintegumenta-like6 and agamous
- SCI1 (stigma/style cell-cycle inhibitor 1) and its interaction partner, NtDDX41, are new plant spliceosome-associated factors
- A novel plant DEAD-box RNA helicase associated with transcription factors
- Stigma/style cell-cycle inhibitor 1, a regulator of cell proliferation, interacts with a specific 14-3-3 protein and is degraded during cell division
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