Desenvolvimento e validação experimental de uma metodologia in house para amplificação e sequenciamento do genoma completo do Zika vírus (2018)
- Authors:
- Autor USP: POUR, SHAHAB ZAKI - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: ZIKA VÍRUS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; GENOMAS; REAÇÃO EM CADEIA POR POLIMERASE; ARBOVÍRUS; MICROCEFALIA; AMPLIFICAÇÃO DE GENES
- Keywords: Amplificação de genoma viral completo; Enrichment; Enriquecimento prévio; New generation sequencing; Polymerase chain reaction; Reação em cadeia da polimerase; Sanger; Sanger; Sequenciamento de nova geração; Whole genome amplification; Zika; Zika
- Language: Português
- Abstract: O zika é um arbovírus emergente. Há evidências para a relação entre o zika e a microcefalia congênita e também com a síndrome de Guillain-Barre. Várias características do vírus são importantes, como a persistência do vírus no sêmen por vários meses, transmissão sexual e evidência de transmissão pré-natal. As mães grávidas infectadas com zika podem dar à luz crianças aparentemente saudáveis que podem apresentar manifestações e complicações tardias. Existe uma clara necessidade de diagnosticar e sequenciar amostras clínicas do ZIKV que circulam na América do Sul, especificamente no Brasil. No entanto, as baixas cargas virais observadas que são observadas comumente em amostras humanas constituem um fator complicador para detecção, amplificação e sequenciamento. Neste projeto, propor projetar um fluxo de trabalho otimizado para o sequenciamento completo do genoma com base no pré-enriquecimento por PCR (reação em cadeia da polimerase) e pools de amplicons
- Imprenta:
- Data da defesa: 19.06.2018
-
ABNT
POUR, Shahab Zaki. Desenvolvimento e validação experimental de uma metodologia in house para amplificação e sequenciamento do genoma completo do Zika vírus. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082018-165426/. Acesso em: 15 maio 2024. -
APA
Pour, S. Z. (2018). Desenvolvimento e validação experimental de uma metodologia in house para amplificação e sequenciamento do genoma completo do Zika vírus (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082018-165426/ -
NLM
Pour SZ. Desenvolvimento e validação experimental de uma metodologia in house para amplificação e sequenciamento do genoma completo do Zika vírus [Internet]. 2018 ;[citado 2024 maio 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082018-165426/ -
Vancouver
Pour SZ. Desenvolvimento e validação experimental de uma metodologia in house para amplificação e sequenciamento do genoma completo do Zika vírus [Internet]. 2018 ;[citado 2024 maio 15 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13082018-165426/ - Chikungunya virus E2 structural protein B-cell epitopes analysis
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