Molecular evolution of Sonic hedgehog (shh) in Salamanders (Caudata, Lissamphibia) (2018)
- Authors:
- Autor USP: LUCCHETTA, ALINE MARIA - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 592
- Subjects: EVOLUÇÃO MOLECULAR; MOLÉCULA
- Language: Inglês
- Abstract: O autopódio corresponde à porção mais distal do membro tetrápode, sendo interpretado por muitos autores como uma novidade evolutiva marcante durante o processo de colonização do ambiente terrestre a partir de ancestrais aquáticos. Na maioria dos tetrápodes, o desenvolvimento do membro se inicia no embrião com a formação de um broto adjacente à parede do corpo, composto por células mesenquimais derivadas da placa lateral e cercado por células ectodérmicas. No broto do membro, é possível identificar morfologicamente a crista ectodérmica apical (AER), uma região que corresponde a um centro sinalizador, e também a zona de atividade polarizante (ZPA), que determina o eixo anteroposterior durante o desenvolvimento dos dígitos. Este eixo é pós-axial na maioria das linhagens tetrápodes, e as vias de desenvolvimento que formam o membro parecem ser canónicas entre táxons. No entanto, exceções nestes processos têm sido descritas no desenvolvimento de salamandras (Caudata). Nestes animais, a AER não é morfologicamente detectável, apesar de existirem sinais moleculares similares aos observados em outras linhagens tetrápodes, e a polaridade de formação dos dígitos é pré-axial, ao invés de pós-axial. Adicionalmente, salamandras adultas são capazes de regenerar por completo membros locomotores que foram amputados. Neste contexto de desenvolvimento e regeneração, um gene particularmente interessante é sonic hedgehog (shh), um morfógeno expresso pela ZPA que determina a polaridade durante o desenvolvimento dos dígitos e também está envolvido na regeneração dos membros. Nessa dissertação, testamos a presença de assinaturas moleculares na sequência codificante de shh e em sua região cis-regulatória (o enhancer ZRS) em salamandras, usando o genoma do axolote (Ambystoma mexicanum) como referência. Utilizamos ferramentas bioinformáticas para testar modelos deseleção na região codificante de shh usando análises de máxima verossimilhança implementadas no pacote de programas PAML; a seguir, inferimos a conservaçao da sequência, e realizamos predições de motifs e predições in silico de sítios de ligação a fatores de transcrição (TFBS) na ZRS. Como resultado, encontramos evidência de seleção purificadora na região codificante de shh para todos os tetrápodes, a qual seria mais forte em A. mexicanum, indicando que a evolução deste gene é ainda mais restrita em salamandras. Na ZRS, identificamos um sítio predito para o fator de transcrição NF1_Q6 que parece estar ausente nas outras linhagens. Estes resultados são discutidos considerando os padrões peculiares de desenvolvimento do autopódio nas salamandras e sua habilidade de regenerar completamente membros amputados em diferentes estágios de vida
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2018
- Data da defesa: 06.12.2018
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ABNT
LUCCHETTA, Aline Maria. Molecular evolution of Sonic hedgehog (shh) in Salamanders (Caudata, Lissamphibia). 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2018. . Acesso em: 30 abr. 2024. -
APA
Lucchetta, A. M. (2018). Molecular evolution of Sonic hedgehog (shh) in Salamanders (Caudata, Lissamphibia) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Lucchetta AM. Molecular evolution of Sonic hedgehog (shh) in Salamanders (Caudata, Lissamphibia). 2018 ;[citado 2024 abr. 30 ] -
Vancouver
Lucchetta AM. Molecular evolution of Sonic hedgehog (shh) in Salamanders (Caudata, Lissamphibia). 2018 ;[citado 2024 abr. 30 ]
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