Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro (2019)
- Authors:
- Autor USP: ALMEIDA, LUIZ GUSTAVO NOGUEIRA DE - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- Subjects: IMUNOLOGIA; EPITOPOS; BIOINFORMÁTICA; CARRAPATOS; VACINAS
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Carrapatos são os mais importantes vetares para a transmissão de doenças para bovinos, e por isso o controle eficiente das infestações é de grande interesse. Vacinas multi-antigênicas baseadas em antígenos recombinantes salivares tem demonstrado boa atividade anti-carrapatos, mas seu desenvolvimento é complexo. Este processo pode ser facilitado pelo uso de ferramentas in silico para a predição de epitopos em antígenos de interesse. No entanto, não há dados disponíveis sobre a utilidade destes métodos, construídos com bases de dados humanas e murinas, para a identificação de epitopos reconhecidos por anticorpos bovinos. Neste trabalho, nós investigamos em antígenos de carrapatos se há uma correspondência entre a predição in silico e o mapeamento in vitro de epitopos para células B. Para tal, nós submetemos nove sequências proteicas de antígenos presentes na saliva do carrapatos Rhipicephalus microplus à modelagem tridimensional e predição de epitopos contínuos e descontínuos pelas ferramentas Bebipred e Epitopia, respectivamente. Concomitantemente, nós imunizamos bovinos com os mesmos antígenos recombinantes para a produção de soro hiperimune ao pool de antígenos, e verificamos a reatividade deste soro com mimotopos identificados por phage display utilizado IgY-antigeno especifico no biopanning. As predições bioinformáticas indicaram a ocorrência de 46% a 94% de aminoácidos antigênicos nas sequências analisadas, enquanto que o mapeamento in vitro identificou cerca de 20% a 42% de aminoácidos antigênicos para os diferentes antígenos. Ao sobrepor os resultados obtidos, observamos que as técnicas in silico foram capazes de prever até 92% dos epitopos mapeados in vitro, mas esse alto valor está diretamente associado à superestimação no número de aminoácidos imunogênicos nas análises de bioinformática. Dessa forma, torna-se necessário oajuste dos parâmetros utilizados na predição, visto que a sua otimização pode resultar em uma análise mais acurada pelas ferramentas de bioinformática. No entanto, com a atual metodologia, as ferramentas in silico são úteis para a exclusão de sequências que não são características de epitopos. Essa abordagem pode ser utilizada para a identificação restrição de regiões dos antígenos com pouca antigenicidade predita, estratégia que pode reduzir o número de sequências a serem avaliadas como candidatos vacinais e também facilitar a construção de vacinas multi-antigênicas
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2019
- Data da defesa: 30.04.2019
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ABNT
ALMEIDA, Luiz Gustavo Nogueira de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2019. . Acesso em: 21 maio 2024. -
APA
Almeida, L. G. N. de. (2019). Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Almeida LGN de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019 ;[citado 2024 maio 21 ] -
Vancouver
Almeida LGN de. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019 ;[citado 2024 maio 21 ]
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