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Association mapping to exploit maize diversity for drought tolerance: landraces and early testcrosses as genetic resources (2020)

  • Authors:
  • Autor USP: BARBOSA, PEDRO AUGUSTO MEDEIROS - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LGN
  • Subjects: MILHO; DEFICIT HÍDRICO; DIVERSIDADE GENÉTICA; MAPEAMENTO GENÉTICO; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; RESISTÊNCIA GENÉTICA VEGETAL; SECA; VARIEDADES VEGETAIS
  • Keywords: Análise espacial
  • Language: Inglês
  • Abstract: A produção de milho ao redor do mundo vem apresentando uma grande dificuldade nos últimos anos, eventos de seca estão se tornando mais frequentes e severos, principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Além disso, as mudanças climáticas têm sugerido que isso é uma tendência real para os próximos anos. O estresse causado pela deficiência hídrica nas lavouras de milho pode resultar em grandes quebras de produtividade de grãos. O México é o centro de origem do milho, e diversos são os centros de diversidade genética espalhados pela América Latina. Toda essa diversidade deve ser explorada pelos programas de melhoramento, já que ela é uma extraordinária fonte de novos alelos que podem ter um papel fundamental nos ganhos genéticos alcançados pelo melhoramento nos próximos anos colaborando para o enfrentamento dos desafios que são previstos. Esta tese de doutorado aborda o tema em duas partes. Primeiro, apresentamos uma revisão sobre a abundante diversidade genética do milho, e o uso de variedades crioulas nos programas de melhoramento para tolerância a seca, evidenciando a importância de se desenvolver germoplasma tropical adaptado as condições de seca no intuito de contornar este problema. Ainda na revisão, nós discutimos o uso de estudos de Associação Genômica Ampla (GWAS) e seleção assistida por marcadores (MAS) neste contexto. Na segunda parte, apresentamos um trabalho onde utilizamos GWAS em um programa de pré-melhoramento de milho visando tolerância à seca, ondevariedades crioulas foram usadas como fonte de diversidade genética. O objetivo foi estudar os recursos genéticos oferecidos por um painel inicial de crioulas para identificar as regiões cromossômicas associadas à tolerância à seca. Para tanto, foram utilizadas 1306 progênies oriundas de 20 populações crioulas selecionadas por seu desempenho em regiões secas da América Latina. Dados fenotípicos foram obtidos a partir de testcross precoces de duas gerações (RC1S1 em 2016 e RCS2 em 2017) conduzidos em dois regimes hídricos distintos, um irrigado e outro sob seca, em três locais no México. O índice de média harmônica do desempenho relativo (HMRP), calculado com base nos rendimentos de grãos em ambos os regimes de água, foi utilizado como medida de tolerância à seca dos genótipos. Os valores genotípicos foram estimados usando ajuste espacial em uma análise de dois estágios. Um conjunto final de 5695 marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNPs) foi considerado para o mapeamento associativo. Como resultados, pudemos detectar um total de 10 marcadores significativos associados ao rendimento de grãos e ao índice de tolerância à seca, e sugerimos dois genes putativos mapeados próximos a dois desses marcadores que podem ter importante participação na resposta da planta ao estresse hídrico. Além disso, para dois SNPs associados, alelos originários das variedades crioulas resultaram em um rendimento ligeiramente maior sob condições de seca. Nossos resultados indicam que adiversidade oferecida pelas variedades crioulas combinada com linhagens já melhoradas pode ter um importante papel no melhoramento de milho tropical para a tolerância à seca
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 14.02.2020
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      BARBOSA, Pedro Augusto Medeiros. Association mapping to exploit maize diversity for drought tolerance: landraces and early testcrosses as genetic resources. 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2020. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04052020-160237/. Acesso em: 27 abr. 2024.
    • APA

      Barbosa, P. A. M. (2020). Association mapping to exploit maize diversity for drought tolerance: landraces and early testcrosses as genetic resources (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04052020-160237/
    • NLM

      Barbosa PAM. Association mapping to exploit maize diversity for drought tolerance: landraces and early testcrosses as genetic resources [Internet]. 2020 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04052020-160237/
    • Vancouver

      Barbosa PAM. Association mapping to exploit maize diversity for drought tolerance: landraces and early testcrosses as genetic resources [Internet]. 2020 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-04052020-160237/


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