Structural Bioinformatics studies of the Zika virus non-structural protein 1 and its molecular interactions (2022)
- Authors:
- Autor USP: CUEVAS, SERGIO ALEJANDRO POVEDA - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- DOI: 10.11606/T.95.2022.tde-02052022-223047
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; FLAVIVIRUS; ZIKA VÍRUS
- Keywords: Bioinformática estrutural; Biomolecular complexes; Complexos biomoleculares; Dinâmica molecular; Electrostatic interactions; Interações eletrostáticas; Molecular dynamics; Monte Carlo; NS1 protein; Proteína NS1; Structural bioinformatics
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: O gênero Flavivirus é um grupo com mais de 70 espécies virais, geralmente, distribuídas em zonas tropicais. Durante vários anos, os flavivirus vêm representando um grande problema de saúde pública, produzindo milhares de mortes e infecções anualmente. Os desafios para melhorar a capacidade de diagnóstico e outras intervenções para vírus, tais como o Zika, requerem a compreensão das interações físicas que ocorrem no nível molecular. Como um alvo terapêutico, a proteína não estrutural 1 (NS1) tem sido uma peça central, por ser um elemento importante na virulência e sobrevivência do vírus Zika. Usando abordagens de Bioinformática Estrutural, objetivamos entender as propriedades moleculares e os mecanismos que ocorrem em diferentes interfaces biológicas desta proteína viral e sua relação com a virulência. Empregando uma abordagem computacional através de simulações Monte Carlo a pH-constante e dinâmica molecular, descrevemos várias propriedades físico-químicas e dinâmico-estruturais que têm uma estreita relação com os processos de associação onde NS1 é um participante chave. Nossos resultados contribuem para o entendimento físico-químico geral da complexação macromolecular e seu vasto papel na biologia celular, fornecendo evidências para possíveis aplicações farmacológicas
- Imprenta:
- Data da defesa: 09.03.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
POVEDA CUEVAS, Sergio Alejandro. Structural Bioinformatics studies of the Zika virus non-structural protein 1 and its molecular interactions. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02052022-223047/. Acesso em: 03 maio 2024. -
APA
Poveda Cuevas, S. A. (2022). Structural Bioinformatics studies of the Zika virus non-structural protein 1 and its molecular interactions (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02052022-223047/ -
NLM
Poveda Cuevas SA. Structural Bioinformatics studies of the Zika virus non-structural protein 1 and its molecular interactions [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02052022-223047/ -
Vancouver
Poveda Cuevas SA. Structural Bioinformatics studies of the Zika virus non-structural protein 1 and its molecular interactions [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-02052022-223047/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.95.2022.tde-02052022-223047 (Fonte: oaDOI API)
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