Terpenoma de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal (2022)
- Authors:
- Autor USP: MACHADO, MAURICIO JUNIOR - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-11082022-145740
- Subjects: CYANOPHYTA; GENÔMICA; METABÓLITOS; METABOLÔMICA; TERPENOS
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: No Pantanal brasileiro existem lagoas salino-alcalinas que exibem alto pH e concentrações de sais, onde ocorrem florações de cianobactérias apesar das condições extremas destes ambientes. Esses organismos fotossintetizantes oxigênicos são capazes de produzir diversos metabólitos especializados para a sua sobrevivência, os quais podem ter potencial aplicação biotecnológica. Dentre esses metabólitos produzidos pelas cianobactérias está a classe dos terpenos e terpenóides. Desta forma, o objetivo deste estudo foi realizar a mineração de agrupamentos gênicos de terpenos e terpenóides em genomas de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal [Alkalinema pantanalense CENA528, Anabaenopsis elenkinii CCIBt3563, Geminocystis sp. CENA526, Arthrospira platensis CENA597 e CENA650, Pantanalinema rosanae CENA516 e 11 genomas montados a partir de metagenomas (MAGs Metagenome-Assembled Genomes)].A via biossintética de terpenos foi visualizada usando a ferramenta BlastKOALA e os agrupamentos de genes preditos na plataforma antiSMASH. Os genes e agrupamentos foram analisados quanto a sintenia e ortologia e comparados aos disponíveis nos bancos de dados. Os extratos celulares da biomassa cultivada das seis linhagens foram analisados por LC-MS/MS para identificar os metabólitos produzidos. Todos os genomas e MAGs apresentaram a via biossintética dos compostos precursores dos terpenos, assim como as vias de biossíntese de tetraterpenóides e ubiquinonas. Genes envolvidos nabiossíntese de esqualeno e hopeno, triterpenóides, foram identificados somente em três genomas e em uma das MAGs. As análises de ortologia e sintenia mostraram que os genes da biossíntese de terpenóides são mais conservados entre gêneros e possuem identidade média de 60% para o filo Cyanobacteria. Na desreplicação dos compostos, o maior número foi identificado como pertencentes ao grupo dos tetraterpenóides. Outros compostos anotados nas linhagens foram Cibastacina A, um raro sesterterpeno, Austinoneol, um meroterpenóide e a lactona diterpênica Scytoficina. A utilização das ferramentas in silico para predição de genes e metabólitos conhecidos permitiu a exploração do terpenoma de cianobactérias que habitam as lagoas salino-alcalinas do Pantanal, abrindo caminho para futuras aplicações biotecnológicas
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2022
- Data da defesa: 04.07.2022
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
-
ABNT
MACHADO, Mauricio Junior. Terpenoma de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal. 2022. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-11082022-145740/. Acesso em: 03 maio 2024. -
APA
Machado, M. J. (2022). Terpenoma de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-11082022-145740/ -
NLM
Machado MJ. Terpenoma de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-11082022-145740/ -
Vancouver
Machado MJ. Terpenoma de cianobactérias isoladas de lagoas salino-alcalinas do Pantanal [Internet]. 2022 ;[citado 2024 maio 03 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-11082022-145740/ - Fungos micorrízicos arbusculares associados a doses de fósforo no crescimento da cultura do milho
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Informações sobre o DOI: 10.11606/D.11.2022.tde-11082022-145740 (Fonte: oaDOI API)
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