Classificação e evolução de GTPases da classe TRAFAC: a história evolutiva das septinas/parasseptinas (2020)
- Authors:
- Autor USP: GOMES, GUILHERME BASTOS - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- DOI: 10.11606/D.42.2020.tde-13012022-181211
- Subjects: ENZIMAS HIDROLÍTICAS; NUCLEOTÍDEOS; TRANSDUÇÃO DE SINAL CELULAR; CITOESQUELETO; FILAMENTOS CITOPLASMÁTICOS; CRISTALOGRAFIA
- Keywords: Classificação; Classification; Evolução; Evolution; GTPases; GTPases; Paraseptin; Parasseptinas; Septin; Septinas
- Language: Português
- Abstract: Existem diversas proteínas capazes de ligar e hidrolisar moléculas de nucleotídeo fosfato e grande parte delas são necessárias para a manutenção da vida. As GTPases são proteínas do fold P-loop NTPases com capacidade de catalisar moléculas de GTP e ATP para efetuar e regular processos celulares como a iniciação e elongamento da tradução, remodelamento ou organização de membranas, sinalização, síntese de nutrientes e imunidade. As GTPases são divididas em duas classes com base em suas sinapomorfias: TRAFAC e SIMIBI. Neste trabalho nos concentramos na história evolutiva de GTPases da classe TRAFAC (de translation factors ), que agrega diversas famílias de proteínas altamente divergentes que partilharam ancestralidade comum como: os fatores de tradução, a superfamília Ras de transdutores de sinal, a família FeoB de transportadores de ferro, as dinaminas e as septinas que participam de processos de remodelamento e tráfego de vesículas, entre outras. A última classificação massiva desses grupos de GTPases baseada nas estruturas e caracteres compartilhados a nível de sequência foi proposta no início deste século, precisamente em 2002, e por esse motivo esse trabalho objetivou comparar as sequências e estruturas disponíveis dessas GTPases desenvolvendo uma metodologia reprodutível baseada na similaridade entre as sequências e em perfis de sequências baseados em HMMs, seguidas de análises de redes, de modo a construir uma classificação evolutiva natural e atualizada e inferir hipóteses evolutivas a respeito da origem e diversificação desses grupos de genes amplamente divergentes. Além disso, aprofundamos o debate sobre a história evolutiva das septinas nos organismos eucariotos e da relação evolutiva desse grupo com as famílias semelhantes as septinas como GIMAP e Toc, e de um grupo relacionado ainda não caracterizado experimentalmente das parasseptinas bacterianas
- Imprenta:
- Data da defesa: 13.11.2020
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
GOMES, Guilherme Bastos. Classificação e evolução de GTPases da classe TRAFAC: a história evolutiva das septinas/parasseptinas. 2020. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13012022-181211/. Acesso em: 21 maio 2024. -
APA
Gomes, G. B. (2020). Classificação e evolução de GTPases da classe TRAFAC: a história evolutiva das septinas/parasseptinas (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13012022-181211/ -
NLM
Gomes GB. Classificação e evolução de GTPases da classe TRAFAC: a história evolutiva das septinas/parasseptinas [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13012022-181211/ -
Vancouver
Gomes GB. Classificação e evolução de GTPases da classe TRAFAC: a história evolutiva das septinas/parasseptinas [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 21 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-13012022-181211/
Informações sobre o DOI: 10.11606/D.42.2020.tde-13012022-181211 (Fonte: oaDOI API)
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