Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas (2022)
- Authors:
- Autor USP: NASCIMENTO FILHO, EDSON GALDINO DO - BIOTECNOLOGIA
- Unidade: BIOTECNOLOGIA
- DOI: 10.11606/T.87.2022.tde-08122022-113314
- Subjects: LEPTOSPIROSE; BACTÉRIAS GRAM-NEGATIVAS; INFECÇÕES BACTERIANAS GRAM-NEGATIVAS; PROTEÔMICA; VIRULÊNCIA
- Keywords: Leptospira biflexa; Leptospira biflexa; Leptospira interrogans; Leptospira interrogans; análise comparativa; comparative analyses; leptospirose; pathogenesis and leptospirosis; patogênese; proteômica; proteomics; virulence; virulência
- Language: Português
- Abstract: Leptospira é um gênero de bactérias espiroquetas que inclui espécies saprofíticas ou não patogênicas de vida livre encontradas em água ou solo, e espécies patogênicas, que são os agentes etiológicos da leptospirose. Esta doença é uma zoonose de incidência global, ocorrendo principalmente em países tropicais e subtropicais. A leptospirose pode ser assintomática ou sintomática com quadros clínicos variáveis nos seres humanos. Os determinantes de virulência e patogenicidade das leptospiras ainda permanecem pouco compreendidos. Em vista disso, foi realizada uma análise global das proteínas expressas na espécie saprofítica, L. biflexa, para comparar com o proteoma da espécie patogênica, L. interrogans, disponível na literatura. A partir desta análise comparativa, o objetivo principal seria reconhecer os potenciais alvos envolvidos na virulência e patogênese da L. interrogans. Foram identificadas 2.327 proteínas por espectrometria de massas na L. biflexa representando 64% das proteínas preditas no genoma desta bactéria. As proteínas identificadas nas duas espécies apresentaram uniformidade funcional pelo software COG. Aproximadamente 80% das proteínas tiveram localizações subcelulares definidas pelo software PSORTb, e 21% das proteínas apresentaram peptídeos sinais de exportação pelos softwares SignalP e LipoP. As vias metabólicas do complexo B (B1, B2, B6, B7 e B9) foram identificadas nas duas espécies de leptospiras, já as vias B12 e do ácido siálico apenas na espécie patogênica.Também foram identificadas as proteínas ortólogas e exclusivas nas duas espécies de leptospiras pelo software Get Homologues. As proteínas ortólogas foram posteriormente classificadas como pouco conservadas e conservadas. Destas análises, selecionaram-se apenas as proteínas pouco conservadas e as proteínas exclusivas da L. interrogans para serem melhor investigadas conforme os resultados obtidos sobre função biológica (COG), localização subcelular (PSORTb e CELLO) e peptídeo sinal de exportação (SignalP e LipoP), juntamente das análises de domínios estruturais pelos softwares Pfam e SMART. Um total de 1.109 proteínas foi previamente selecionado na L. interrogans. Deste total, selecionamos 738 proteínas com domínios estruturais (108 pouco conservadas e 93 exclusivas) e 123 proteínas sem domínios estruturais (59 pouco conservadas e 64 exclusivas). Estas últimas foram baseadas exclusivamente em suas localizações como proteínas de membrana externa, extracelulares e proteínas sem localização definida. Segundo esses critérios, temos 861 proteínas selecionadas como potencias alvos envolvidos na virulência das leptospiras patogênicas
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- Data da defesa: 13.10.2022
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
NASCIMENTO FILHO, Edson Galdino do. Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-08122022-113314/. Acesso em: 30 abr. 2024. -
APA
Nascimento Filho, E. G. do. (2022). Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-08122022-113314/ -
NLM
Nascimento Filho EG do. Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-08122022-113314/ -
Vancouver
Nascimento Filho EG do. Identificação dos fatores de virulência da Leptospira interrogans através de análises proteômicas comparativas [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 30 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-08122022-113314/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.87.2022.tde-08122022-113314 (Fonte: oaDOI API)
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