Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System (2023)
- Authors:
- Autor USP: SOARES, ANA CAROLINA DOS SANTOS - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- DOI: 10.11606/T.95.2023.tde-15062023-143118
- Subjects: GENÔMICA; BIOINFORMÁTICA; BIOLOGIA AQUÁTICA
- Keywords: Diversidade microbiana; Esponjas marinhas; Marine sponge; Metagenômica; Metagenomics; Microbial diversity; Microbioma; Microbiome
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: O Sistema Recifal Amazônico está localizado na Plataforma Continental Amazônica, embaixo da pluma do rio Amazonas. Este ambiente é formado principalmente por esponjas e algas calcárias. Esponjas são os principais membros da comunidade bentônica marinha. Através da filtração de grandes quantidades de água, exercem um papel importante na conexão entre o compartimento pelágico e bêntico. Além disso, são capazes de influenciar na ciclagem de nutrientes pela remoção, processamento e liberação do filtrado. Esponjas também são conhecidas por abrigar uma grande quantidade de microrganismos, no qual a abundância pode ser até 3 a 4 ordens de grandeza maior que a da água do entorno. Muitas funções estão relacionadas a estes simbiontes, como suprimento de nutrientes, estabilização do esqueleto da esponja, síntese e processamento de metabólitos secundários, que estão envolvidos na defesa das esponjas. Através de uma abordagem ômicas, o principal objetivo deste estudo é analisar o microbioma de esponjas do Sistema Recifal Amazônico, em termos taxonômicos, genômicos, funcionais e comparativos. Um total de 236.131.258 sequências de boa qualidade foram geradas para 37 metagenomas de 20 espécies de esponjas. A análise taxonômica mostrou que a comunidade microbiana apresenta uma alta abundância dos filos Actinobacteria, Euryarchaeota, Chloroflexi e Planctomycetes, além das classes Betaproteobacteria and Deltaproteobacteria. O perfil do microbioma das esponjas também foi distinto do microbiomada água do entorno, demonstrando que esponjas possuem uma microbiota própria, corroborando a literatura. Além disso, foram recuperados 115 genomas dos metagenomas, revelando novas espécies de bactérias e arquéias. A análise funcional indicou um enriquecimento dos genes relacionados aos metabolismos de carbono, nitrogênio e enxofre. Estes resultados revelam um novo conhecimento sobre os microrganismos simbiontes de esponjas
- Imprenta:
- Data da defesa: 28.04.2023
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
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- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by-nc-sa
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ABNT
SOARES, Ana Carolina dos Santos. Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15062023-143118/. Acesso em: 05 maio 2024. -
APA
Soares, A. C. dos S. (2023). Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15062023-143118/ -
NLM
Soares AC dos S. Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15062023-143118/ -
Vancouver
Soares AC dos S. Sponge microbiomes from Great Amazon Reef System [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-15062023-143118/
Informações sobre o DOI: 10.11606/T.95.2023.tde-15062023-143118 (Fonte: oaDOI API)
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