Caracterização de haplótipos na população brasileira Projeto ISA - Nutrição (2023)
- Authors:
- USP affiliated authors: FRANÇA, JAQUELINE LOPES PEREIRA - FSP ; FISBERG, REGINA MARA - FSP ; SOLER, JULIA MARIA PAVAN - IME ; SOUZA, JOZIMARA TEIXEIRA DE - BIOINFORMÁTICA
- Unidades: FSP; IME; BIOINFORMÁTICA
- Subjects: GENÓTIPOS; HAPLOTIPOS; BIOESTATÍSTICA
- Language: Português
- Abstract: Dados de marcadores moleculares como as plataformas de SNPArray (Polimor smos de Nucleotídeo Único) permitem a identi cação de diferentes variações, bem como covariações, que ocorrem no genoma de diferentes espécies, como é o caso de haplótipos em humanos. O entendimento de como o genoma está estruturado em regiões de dependência e independência entre marcadores é de fundamental importância no mapeamento de genes associados a fenótipos de interesse. Basicamente, para uma amostra de n indivíduos, a caracterização do genoma pode ser feita no nível de blocos haplotípicos, analisando as 2n sequências de valores no alfabeto 0,1, o qual identi ca a ausência ou presença do alelo alvo nas posições de marcadores distribuídos de forma orientada no genoma. No mapeamento de genes, ao analisar a in uência de blocos haplotípicos sobre fenótipos, ao invés de analisar marcadores (SNP) individuais, aumenta-se a precisão e a chance de sucesso dos estudos. Neste trabalho, dados moleculares e fenotípicos do projeto ISA-Nutrition 2015 (Fapesp 17/05125-7) são considerados para a caracterização da estrutura de dependência haplotípica do genoma dos brasileiros. Recursos do aplicativo PLINK (https://www.cog-genomics.org/plink2/) são usados para realizar a chamada de haplótipos a partir de dados genotípicos de SNPArray. Como em outras populações mundiais os maiores haplótipos foram encontrados em regiões do cromossomo 6 (mapeados 19.633 haplótipos, em média com 44 SNPs, desvio padrão de 36,33 SNPs); no cromossomo 21 foram encontrados os menores haplótipos (mapeados 4.454, em média com 8 SNPs, desvio padrão de 4,69 SNPs).
- Imprenta:
- Publisher: Universidade Estadual de Londrina
- Publisher place: Londrina
- Date published: 2023
- Source:
- Título do periódico: Livro de Resumos
- Conference titles: Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria - RBras
-
ABNT
SOUZA, Jozimara Teixeira de et al. Caracterização de haplótipos na população brasileira Projeto ISA - Nutrição. 2023, Anais.. Londrina: Universidade Estadual de Londrina, 2023. Disponível em: https://lookerstudio.google.com/reporting/f9228c96-529e-44e6-8f85-373fc3e2539a/page/BYq4C. Acesso em: 27 abr. 2024. -
APA
Souza, J. T. de, Pereira, J. L., Fisberg, R. M., & Soler, J. M. P. (2023). Caracterização de haplótipos na população brasileira Projeto ISA - Nutrição. In Livro de Resumos. Londrina: Universidade Estadual de Londrina. Recuperado de https://lookerstudio.google.com/reporting/f9228c96-529e-44e6-8f85-373fc3e2539a/page/BYq4C -
NLM
Souza JT de, Pereira JL, Fisberg RM, Soler JMP. Caracterização de haplótipos na população brasileira Projeto ISA - Nutrição [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://lookerstudio.google.com/reporting/f9228c96-529e-44e6-8f85-373fc3e2539a/page/BYq4C -
Vancouver
Souza JT de, Pereira JL, Fisberg RM, Soler JMP. Caracterização de haplótipos na população brasileira Projeto ISA - Nutrição [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2024 abr. 27 ] Available from: https://lookerstudio.google.com/reporting/f9228c96-529e-44e6-8f85-373fc3e2539a/page/BYq4C - Porções de alimentos e número de refeições realizadas por adultos e idosos do muncípio de São Paulo: relação com excesso de peso e perfil lipídico
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