Unifying biotic interactions data: terminology, data analysis, standardization, and proposal of a data schema for plant-pollinator interactions (2023)
- Authors:
- Autor USP: SALIM, JOSÉ AUGUSTO - EP
- Unidade: EP
- Sigla do Departamento: PCS
- Subjects: INFORMÁTICA; BIODIVERSIDADE
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: As interações bióticas são essenciais para a biodiversidade, comunidades ecológicas e o funcionamento dos ecossistemas, mas os dados primários encontram-se limitados em termos de acessibilidade e padronização. Com o aumento da disponibilidade de dados de interação biótica, há uma crescente demanda pela documentação adequada dos dados, a fim de aprimorar a agregação, reutilização e interoperabilidade dos dados. Embora a adoção do padrão Darwin Core para dados de biodiversidade seja amplamente difundida, sua aplicação em dados de interações bióticas é limitada devido `a falta de esquemas de dados especializados, vocabulários e diretrizes. Este estudo tem como objetivo desenvolver um modelo de dados utilizando o padrão Darwin Core para compartilhamento de dados de interações bióticas, juntamente com um vocabulário de termos especializado para a padronização de dados de interações planta-polinizador. Inicialmente uma revisão dos conceitos e terminologia utilizados na comunidade de pesquisa foi realizada, destacando os principais elementos de dados que estão alinhados com o conhecimento estado-da-arte na área. Os conjuntos de dados existentes também foram explorados em relação aos formatos, metadados e padronização empregados. A revisão das publicações científicas enfatiza a importância de alinhar a terminologia utilizada pela comunidade, a fim de garantir clareza e consistência na interpretação e análise dos dados de interações bióticas. A revisão dos conjuntos de dados existentes revelou limitações na interoperabilidade e na reutilização dos dados, destacando a necessidade de formatos padronizados e inclusão de metadados. Com base nesses achados, o novo esquema de dados e o vocabulário de termos visam capturar uma representação contextualizada e mais realista dasinterações bióticas. O processo de desenvolvimento adotado enfatiza uma abordagem voltada para a comunidade, priorizando o envolvimento e a contribuição da comunidade. O vocabulário desenvolvido representa um passo significativo em direção à integração de dados e interoperabilidade no campo da Biologia da Polinização. No geral, os resultados contribuem para o avanço na padronização dos dados de interações bióticas.
- Imprenta:
- Data da defesa: 02.10.2023
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ABNT
SALIM, José Augusto. Unifying biotic interactions data: terminology, data analysis, standardization, and proposal of a data schema for plant-pollinator interactions. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/pt-br.php. Acesso em: 01 maio 2024. -
APA
Salim, J. A. (2023). Unifying biotic interactions data: terminology, data analysis, standardization, and proposal of a data schema for plant-pollinator interactions (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/pt-br.php -
NLM
Salim JA. Unifying biotic interactions data: terminology, data analysis, standardization, and proposal of a data schema for plant-pollinator interactions [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/pt-br.php -
Vancouver
Salim JA. Unifying biotic interactions data: terminology, data analysis, standardization, and proposal of a data schema for plant-pollinator interactions [Internet]. 2023 ;[citado 2024 maio 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03012024-110904/pt-br.php - Brazilian Network on Plant-Pollinator Interactions: an update on the initiative of a standard for plant-pollinator interactions data
- Brazilian Plant-Pollinator Interactions Network: definition of a data standard for digitization, sharing, and aggregation of plant-pollinator interaction data
- Monitoring pollinators in Brazil: the challenge of adapting the FIT Count citizen science protocol to the Brazilian context
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