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Artigo de periodico
Computer simulations of deep eutectic solvents: challenges, solutions, and perspectives (2022)
Tolmachev, Dmitry ; Lukasheva, Natalia; Ramazanov, Ruslan; Nazarychev, Victor ; Borzdun, Natalia ; Volgin, Igor ; Andreeva, Maria; Glova, Artyom; Melnikova, Sofia; Dobrovskiy, Alexey; Silber, Steven A; Larin, Sergey ; Souza, Rafael Maglia de ; Ribeiro, Mauro Carlos Costa ; Lyulin, Sergey ; Karttunen, Mikko
Source: International Journal of Molecular Sciences. Unidade: IQ
Subjects: SOLVENTE, MECÂNICA QUÂNTICA, SIMULAÇÃO
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ABNT
TOLMACHEV, Dmitry et al. Computer simulations of deep eutectic solvents: challenges, solutions, and perspectives. International Journal of Molecular Sciences, v. 23, p. 1-68 art. 645, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/ijms23020645. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Tolmachev, D., Lukasheva, N., Ramazanov, R., Nazarychev, V., Borzdun, N., Volgin, I., et al. (2022). Computer simulations of deep eutectic solvents: challenges, solutions, and perspectives. International Journal of Molecular Sciences, 23, 1-68 art. 645. doi:10.3390/ijms23020645
NLM
Tolmachev D, Lukasheva N, Ramazanov R, Nazarychev V, Borzdun N, Volgin I, Andreeva M, Glova A, Melnikova S, Dobrovskiy A, Silber SA, Larin S, Souza RM de, Ribeiro MCC, Lyulin S, Karttunen M. Computer simulations of deep eutectic solvents: challenges, solutions, and perspectives [Internet]. International Journal of Molecular Sciences. 2022 ; 23 1-68 art. 645.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.3390/ijms23020645
Vancouver
Tolmachev D, Lukasheva N, Ramazanov R, Nazarychev V, Borzdun N, Volgin I, Andreeva M, Glova A, Melnikova S, Dobrovskiy A, Silber SA, Larin S, Souza RM de, Ribeiro MCC, Lyulin S, Karttunen M. Computer simulations of deep eutectic solvents: challenges, solutions, and perspectives [Internet]. International Journal of Molecular Sciences. 2022 ; 23 1-68 art. 645.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.3390/ijms23020645
Artigo de periodico
Osmotic method for calculating surface pressure of monolayers in molecular dynamics simulations (2022)
Souza, Rafael Maglia de ; Romeu, Fábio Cavalcante; Ribeiro, Mauro Carlos Costa ; Karttunen, Mikko ; Dias, Luis Gustavo
Source: Journal of Chemical Theory and Computation. Unidades: IQ, FFCLRP
Subjects: ADSORÇÃO, SURFACTANTES, TERMODINÂMICA QUÍMICA
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ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de et al. Osmotic method for calculating surface pressure of monolayers in molecular dynamics simulations. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 18, p. 2042−2046, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00109. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Romeu, F. C., Ribeiro, M. C. C., Karttunen, M., & Dias, L. G. (2022). Osmotic method for calculating surface pressure of monolayers in molecular dynamics simulations. Journal of Chemical Theory and Computation, 18, 2042−2046. doi:10.1021/acs.jctc.2c00109
NLM
Souza RM de, Romeu FC, Ribeiro MCC, Karttunen M, Dias LG. Osmotic method for calculating surface pressure of monolayers in molecular dynamics simulations [Internet]. Journal of Chemical Theory and Computation. 2022 ; 18 2042−2046.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00109
Vancouver
Souza RM de, Romeu FC, Ribeiro MCC, Karttunen M, Dias LG. Osmotic method for calculating surface pressure of monolayers in molecular dynamics simulations [Internet]. Journal of Chemical Theory and Computation. 2022 ; 18 2042−2046.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00109
Artigo de periodico
Molecular dynamics simulation study of the far-Infrared spectrum of a deep eutectic solvent (2022)
Reis, Gabriela Sabença Anversa ; Souza, Rafael Maglia de ; Ribeiro, Mauro Carlos Costa
Source: Journal of Physical Chemistry B. Unidade: IQ
Subjects: INFRAVERMELHO, LÍQUIDOS IÔNICOS, ESTRUTURA MOLECULAR (QUÍMICA TEÓRICA)
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ABNT
REIS, Gabriela Sabença Anversa e SOUZA, Rafael Maglia de e RIBEIRO, Mauro Carlos Costa. Molecular dynamics simulation study of the far-Infrared spectrum of a deep eutectic solvent. Journal of Physical Chemistry B, v. 126, p. 5695-5705, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c03277. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Reis, G. S. A., Souza, R. M. de, & Ribeiro, M. C. C. (2022). Molecular dynamics simulation study of the far-Infrared spectrum of a deep eutectic solvent. Journal of Physical Chemistry B, 126, 5695-5705. doi:10.1021/acs.jpcb.2c03277
NLM
Reis GSA, Souza RM de, Ribeiro MCC. Molecular dynamics simulation study of the far-Infrared spectrum of a deep eutectic solvent [Internet]. Journal of Physical Chemistry B. 2022 ; 126 5695-5705.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c03277
Vancouver
Reis GSA, Souza RM de, Ribeiro MCC. Molecular dynamics simulation study of the far-Infrared spectrum of a deep eutectic solvent [Internet]. Journal of Physical Chemistry B. 2022 ; 126 5695-5705.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c03277
Artigo de periodico
Fine tuning the polarizable CL&Pol force field for the deep eutectic solvent ethaline (2021)
Souza, Rafael Maglia de ; Karttunen, Mikko ; Ribeiro, Mauro Carlos Costa
Source: Journal of Chemical Information Modeling. Unidade: IQ
Subjects: SOLVENTE, LÍQUIDOS IÔNICOS
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ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de e KARTTUNEN, Mikko e RIBEIRO, Mauro Carlos Costa. Fine tuning the polarizable CL&Pol force field for the deep eutectic solvent ethaline. Journal of Chemical Information Modeling, v. 61, p. 5938−5947, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c01181. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Karttunen, M., & Ribeiro, M. C. C. (2021). Fine tuning the polarizable CL&Pol force field for the deep eutectic solvent ethaline. Journal of Chemical Information Modeling, 61, 5938−5947. doi:10.1021/acs.jcim.1c01181
NLM
Souza RM de, Karttunen M, Ribeiro MCC. Fine tuning the polarizable CL&Pol force field for the deep eutectic solvent ethaline [Internet]. Journal of Chemical Information Modeling. 2021 ; 61 5938−5947.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c01181
Vancouver
Souza RM de, Karttunen M, Ribeiro MCC. Fine tuning the polarizable CL&Pol force field for the deep eutectic solvent ethaline [Internet]. Journal of Chemical Information Modeling. 2021 ; 61 5938−5947.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c01181
Artigo de periodico
Development of coarse-grained force field to investigate sodium-ion transport mechanisms in cyanoborate-based ionic liquid (2021)
Souza, Rafael Maglia de ; Lourenço, Tuanan da Costa ; Siqueira, Leonardo José Amaral de; Karttunen, Mikko; Silva, Juarez Lopes Ferreira da ; Dias, Luis Gustavo
Source: Journal of Molecular Liquids. Unidades: IQSC, FFCLRP
Subjects: ELETRÓLITOS, LÍQUIDOS IÔNICOS
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ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de et al. Development of coarse-grained force field to investigate sodium-ion transport mechanisms in cyanoborate-based ionic liquid. Journal of Molecular Liquids, v. 338, p. 116648, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2021.116648. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Lourenço, T. da C., Siqueira, L. J. A. de, Karttunen, M., Silva, J. L. F. da, & Dias, L. G. (2021). Development of coarse-grained force field to investigate sodium-ion transport mechanisms in cyanoborate-based ionic liquid. Journal of Molecular Liquids, 338, 116648. doi:10.1016/j.molliq.2021.116648
NLM
Souza RM de, Lourenço T da C, Siqueira LJA de, Karttunen M, Silva JLF da, Dias LG. Development of coarse-grained force field to investigate sodium-ion transport mechanisms in cyanoborate-based ionic liquid [Internet]. Journal of Molecular Liquids. 2021 ; 338 116648.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2021.116648
Vancouver
Souza RM de, Lourenço T da C, Siqueira LJA de, Karttunen M, Silva JLF da, Dias LG. Development of coarse-grained force field to investigate sodium-ion transport mechanisms in cyanoborate-based ionic liquid [Internet]. Journal of Molecular Liquids. 2021 ; 338 116648.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.molliq.2021.116648
Tese (Doutorado)
Dinâmica molecular fine-grained e coarse-grained de líquidos iônicos e sistemas de matéria macia (2020)
Souza, Rafael Maglia de ; Dias, Luis Gustavo (Orientador)
Unidade: FFCLRP
Subjects: LÍQUIDOS IÔNICOS, ÁTOMOS, ELETRÓLITOS, MODELAGEM MOLECULAR, ELETROSTÁTICA, FONTES RENOVÁVEIS DE ENERGIA, BATERIAS ELÉTRICAS
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ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de. Dinâmica molecular fine-grained e coarse-grained de líquidos iônicos e sistemas de matéria macia. 2020. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2020. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-09022021-152203/. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de. (2020). Dinâmica molecular fine-grained e coarse-grained de líquidos iônicos e sistemas de matéria macia (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-09022021-152203/
NLM
Souza RM de. Dinâmica molecular fine-grained e coarse-grained de líquidos iônicos e sistemas de matéria macia [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-09022021-152203/
Vancouver
Souza RM de. Dinâmica molecular fine-grained e coarse-grained de líquidos iônicos e sistemas de matéria macia [Internet]. 2020 ;[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59138/tde-09022021-152203/
Artigo de periodico
Molecular dynamics simulations of polymer–ionic liquid (1-ethyl-3-methylimidazolium tetracyanoborate) ternary electrolyte for sodium and potassium ion batteries (2020)
Souza, Rafael Maglia de ; Siqueira, Leonardo José Amaral de; Karttunen, Mikko; Dias, Luis Gustavo
Source: Journal of Chemical Information and Modeling. Unidade: FFCLRP
Subjects: BATERIAS ELÉTRICAS, ENERGIA ELÉTRICA, SÓDIO, POTÁSSIO, ELETROQUÍMICA, SOLUÇÕES ELETROLÍTICAS
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ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de et al. Molecular dynamics simulations of polymer–ionic liquid (1-ethyl-3-methylimidazolium tetracyanoborate) ternary electrolyte for sodium and potassium ion batteries. Journal of Chemical Information and Modeling, v. 60, n. 2, p. 485-499, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00750. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Siqueira, L. J. A. de, Karttunen, M., & Dias, L. G. (2020). Molecular dynamics simulations of polymer–ionic liquid (1-ethyl-3-methylimidazolium tetracyanoborate) ternary electrolyte for sodium and potassium ion batteries. Journal of Chemical Information and Modeling, 60( 2), 485-499. doi:10.1021/acs.jcim.9b00750
NLM
Souza RM de, Siqueira LJA de, Karttunen M, Dias LG. Molecular dynamics simulations of polymer–ionic liquid (1-ethyl-3-methylimidazolium tetracyanoborate) ternary electrolyte for sodium and potassium ion batteries [Internet]. Journal of Chemical Information and Modeling. 2020 ; 60( 2): 485-499.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00750
Vancouver
Souza RM de, Siqueira LJA de, Karttunen M, Dias LG. Molecular dynamics simulations of polymer–ionic liquid (1-ethyl-3-methylimidazolium tetracyanoborate) ternary electrolyte for sodium and potassium ion batteries [Internet]. Journal of Chemical Information and Modeling. 2020 ; 60( 2): 485-499.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00750
Artigo de periodico
Self-assembly of phosphocholine derivatives using the ELBA coarse-grained model: micelles, bicelles, and reverse micelles (2020)
Souza, Rafael Maglia de ; Ratochinski, Rafael Henrique; Karttunen, Mikko; Dias, Luis Gustavo
Source: Journal of Chemical Information and Modeling. Unidade: FFCLRP
Subjects: LIPÍDEOS, ELETROSTÁTICA, MOLÉCULA, QUÍMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de et al. Self-assembly of phosphocholine derivatives using the ELBA coarse-grained model: micelles, bicelles, and reverse micelles. Journal of Chemical Information and Modeling, v. 60, n. 2, p. 522-536, 2020Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00790. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Ratochinski, R. H., Karttunen, M., & Dias, L. G. (2020). Self-assembly of phosphocholine derivatives using the ELBA coarse-grained model: micelles, bicelles, and reverse micelles. Journal of Chemical Information and Modeling, 60( 2), 522-536. doi:10.1021/acs.jcim.9b00790
NLM
Souza RM de, Ratochinski RH, Karttunen M, Dias LG. Self-assembly of phosphocholine derivatives using the ELBA coarse-grained model: micelles, bicelles, and reverse micelles [Internet]. Journal of Chemical Information and Modeling. 2020 ; 60( 2): 522-536.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00790
Vancouver
Souza RM de, Ratochinski RH, Karttunen M, Dias LG. Self-assembly of phosphocholine derivatives using the ELBA coarse-grained model: micelles, bicelles, and reverse micelles [Internet]. Journal of Chemical Information and Modeling. 2020 ; 60( 2): 522-536.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00790
Trabalho de evento-resumo
Simulação computacional de micelas reversas via campo de força coarse-grained ELBA (2019)
Ratochinski, Rafael Henrique; Souza, Rafael Maglia de ; Dias, Luís Gustavo
Source: Resumos. Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP (SIICUSP). Unidade: FFCLRP
Subjects: SIMULAÇÃO, MOLÉCULA, COMPOSTOS ORGÂNICOS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
RATOCHINSKI, Rafael Henrique e SOUZA, Rafael Maglia de e DIAS, Luís Gustavo. Simulação computacional de micelas reversas via campo de força coarse-grained ELBA. 2019, Anais.. Ribeirão Preto: FFCLRP-USP, 2019. Disponível em: https://uspdigital.usp.br/siicusp/siicPublicacao.jsp?codmnu=7210. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Ratochinski, R. H., Souza, R. M. de, & Dias, L. G. (2019). Simulação computacional de micelas reversas via campo de força coarse-grained ELBA. In Resumos. Ribeirão Preto: FFCLRP-USP. Recuperado de https://uspdigital.usp.br/siicusp/siicPublicacao.jsp?codmnu=7210
NLM
Ratochinski RH, Souza RM de, Dias LG. Simulação computacional de micelas reversas via campo de força coarse-grained ELBA [Internet]. Resumos. 2019 ;[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://uspdigital.usp.br/siicusp/siicPublicacao.jsp?codmnu=7210
Vancouver
Ratochinski RH, Souza RM de, Dias LG. Simulação computacional de micelas reversas via campo de força coarse-grained ELBA [Internet]. Resumos. 2019 ;[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://uspdigital.usp.br/siicusp/siicPublicacao.jsp?codmnu=7210
Artigo de periodico
Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation (2017)
Souza, Rafael Maglia de ; Siani, Paulo; Schmidt, T. F.; Itri, Rosangela ; Dias, Luis Gustavo
Source: The Journal of Physical Chemistry B. Unidades: IF, FFCLRP
Subjects: AZUL DE METILENO, QUÍMICA, FÍSICA, OXIDAÇÃO
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SOUZA, Rafael Maglia de et al. Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation. The Journal of Physical Chemistry B, v. 121, n. 36, p. 8512-8522, 2017Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b04824. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Souza, R. M. de, Siani, P., Schmidt, T. F., Itri, R., & Dias, L. G. (2017). Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation. The Journal of Physical Chemistry B, 121( 36), 8512-8522. doi:10.1021/acs.jpcb.7b04824
NLM
Souza RM de, Siani P, Schmidt TF, Itri R, Dias LG. Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation [Internet]. The Journal of Physical Chemistry B. 2017 ; 121( 36): 8512-8522.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b04824
Vancouver
Souza RM de, Siani P, Schmidt TF, Itri R, Dias LG. Methylene blue location in (hydroperoxized) cardiolipin monolayer: implication in membrane photodegradation [Internet]. The Journal of Physical Chemistry B. 2017 ; 121( 36): 8512-8522.[citado 2024 maio 29 ] Available from: https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b04824
Artigo de periodico
An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations (2016)
Siani, Paulo; Souza, Rafael Maglia de; Khandelia, H.; Itri, Rosângela; Dias, Luís Gustavo
Source: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. Unidades: IF, FFCLRP
Subjects: ESPECTROSCOPIA, ELETROSTÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SIANI, Paulo et al. An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, v. 1858, n. 10, p. 2498-2511, 2016Tradução . . Disponível em: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0005273616301171. Acesso em: 29 maio 2024.
APA
Siani, P., Souza, R. M. de, Khandelia, H., Itri, R., & Dias, L. G. (2016). An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1858( 10), 2498-2511. doi:10.1016/j.bbamem.2016.03.031
NLM
Siani P, Souza RM de, Khandelia H, Itri R, Dias LG. An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations [Internet]. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. 2016 ; 1858( 10): 2498-2511.[citado 2024 maio 29 ] Available from: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0005273616301171
Vancouver
Siani P, Souza RM de, Khandelia H, Itri R, Dias LG. An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations [Internet]. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. 2016 ; 1858( 10): 2498-2511.[citado 2024 maio 29 ] Available from: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0005273616301171

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