Artigo de periodico

Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes (2001)

• Authors:
  • Figueiredo, R. C.
  • Brito, M. S.
  • Figueiredo, L. H. M.
  • Quiapin, A. C.
  • Vitorelli, P. M.
  • Silva, L. R.
  • Santos, R. V. - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
  • Molfetta, J. B.
  • Goldman, Gustavo Henrique
  • Goldman, Maria Helena de Souza
• USP affiliated authors: GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE - FCFRP ; GOLDMAN, MARIA HELENA DE SOUZA - FFCLRP
• Unidades: FCFRP; FFCLRP
• DOI: 10.1590/s1415-47572001000100012
• Assunto: CANA-DE-AÇÚCAR (GENÉTICA)
• Language: Inglês
• Abstract: Existem quase 260.000 clones independentes, seqüenciados a partir da extremidade 5’, no banco de dados do SUCEST (Sugarcane Expressed Sequence Tag), os quais foram obtidos a partir de 37 bibliotecas de cDNA preparadas de diferentes tecidos. Este grande número de etiquetas de sequências expressas (ESTs) fornece uma oportunidade, sem precedentes em plantas, de realizar um ‘digital differential screening’ em bibliotecas de cDNA selecionadas. Geralmente, a frequência de um determinado EST está correlacionada ao acúmulo de transcritos nos tecidos dos quais as bibliotecas de cDNA foram construídas, e desta forma, é possível comparar o transcriptoma completo de diferentes tecidos, usando uma análise computacional de um banco de dados de ESTs. Em nossa pesquisa, analisamos os ESTs de cana-de-açúcar de acordo com sua expressão tecidual e identificamos mais de 1.000 putativos genes específicos de flor. O fato de que usando esta técnica fomos capazes de identificar homológos em cana-de-açúcar, de vários genes previamente descritos como específicos de pólen, sustenta este método de estimar especificidade tecidual. Além disto, ESTs com similaridade a genes específicos de órgãos reprodutivos foram revelados, como por exemplo, o gene que codifica uma proteína meiótica essencial para a montagem do complexo sinaptonêmico e sinapse normal. Esta abordagem também permitiu a identificação de muitas sequências anônimas, específicas de flor, que são boas candidatas para novosgenes envolvidos com a reprodução de plantas. Este trabalho descreve a análise dos níveis de expressão gênica de 24 clusters de ESTs, durante o desenvolvimento floral, usando um ‘northern blot digital’ construído a partir da contagem direta dos ESTs das bibliotecas não-normalizadas de cDNAs de cana-de-açúcar
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2001
• Source:
  • Título do periódico: Genetics and Molecular Biology
  • ISSN: 1415-4757
  • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 24, n. 1-4, p. 77-84, 2001

Informações sobre o DOI: 10.1590/s1415-47572001000100012 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by

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How to cite

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• ABNT

  FIGUEIREDO, R. C. et al. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes. Genetics and Molecular Biology, v. 24, n. 1-4, p. 77-84, 2001Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012. Acesso em: 23 abr. 2024.

• APA

  Figueiredo, R. C., Brito, M. S., Figueiredo, L. H. M., Quiapin, A. C., Vitorelli, P. M., Silva, L. R., et al. (2001). Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes. Genetics and Molecular Biology, 24( 1-4), 77-84. doi:10.1590/s1415-47572001000100012

• NLM

  Figueiredo RC, Brito MS, Figueiredo LHM, Quiapin AC, Vitorelli PM, Silva LR, Santos RV, Molfetta JB, Goldman GH, Goldman MH de S. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes [Internet]. Genetics and Molecular Biology. 2001 ; 24( 1-4): 77-84.[citado 2024 abr. 23 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012

• Vancouver

  Figueiredo RC, Brito MS, Figueiredo LHM, Quiapin AC, Vitorelli PM, Silva LR, Santos RV, Molfetta JB, Goldman GH, Goldman MH de S. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes [Internet]. Genetics and Molecular Biology. 2001 ; 24( 1-4): 77-84.[citado 2024 abr. 23 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012

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