Pesquisa de sítios de restrição enzimática em segmento da ORF K1 do genoma de herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) em isolados Clínicos de São Paulo: relação com subtipos virais e implantação da técnica de RFLP (Restiction Fragment Length Polymorphism Analyses) para determinar subtipos virais (2003)
- Autores:
- Autor USP: MOREIRA, ABDIEL APARECIDO - FCF
- Unidade: FCF
- Sigla do Departamento: FBC
- Assuntos: HERPESVIRIDAE (ESTUDO CLÍNICO); GENOMAS (ESTUDO CLÍNICO); EPIDEMIOLOGIA (TÉCNICAS MOLECULARES)
- Idioma: Português
- Resumo: A epidemia da Sindrome de Imunodeficiencia Adquirida (AIDS) fez aumentar a incidência de sarcoma de Kaposi (SK) em todos os países e o SK passou a ser considerado doença definidora de AIDS. Desde a descoberta de seu agente etiológico, o herpesvirus humano tipo 8 (HHV-8), vários estudos vem sendo realizados com o objetivo de caracterizar subtipos virais presentes em todas as formas de SK: clássica, endêmica, iatrogênica e epidêmica. Os sistemas rotineiramente usados na subtipagem do HHV-8 têm usado o seqüenciamento de um gene que contem regiões hipervariáveis e que codifica uma glicoproteína de membrana viral (ORF K1). O presente trabalho apresenta um sistema de subtipagem alternativo que se baseia na presença de sítios de restrição enzimática em um pequeno segmento do gene ORF Kl, região hipervariável 1 (VR1) e que permite discriminar subtipos virais. A análise de 68 seqüências; 50 que pertenciam a 36 pacientes com sarcoma de Kaposi infectados e não infectados pelo HIV-1 de São Paulo e 18 a prototipos dos subtipos A a E, mostraram mapas de restrição enzimática característicos dos principais subtipos virais descritos até o momento. Tomando como base apenas as enzimas disponíveis comercialmente, foram selecionadas cinco que se mostraram úteis para a subtipagem de HHV-8: Taq I, Nsi I, Hinf I, Hae III e Mse 1. Os resultados obtidos com a técnica de PCR-RFLP (reação em cadeia de polimerase associada a análise do polimorfismo de fragmentos derestrição enzimática) mostraram que de 48 espécimes brasileiros previamente classificados como sendo dos subtipos A, B e C por seqüenciamento gênico, todos foram corretamente subtipados pela técnica de PCR-RFLFI. Três amostras (duas do subtipo A e uma do B) apresentaram mais um sítio de restrição enzimática além dos descritos como sendo os predominantes. Mais recentemente, outras 27 amostras de 18 casos de infecção (continuação) HHV- 8 foram subtipadas pela PCR-RFLP. Houve detecção de oito isolados do subtipo A, sendo seis da variante predominante, um de variante minoritária conhecida e um de nova variante viral. Dois casos de infecção HHV-8 do subtipo B e sete do subtipo C também foram identificados. Finalmente, um provável caso de infecção pelo subtipo E foi encontrado em paciente com SK- AIDS disseminado, resistente a quimioterapia. Na avaliação global, houve maior número de casos de infecção HHV-8 pelos subtipos A. e C. Concluindo, devido a alta sensibilidade e especificidade, baixo custo, rapidez e facilidade de execução, a técnica de PCR-RFLP pode ser usada em larga escala para estudos de epidemiologia molecular, principalmente em países em desenvolvimento
- Imprenta:
- Data da defesa: 22.08.2003
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ABNT
MOREIRA, Abdiel Aparecido. Pesquisa de sítios de restrição enzimática em segmento da ORF K1 do genoma de herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) em isolados Clínicos de São Paulo: relação com subtipos virais e implantação da técnica de RFLP (Restiction Fragment Length Polymorphism Analyses) para determinar subtipos virais. 2003. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2003. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-01102004-164856/. Acesso em: 16 abr. 2024. -
APA
Moreira, A. A. (2003). Pesquisa de sítios de restrição enzimática em segmento da ORF K1 do genoma de herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) em isolados Clínicos de São Paulo: relação com subtipos virais e implantação da técnica de RFLP (Restiction Fragment Length Polymorphism Analyses) para determinar subtipos virais (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-01102004-164856/ -
NLM
Moreira AA. Pesquisa de sítios de restrição enzimática em segmento da ORF K1 do genoma de herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) em isolados Clínicos de São Paulo: relação com subtipos virais e implantação da técnica de RFLP (Restiction Fragment Length Polymorphism Analyses) para determinar subtipos virais [Internet]. 2003 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-01102004-164856/ -
Vancouver
Moreira AA. Pesquisa de sítios de restrição enzimática em segmento da ORF K1 do genoma de herpesvírus humano tipo 8 (HHV-8) em isolados Clínicos de São Paulo: relação com subtipos virais e implantação da técnica de RFLP (Restiction Fragment Length Polymorphism Analyses) para determinar subtipos virais [Internet]. 2003 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9136/tde-01102004-164856/
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