Análise da expressão de genes relacionados à interação incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum (2011)
- Authors:
- Autor USP: BORGES, ALINE - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: ANTRACNOSE; EXPRESSÃO GÊNICA; FEIJÃO; REAÇÃO EM CADEIA POR POLIMERASE
- Language: Português
- Abstract: A cultura do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) se destaca como fonte protéica e mineral para as populações humanas, principalmente, para populações de baixa renda. Dentre os agentes patogênicos, o fungo Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magnus) Lams. Scrib., causador da antracnose, é considerado o de maior importância devido aos seus efeitos destrutivos para o feijoeiro. Este estudo teve como objetivo avaliar a expressão de genes candidatos a atuarem na defesa da planta durante a interação incompatível do feijoeiro SEL 1308 e raça 73 do C. lindemuthianum, considerando diferentes tecidos (folhas, epicótilo e hipocótilo) e períodos de interação (24, 48, 72 e 96 horas). Além disso, o trabalho visou a validação de bibliotecas de ESTs (Expressed Sequence Tags) de feijoeiro (MELOTTO et al., 2005) e a análise da estabilidade de possíveis genes de referência para as análises de expressão por RT-qPCR. Foram utilizados 20 genes no estudo: 12 possivelmente responsivos ao patógeno e oito candidatos a genes de referência. A eficiência média das curvas de amplificação e valores dos ciclos e de quantificação (Cq) foram definidos no programa LinRegPCR. A estabilidade dos genes de referência foi avaliada nos programas geNorm e NormFinder. A expressão relativa dos genes alvos e normalizadores e as análises estatísticas foram determinadas no programa REST. As combinações de genes de referência Act2/Ukn2 e InsDeg/Act2 foram utilizadas para normalização dos genes-alvo por RT-qPCR. Os dados de expressão relativa dos transcritos entre as bibliotecas de ESTs foram validados pelo RT-qPCR. OsOs genes-alvo analisados foram todos responsivos ao sistema fitopatogênico avaliado, revelando perfil transcricional específico nos tecidos e período de interação com o patógeno. Os dados permitiram a disponibilização de genes de referência importantes para análise de expressão por RTqPCR em feijoeiro sob estresse biótico; e indícios para melhor entendimento dos processos envolvidos nos mecanismos de defesa do feijoeiro ao patógeno da antracnose
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2011
- Data da defesa: 25.07.2011
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ABNT
BORGES, Aline. Análise da expressão de genes relacionados à interação incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum. 2011. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2011. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-09022012-100212/. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Borges, A. (2011). Análise da expressão de genes relacionados à interação incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-09022012-100212/ -
NLM
Borges A. Análise da expressão de genes relacionados à interação incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum [Internet]. 2011 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-09022012-100212/ -
Vancouver
Borges A. Análise da expressão de genes relacionados à interação incompatível Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum [Internet]. 2011 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-09022012-100212/
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