Sequência ESTS de câncer humano: contribuição do laboratório de sequenciamento QV3 no projeto genoma humano do câncer Ludwig/FAPESP (2001)
- Authors:
- Autor USP: KIMURA, EDNA TERUKO - ICB
- Unidade: ICB
- Assunto: HISTOLOGIA
- Language: Português
- Abstract: Objetivos: O Projeto Genoma Humano do Câncer (PGHC) FAPESP/Ludwig visa à identificação de genes expressos em câncer, um passo fundamental na compreensão do processo de tumorigênese. O PGHC tem como meta seqüenciar 1 milhão de ESTs de câncer de maior incidência no cenário nacional, e o nosso laboratório - QV3 contribuir com cerca de 40.000 seqüências gênicas. Métodos e Resultados: A metodologia ORESTES (Open Reading frame ESTs), adotada para gerar cDNA, permite a obtenção preferencial de regiões centrais do gene potencialmente codificadoras do genoma humano. A partir do cDNA gerado realiza-se clonagem, amplificação das bibliotecas, PCR das colônias e seqüenciamento dos genes assim como a submissão destes resultados ao centro de Bioinformática do Projeto. Em nosso laboratório foram obtidas 42.000 seqüências até o momento de cDNAs, na grande maioria, provenientes de tecidos de tumor de cabeça e pescoço, pulmão tumoral e normal, cólon intestinal, mama tumoral e normal. A análise destes ESTs mostrou que 26,4% correspondem a seqüências novas sem correspondência nos bancos de dados de genoma humano (GeneBank) e não humanos; genes humanos conhecidos correspondem a 18,2%, 21,2% à Contings Unigene, 9,0% a ESTs não humanos e 0,9% codificam proteínas não humanas. Cerca de 6,0% correspondem a regiões do DNA repetitivo, 6,0 % a genes mitocondriais e 5,4% a DNA de bactérias. Conclusão: A geração de 42.000 seqüências expressas em nosso laboratório, mostrou que cerca de11.000 seqüências geradas são ESTs de genes desconhecidos e estão em análise no Projeto Trasncriptoma para caracterização do gene completo. Até o momento cerca de 24.000 ESTs gerados em nosso laboratório estão depositados no GeneBank, os quais podem ser acessados com a palavra-chave QV3 no site http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez pela comunidade científica
- Imprenta:
- Publisher: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP
- Publisher place: São Paulo
- Date published: 2001
- Source:
- Título do periódico: Resumos
- Conference titles: Congresso do Instituto de Ciências Biomédicas
-
ABNT
MARTINS, L et al. Sequência ESTS de câncer humano: contribuição do laboratório de sequenciamento QV3 no projeto genoma humano do câncer Ludwig/FAPESP. 2001, Anais.. São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP, 2001. . Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Martins, L., Cardoso, A. F., Cardoso, A. F., Vieira, R. B., Benedette, J. P. T., & Kimura, E. T. (2001). Sequência ESTS de câncer humano: contribuição do laboratório de sequenciamento QV3 no projeto genoma humano do câncer Ludwig/FAPESP. In Resumos. São Paulo: Comissão de Cultura e Extensão Universitária do ICB/USP. -
NLM
Martins L, Cardoso AF, Cardoso AF, Vieira RB, Benedette JPT, Kimura ET. Sequência ESTS de câncer humano: contribuição do laboratório de sequenciamento QV3 no projeto genoma humano do câncer Ludwig/FAPESP. Resumos. 2001 ;[citado 2024 abr. 23 ] -
Vancouver
Martins L, Cardoso AF, Cardoso AF, Vieira RB, Benedette JPT, Kimura ET. Sequência ESTS de câncer humano: contribuição do laboratório de sequenciamento QV3 no projeto genoma humano do câncer Ludwig/FAPESP. Resumos. 2001 ;[citado 2024 abr. 23 ] - Mutação de BRAF em câncer de tiróide
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