Tese

Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus (2002)

• Authors:
  • Jorge, Erika Cristina
  • Coutinho, Luiz Lehmann (Orientador)
• Autor USP: JORGE, ERIKA CRISTINA - ESALQ
• Unidade: ESALQ
• Sigla do Departamento: LZT
• Assunto: BIOLOGIA ANIMAL
• Language: Português
• Abstract: O desenvolvimento embrionário requer um rigoroso controle da expressão de inúmeros genes que devem ser ativados no momento e local apropriados para o correto estabelecimento das estruturas e órgãos do organismo. Com a análise das seqüências expressas (Expressed Sequence Tags, EST) é possível identificar os genes expressos em tecidos específicos em diferentes estádios do desenvolvimento. A fim de identificar genes expressos durante o desenvolvimento embrionário de Gallus gallus, EST foram obtidas a partir da extremidade 5' dos clones de três bibliotecas de cDNA construídas a partir de (1) embrião inteiro, (2) membros anteriores e posteriores e (3) somitos e tubo neural. As EST foram analisadas pelos programas Phred, Cap3 e Consed para avaliação de qualidade das bases e clusterização. A análise dos dados resultou em 4998 EST válidas segundo parâmetros estabelecidos para este estudo. Todas as seqüências consenso dos clusters e singletons foram comparadas com as seqüências disponíveis no GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) e classificadas em doze categorias segundo sua função. A categorização revelou que 25% dos genes não apresentaram homólogos no banco utilizado (Low e No hit). Aproximadamente 15% dos genes não apresentaram função definida (hipotéticos conservados). Os 60% restantes permitiram identificar genes envolvidos com a somitogênese, com a formação da musculatura esquelética e com a formação dos brotos de membros em vertebrados, além degenes de manutenção e estrutura celular. O conjunto das EST identificadas neste projeto possibilitou a construção de um banco com cerca de 5.000 EST de estádios embrionários de Gallus gallus, fonte para a identificação de novos genes, para a elucidação dos processos reguladores do desenvolvimento embrionário e para a identificação de SNPs (Single Nucleotide Polymorphism)
• Imprenta:
  • Publisher place: Piracicaba
  • Date published: 2002
• Data da defesa: 06.12.2002


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How to cite

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• ABNT

  JORGE, Erika Cristina. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus. 2002. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2002. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/. Acesso em: 23 abr. 2024.

• APA

  Jorge, E. C. (2002). Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/

• NLM

  Jorge EC. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus [Internet]. 2002 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/

• Vancouver

  Jorge EC. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus [Internet]. 2002 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/

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