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Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus (2002)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: JORGE, ERIKA CRISTINA - ESALQ
  • USP Schools: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LZT
  • Subjects: BIOLOGIA ANIMAL
  • Language: Português
  • Abstract: O desenvolvimento embrionário requer um rigoroso controle da expressão de inúmeros genes que devem ser ativados no momento e local apropriados para o correto estabelecimento das estruturas e órgãos do organismo. Com a análise das seqüências expressas (Expressed Sequence Tags, EST) é possível identificar os genes expressos em tecidos específicos em diferentes estádios do desenvolvimento. A fim de identificar genes expressos durante o desenvolvimento embrionário de Gallus gallus, EST foram obtidas a partir da extremidade 5' dos clones de três bibliotecas de cDNA construídas a partir de (1) embrião inteiro, (2) membros anteriores e posteriores e (3) somitos e tubo neural. As EST foram analisadas pelos programas Phred, Cap3 e Consed para avaliação de qualidade das bases e clusterização. A análise dos dados resultou em 4998 EST válidas segundo parâmetros estabelecidos para este estudo. Todas as seqüências consenso dos clusters e singletons foram comparadas com as seqüências disponíveis no GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) e classificadas em doze categorias segundo sua função. A categorização revelou que 25% dos genes não apresentaram homólogos no banco utilizado (Low e No hit). Aproximadamente 15% dos genes não apresentaram função definida (hipotéticos conservados). Os 60% restantes permitiram identificar genes envolvidos com a somitogênese, com a formação da musculatura esquelética e com a formação dos brotos de membros em vertebrados, além degenes de manutenção e estrutura celular. O conjunto das EST identificadas neste projeto possibilitou a construção de um banco com cerca de 5.000 EST de estádios embrionários de Gallus gallus, fonte para a identificação de novos genes, para a elucidação dos processos reguladores do desenvolvimento embrionário e para a identificação de SNPs (Single Nucleotide Polymorphism)
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 06.12.2002
  • Acesso online ao documento

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    Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    ESABC10500035002t636.5 J82i ex.2 80573
    How to cite
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    • ABNT

      JORGE, Erika Cristina; COUTINHO, Luiz Lehmann. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus. 2002.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2002. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/ >.
    • APA

      Jorge, E. C., & Coutinho, L. L. (2002). Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/
    • NLM

      Jorge EC, Coutinho LL. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus [Internet]. 2002 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/
    • Vancouver

      Jorge EC, Coutinho LL. Identificação de sequências expressas (EST) em embriões de Gallus gallus [Internet]. 2002 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-06022003-150751/