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Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogêneos para aplicações de biologia molecular (2003)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: NANBA, ELCIO YUKIO - EP
  • USP Schools: EP
  • Sigla do Departamento: PSI
  • Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; REDES DE COMPUTADORES
  • Language: Português
  • Abstract: Um ambiente computacional voltado à pesquisa em biologia molecular normalmente é composto por um número de máquinas servidoras de alto desempenho que normalmente são interconectadas formando um "cluster". Os programas executados neste "cluster", de uma forma geral, necessitam analisar enormes bancos de dados de seqüências genômicas, despendido para isto, considerável tempo de processamento e espaço físico em memória. O escalonamento de tarefas para os servidores que compõem este "cluster" torna-se então fator preponderante para que os processos sejam executados de forma mais eficiente. O objetivo deste trabalho de pesquisa é prover uma alternativa para um sistema de escalonamento de aplicações da área de biologia molecular em um "cluster" de servidores, de forma a aproveitar melhor os recursos pertencentes ao mesmo e obter uma melhor performance. A pesquisa é dirigida a um cluster conhecido, composto de máquinas SMP onde serão executados programas específicos da área de biologia molecular como o BLAST[1]. Consideramos tais programas como atômicos, no sentido de que não estamos interessados em alterar o código dos mesmos a fim de paralelizar sua execução entre os servidores. A estratégia derivada baseia-se no estudo simulado de casos reais (projetos) desenvolvidos hoje no BioInfo do IME-USP[2].
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 31.03.2003

  • How to cite
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    • ABNT

      NANBA, Elcio Yukio; KOFUJI, Sergio Takeo. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogêneos para aplicações de biologia molecular. 2003.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2003.
    • APA

      Nanba, E. Y., & Kofuji, S. T. (2003). Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogêneos para aplicações de biologia molecular. Universidade de São Paulo, São Paulo.
    • NLM

      Nanba EY, Kofuji ST. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogêneos para aplicações de biologia molecular. 2003 ;
    • Vancouver

      Nanba EY, Kofuji ST. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogêneos para aplicações de biologia molecular. 2003 ;

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