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Mapeamento de marcadores moleculares AFLP em população derivada de clones elite de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e suas associações com caracteres agronômicos (2003)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: KIDO, EDERSON AKIO - CENA
  • USP Schools: CENA
  • Subjects: GENÉTICA MOLECULAR VEGETAL
  • Language: Português
  • Abstract: No Brasil, o complexo sucroalcooleiro é parte importante da economia nacional. A competitividade do setor envolve o desenvolvimento de variedades de cana-de-açúcar mais adequadas pelo melhoramento genético. Mapas genéticos, baseados em materiais do melhoramento, disponibilizariam marcadores moleculares mais prontamente. Com este intuito, a partir dos clones elites 'SP80-180' e 'SP80-4966' (Saccharum spp), do programa de melhoramento da COPERSUCAR, foram obtidos 500 híbridos. Destes, 100 foram genotipados com 23 combinações de primers AFLP que amplificaram 1770 marcadores, sendo 304 polimorfismos entre os genitores. Marcadores em dose simples foram identificados com Testes x2 (a = 0,01) sob duas estratégias, com ou sem a Correção de Bonferroni. Segregações na progênie, quanto à presença e ausência do marcador, foram testadas em relação à hipótese nula de segregação 1:1, esperada para marcadores em dose simples quando os genitores apresentam polimorfismos. Para marcadores não polimórficos, as segregações na progênie foram testadas em relação à hipótese nula de segregação 3:1, esperada para genitores portadores de alelo em dose simples. Segregações esperadas de genitores octaplóides, com pareamento cromossômico ao acaso (polissomia) e formação exclusiva de bivalentes, sem ocorrência de dupla redução, distorção de seleção ou seleção gamética foram propostas com o intuito de auxiliar na separação de marcadores em dose simples, em abordagem denominada 'estratégiacombinada'. Mapas genéticos dos genitores foram gerados a partir de marcadores em dose simples com segregação 1:1 e 3:1 identificados sob as duas abordagens, com auxílio do programa JoinMap 3.0. Grupos de co-segregação (GC) foram formados com LOD mínimo de 4,0, e o ordenamento dos locos, com LOD mínimo de 3.0 e fração máxima de recombinação de 0,40. A função de mapeamento utilizada foi de Kosambi. (continua...) ) Os mapas resultantes foram comparados e aqueles gerados a partir da 'estratégia combinada' foram utilizados em detecção preliminar de alelos controladores de caracteres quantitativos (QTAs). Para 'SP80-180', 162 locos em dose simples foram mapeados em 62 GCs, compreendendo 1330 cM, com distância média entre locos de 8,2 cM. Para SP80-4966, 190 locos em dose simples foram mapeados em 72 GCs, totalizando 1595 cM, com distância média entre locos de 8,4 cM. A presenqa de locos em fase de ligação em repulsão nos mapas genética dos genitores indicou que a polissomia não foi total, com certo pareamento preferencial de cromossomos homólogos. Detecções de QTAs foram feitas em análises de marcas individuais (ANAVA e análise de regressão linear) com associações significativas (p < 0,005) de marcadores AFLP com altura de colmo, diâmetro de colmo, número de perfilhos, brix (% no caldo), fibras (%), POL% na cana (PCC) e tonelagem de cana por hectare (TCH). Fibra%, PCC e TCH foram avaliadas em dois ciclos da cultura. Foram detectados de 3 a 21 QTAs (p < 0,005),dependendo da característica, que foram classificados em QTAs de efeitos positivos ou negativos e de doses simples ou multiplas. lndividualmente, esses QTAs responderam por 7 - 13% da variância fenotípica observada. QTAs para um mesmo caráter responderam por até 46%. QTAs em doses multiplas foram responsáveis pelos maiores efeitos, negativos ou positivos. 0 mapeamento por intervalo de 20 QTAs em dose simples (LOD > 3,O) foi feito com o programa MapQTL 4.0. Marcadores flanqueadores ou QTAs em ligação e em fase de associação foram observados, com potencial para seleção assistida
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 31.07.2003

  • How to cite
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    • ABNT

      KIDO, Éderson Akio; FIGUEIRA, Antonio Vargas de Oliveira. Mapeamento de marcadores moleculares AFLP em população derivada de clones elite de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e suas associações com caracteres agronômicos. 2003.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2003.
    • APA

      Kido, É. A., & Figueira, A. V. de O. (2003). Mapeamento de marcadores moleculares AFLP em população derivada de clones elite de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e suas associações com caracteres agronômicos. Universidade de São Paulo, Piracicaba.
    • NLM

      Kido ÉA, Figueira AV de O. Mapeamento de marcadores moleculares AFLP em população derivada de clones elite de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e suas associações com caracteres agronômicos. 2003 ;
    • Vancouver

      Kido ÉA, Figueira AV de O. Mapeamento de marcadores moleculares AFLP em população derivada de clones elite de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e suas associações com caracteres agronômicos. 2003 ;


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