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Uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA (2004)

  • Authors:
  • Autor USP: DANTAS, DANIEL OLIVEIRA - IME
  • Unidade: IME
  • Sigla do Departamento: MAC
  • Assunto: COMPUTAÇÃO GRÁFICA
  • Language: Português
  • Abstract: O objetivo deste trabalho é apresentar uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA desenvolvida no BIOINFO, em parceria com o Instituto Ludwig de Pesquisa contra o câncer. A tecnologia de lâminas de cDNA é um processo baseado em hibridização que possibilita observar a concentração relativa de mRNA de amostras de tecidos analisando a luminosidade de sinais fluorescentes ou radiativos. Hibridização é o processo bioquímico onde duas fitas de ácido nucleico com seqúências complementares se combinam. A técnica apresentada permite o cálculo da expressão gênica com alto grau de automação, podendo o usuário corrigir com facilidade eventuais erros de segmentação. O usuário programa apenas para selecionar as imagens e inserir os dados de geometria da lâmina. A estratégia de solução usada tem três fases: gradeamento dos blocos, gradeamento dos stops e segmentação dos stops. Todas as fases utilizam filtros morfológicos e as fases de gradeamento possuem um passo final de correção baseado nos dados de geometria da lâmina, o que aumenta a robustez do processo, que funciona bem mesmo em imagens ruidosas.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 14.01.2004
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      DANTAS, Daniel Oliveira. Uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA. 2004. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2004. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20062016-125151. Acesso em: 26 abr. 2024.
    • APA

      Dantas, D. O. (2004). Uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20062016-125151
    • NLM

      Dantas DO. Uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA [Internet]. 2004 ;[citado 2024 abr. 26 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20062016-125151
    • Vancouver

      Dantas DO. Uma técnica automática baseada em morfologia matemática para medida de sinal em imagens de cDNA [Internet]. 2004 ;[citado 2024 abr. 26 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20062016-125151


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