Tese

Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons (2005)

• Authors:
  • Laurentino, Eliane Cristina
  • Cruz, Angela kaysel (Orientador)
• Autor USP: LAURENTINO, ELIANE CRISTINA - FMRP
• Unidade: FMRP
• Sigla do Departamento: RBP
• Subjects: LEISHMANIA BRASILIENSIS; GENOMAS (ANÁLISE); GENÉTICA MOLECULAR
• Language: Português
• Abstract: Nosso trabalho teve como objetivo conduzir estudos sobre o conteúdo do genoma deLeishmania Viannia brasiliensis conduzindo análises comparativas de organização de genoma e paralelamente desenvolvendo abordagens que permitam a análise funcional desse genoma. Para tanto, seguimos duas abordagens: i) avaliação do conteúdo do genoma através do uso de uma biblioteca de fragmentos aleatórios de L. (V.) brasiliensis submetida a sequenciamento por passagem única (GSSs -"genome survey sequences"), ii) desenvolvimento e teste de um sistema de transposição in vitro adequado para funcionar como captador de genes ("gene trapping"). A análise in silico do seqüenciamento de fragmentos aleatórios do genoma incluem busca por similaridades com seqüências depositadas em bancos de dados de domínio público, classificação funcional de genes putativos e comparação com genoma de organismos já completamente seqüenciados, com os tripanossomatídeos e, particularmente, com Leishmania major. A análise dos resultados o seqüenciamento da biblioteca de GSSs revelou que o baixo valor encontrado para similaridade entre as espécies comparadas, L. major e L. braziliensis (~60%), se deve predominantemente à baixa conservação das regiões não codificadoras. Um grande volume de genes conhecidos e hipotéticos envolvidos nos mais diferentes processos celulares foram identificados;estes representam um vasto material a ser explorado. Os estudos funcionais foram conduzidos com um sistema detransposição in vitro baseado no Tn5 e os resultados encontrados indicam que o método tem potencial aplicação para a captura de genes e mas requer ajustes para se tomar mais eficiente. Sistemas de transposição constituem uma ferramenta importante para análises sistemáticas de genomas e devem contribuir para a identificação e anotação dos genes. Em adição, os resultados e análises de GSSs permitiram avaliar e caracterizar de maneira preliminar o genoma de ... L. braziliensis e deve representar uma contribuição para uma compreensão da biologia destes parasitas
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2005
• Data da defesa: 21.01.2005

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How to cite

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• ABNT

  LAURENTINO, Eliane Cristina. Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons. 2005. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2005. . Acesso em: 18 abr. 2024.

• APA

  Laurentino, E. C. (2005). Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.

• NLM

  Laurentino EC. Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons. 2005 ;[citado 2024 abr. 18 ]

• Vancouver

  Laurentino EC. Introdução à genômica comparativa e funcional de Leishmania braziliensis através do uso de transposons. 2005 ;[citado 2024 abr. 18 ]

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