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Processamento paralelo aplicado ao problema de reconhecimento de genes (2005)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: TAKUNO, LEONARDO MASSAYUKI - EP
  • USP Schools: EP
  • Sigla do Departamento: PCS
  • Subjects: PROGRAMAÇÃO PARALELA; BIOINFORMÁTICA; GENES
  • Language: Português
  • Abstract: Nos últimos anos, a quantidade de dados biológicos em banco de dados públicos vem aumentando exponencialmente. Como conseqüência, os algoritmos de análises de dados, em especial algoritmos de predição de genes, estão associados a longos tempos de execução. Neste sentido, a computação paralela é um meio eficaz para diminuir o tempo de execução do processamento de tais análises. Nesta dissertação apresentamos uma solução paralela, implementada em cluster de computadores, para o tratamento do problema de reconhecimento de genes, problema este de grande relevância biológica e computacional. Nesta solução, utilizamos um algoritmo de predição de genes conhecido por Sim4, o qual foi projetado para alinhar seqüências de DNA complementar (cDNA) com conseqüências de DNA genômico e produzir como resultado uma tabela contendo as localizações de regiões que codificam proteínas. A solução proposta foi implementada, como também outras abordagens. Os resultados obtidos nos testes de avaliação do desempenho mostram as vantagens obtidas com a aplicação do processamento paralelo, principalmente pela solução proposta
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 28.04.2005

  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    EPBC31200033766FD-4002
    How to cite
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    • ABNT

      TAKUNO, Leonardo Massayuki; SATO, Liria Matsumoto. Processamento paralelo aplicado ao problema de reconhecimento de genes. 2005.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2005.
    • APA

      Takuno, L. M., & Sato, L. M. (2005). Processamento paralelo aplicado ao problema de reconhecimento de genes. Universidade de São Paulo, São Paulo.
    • NLM

      Takuno LM, Sato LM. Processamento paralelo aplicado ao problema de reconhecimento de genes. 2005 ;
    • Vancouver

      Takuno LM, Sato LM. Processamento paralelo aplicado ao problema de reconhecimento de genes. 2005 ;

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