Estudo do método de equalização da eletronegatividade no cálculo de energias livres de solvatação - GBEEM-ELR (2005)
- Authors:
- Autor USP: SHIMIZU, KARINA - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QFL
- Assunto: QUÍMICA TEÓRICA
- Language: Português
- Abstract: O método de equalização da eletronegatividade (Electronegativity Equalization Method, EEM), fundamentado em teoria do funcional da densidade eletrônica, foi combinado à aproximação de Born generalizada para moléculas (Generalized Born, GB), e denominado GBEEM (Dias et al., 2002). Os momentos de dipolo permanente no vácuo e em meio condensado ('epsilon''APROXIMADAMENTE' 80), e distribuições de cargas atômicas, mostraram boa concordância com modelo SM5.4 baseado em cargas CM1 em nível PM3 (12 moléculas, correspondendo a 29 cargas atômicas). Este resultado é interessante devido à simplicidade inerente do GBEEM e seu baixo custo computacional. Uma nova parametrização das durezas e eletronegatividades foi feita com o objetivo de melhorar a distribuição de cargas atômicas em moléculas isoladas em relação ao modelo CM1. Um conjunto de 250 estruturas/cargas PM3/CM1 de moléculas neutras pertencentes a 13 funções orgânicas foi utilizado como alvo na parametrização, utilizando uma metodologia Algoritmo Genético/Simplex de pesquisa de mínimos (Menegon et al., 2002). Boa concordância entre os modelos foi obtida. A validação da parametrização e do EEM foi efetuada usando moléculas bifuncionais (tetrapeptídeo e trisacarídeo) mostrando também boa concordância e robustez. Entretanto, a análise do momento de dipolo permanente das 250 moléculas mostrou uma séria limitação do EEM, e portanto do GBEEM, apesar da boa concordância entre as cargas EEM e CM 1. O EEM superestimouos momentos de dipolo. Tal fato pode decorrer de vários fatores, dentre os quais, o truncamento da expansão nas cargas atômicas e ausência de tratamento explícito de interação de troca (exchange). Foi sugerida uma aproximação que restringe a transferência de carga entre grupos na molécula que contornou a limitação do método na predição de ) momentos de dipolo no vácuo e meio condensado (Shimizu et ai., 2004). Com base nos recentes resultados, foi desenvolvido um modelo de solvatação baseado no GBEEM e no modelo de Floris-Tomasi. A calibração foi feita com um conjunto de 62 moléculas neutras (13 grupos funcionais) tendo como alvo as energias livres de hidratação experimentais. Os resultados apresentaram um desvio médio absoluto de 0,71 kcal/mol em relação aos valores experimentais
- Imprenta:
- Data da defesa: 15.12.2005
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ABNT
SHIMIZU, Karina. Estudo do método de equalização da eletronegatividade no cálculo de energias livres de solvatação - GBEEM-ELR. 2005. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2005. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46132/tde-14092006-174816/. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Shimizu, K. (2005). Estudo do método de equalização da eletronegatividade no cálculo de energias livres de solvatação - GBEEM-ELR (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46132/tde-14092006-174816/ -
NLM
Shimizu K. Estudo do método de equalização da eletronegatividade no cálculo de energias livres de solvatação - GBEEM-ELR [Internet]. 2005 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46132/tde-14092006-174816/ -
Vancouver
Shimizu K. Estudo do método de equalização da eletronegatividade no cálculo de energias livres de solvatação - GBEEM-ELR [Internet]. 2005 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46132/tde-14092006-174816/
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