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Agrupamento de meningiomas humanos baseado no perfil de expressão gênica avaliada por cDNA microarrays (2006)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: ESPANHOL, ALINE RENATA - FMRP
  • USP Schools: FMRP
  • Sigla do Departamento: RGE
  • Subjects: IMUNOGENÉTICA; MENINGIOMA; EXPRESSÃO GÊNICA
  • Language: Português
  • Abstract: Os meningiomas são os tumores os mais comuns do sistema nervoso central (SNC), contabilizando 26% de suas neoplasias. Embora, freqüentemente considerados como benignos 20% destes apresentam características histológicas agressivas com estatística significativa em relação à morbidade e mortalidade dos pacientes. Ainda que as medidas terapêuticas adjuvantes possam prolongar a sobrevida em vários pacientes, é importante ressaltar que seu efeito é ainda limitado e que a maioria dos tumores primários do SN não é passível de cura. Supomos que esforços para aperfeiçoarmos os métodos já existentes, ou até mesmo a inclusão de novos métodos na caracterização fina destas neoplasias poderia contribuir com a patologia clínica. A tecnologia dos cDNA microarrays associada a análise bioinformatizada dos dados, permite o agrupamento tanto de amostras, no caso os tumores, como de genes diferencialmente expressos. É um método de muito interesse para patologia clínica e medicina diagnóstica, pois ao mesmo tempo em que podemos classificar um grande número de amostras com base estatística e matemática, podemos também guardar a precisão do detalhe molecular, acessando a seqüência nucleotídica de cada gene diferencialmente expresso. Isto posto, levantamos a seguinte hipótese de trabalho; meningiomas humanos dos diferentes graus têm um conjunto de genes que se expressam em níveis diferentes ao ponto de permitirem agrupamento segundo o grau de agressividade. Desta forma, o principal objetivodeste estudo foi a avaliação dos perfis de expressão gênica diferenciais entre os diferentes graus de meningiomas (graus I, II e III) de acordo com World Health Organization (WHO) comparados com meninge normal (controle).o algo ritmo de agrupamento hierárquico Cluster & Tree View (não supervisionado) além de possibilitar traçarmos assinaturas de hibridação características de cada grau de meningiomas e de meninge normal, permitiu-nos apontarmos seis ) genes induzidos em meningioma de grau I, dois genes reprimidos em meningioma de grau II e oito genes induzidos em meningioma de grau III. Já o algoritmo estatístico SAM possibilitou-nos doze genes de expressão induzida em meningiomas de grau I, vinte e quatro genes induzidos em grau II e três genes em grau III. Além disso, analisamos o conjunto de genes diferencialmente expressos (dados do programa SAM) pelo algo ritmo de Venn (diagrama de Venn) possibilitando evidenciarmos três genes exclusivamente expressos pelos meningiomas de grau III, três genes de expressão compartilhada pelos meningiomas de grau I e II, sete genes de expressão compartilhada pelos meningiomas de grau II e III e quatro genes de expressão compartilhada por todos os graus. Estes dados, confirmam a hipótese anteriormente formulada, mostrando que os diferentes graus de meningiomas apresentam expressão diferencial de genes e que a tecnologia dos cDNA microarrays, junto com os programas de bioinformática utilizados, foi adequado no agrupamento nãosupervisionado das amostras dos tumores, o que poderá ter implicação na patologia clínica de classificação de meningiomas
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 14.03.2006

  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    FMRP11200031484Espanhol, Aline Renata
    How to cite
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    • ABNT

      ESPANHOL, Aline Renata; PASSOS JUNIOR, Geraldo Aleixo da Silva. Agrupamento de meningiomas humanos baseado no perfil de expressão gênica avaliada por cDNA microarrays. 2006.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2006.
    • APA

      Espanhol, A. R., & Passos Junior, G. A. da S. (2006). Agrupamento de meningiomas humanos baseado no perfil de expressão gênica avaliada por cDNA microarrays. Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.
    • NLM

      Espanhol AR, Passos Junior GA da S. Agrupamento de meningiomas humanos baseado no perfil de expressão gênica avaliada por cDNA microarrays. 2006 ;
    • Vancouver

      Espanhol AR, Passos Junior GA da S. Agrupamento de meningiomas humanos baseado no perfil de expressão gênica avaliada por cDNA microarrays. 2006 ;

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