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Desenvolvimento de modelos dinâmicos para a formação de clusters aplicados em dados biológicos (2006)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: DAMIANCE JUNIOR, ANTONIO PAULO GALDEANO - ICMC
  • USP Schools: ICMC
  • Subjects: SISTEMAS DINÂMICOS
  • Language: Português
  • Abstract: Com o advento da tecnologia de microarray, uma grande quantidade de dados de expressão gênica encontra-se disponível. Após a extração das taxas de expressão dos genes, técnicas de formação de clusters são utilizadas para a análise dos dados. Diante da diversidade do conhecimento que pode ser extraído dos dados de expressão gênica, existe a necessidade de diferentes técnicas de formação de clusters. O modelo dinâmico desenvolvido em (Zhao et. al. 2003a) apresenta diversas características interessantes para o problema de formação de clusters, entre as quais podemos citar: a não necessidade de fornecer o número de cluster, a propriedade de multi-escala, serem altamente paralelos e, principalmente, permitirem a inserção de regras e mecanismos mais complexos para a formação dos clusters. Todavia, este modelo apresenta dificuldades em determinar clusters de formato e tamanho arbitrários, além de não realizar a clusterização hierárquica, sendo estas duas características desejáveis para uma técnica de clusterização. Neste trabalho, foram desenvolvidas três técnicas para superar as limitações do modelo dinâmico proposto em (Zhao et. al. 2003a). O Modelo1, o qual é uma simplificação do modelo dinâmico original, porém mais eficiente. O Modelo2, que a partir da inserção de um novo conjunto de elementos no modelo dinâmico, permite a formação de clusters de formato e tamanho arbitrário. E um algoritmo para a clusterização hierárquica que utiliza o Modelo1 como bloco deconstrução. Os modelos desenvolvidos foram aplicados em dados biológicos, segmentando imagens de microarray e auxiliando na análise do conjunto expressão de genes de St. Jude Leukemia.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 16.10.2006
  • Acesso online ao documento

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    ICMC30300036655T D158dm e.1
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    • ABNT

      DAMIANCE JUNIOR, Antonio Paulo Galdeano; LIANG, Zhao. Desenvolvimento de modelos dinâmicos para a formação de clusters aplicados em dados biológicos. 2006.Universidade de São Paulo, São Carlos, 2006. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-23012007-103117/ >.
    • APA

      Damiance Junior, A. P. G., & Liang, Z. (2006). Desenvolvimento de modelos dinâmicos para a formação de clusters aplicados em dados biológicos. Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-23012007-103117/
    • NLM

      Damiance Junior APG, Liang Z. Desenvolvimento de modelos dinâmicos para a formação de clusters aplicados em dados biológicos [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-23012007-103117/
    • Vancouver

      Damiance Junior APG, Liang Z. Desenvolvimento de modelos dinâmicos para a formação de clusters aplicados em dados biológicos [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-23012007-103117/

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