Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas (2006)
- Authors:
- Autor USP: AMARAL, PAULO DE PAIVA ROSA - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QBQ
- Subjects: RNA (ESTUDO); RNA POLIMERASES (ESTUDO); REGULAÇÃO GÊNICA; BIOLOGIA MOLECULAR (ESTUDO)
- Language: Português
- Abstract: Recentemente, tem sido demonstrado que a maioria dos RNAs transcritos em células humanas são RNAs não-codificadores de proteínas (ncRNAs) originados de íntrons ou regiões intergênicas. Em trabalhos anteriores realizados por nosso grupo, foram descritos longos ncRNAs transcritos de regiões intrônicas de genes codificadores e cuja expressão foi correlacionada ao grau de diferenciação de tumores de próstata, apontando para a relevância fisiológica desta classe de transcritos. Apesar de sua abundância, as propriedades, funções e regulação da grande maioria dos ncRNAs ainda não foram elucidadas. O objetivo do presente trabalho foi investigar a biossíntese de ncRNAs intrônicos em células humanas, primordialmente a contribuição da RNA Polimerase II (RNAP II), bem como aspectos de sua regulação. Primeiramente, o modelo de regulação da expressão gênica por hormônio andrógeno foi utilizado para avaliação da participação direta de um fator de transcrição de RNAP II, o Receptor de Andrógeno (AR), na modulação da transcrição de ncRNAs intrônicos. Utilizando-se a técnica de imunoprecipitação da cromatina, foi detectada a ligação do AR ao elemento de resposta a andrógeno (ARE) presente em um possível promotor de um transcrito intrônico antisenso (derivado do locus Myo5A), cuja expressão é aumentada em células da linhagem LNCaP tratadas com o hormônio. A ligação ao ARE foi induzida pelo tratamento, sugerindo que o efeito do andrógeno na expressão do ncRNA é mediado peloAR. Em uma segunda abordagem, o efeito da inibição da transcrição por RNAP II com 'alfa'-amanitina por 24 h em células LNCaP foi avaliado com o uso de microarranjos de oligonucleotídeos representando transcritos total ou parcialmente intrônicos, além de éxons de genes codificadores. A expressão de menos de 20 'POR CENTO' dos transcritos intrônicos foi afetada, ) fração significativamente menor que a observada para os transcritos exônicos (40 'POR CENTO'). Ainda que a maioria dos ncRNAs intrônicos diferencialmente expressos tenha sua abundância diminuída, interessantemente, 13 a 16 'POR CENTO' foram aumentados, contrastando com aproximadamente 2 a 3 'POR CENTO' de exônicos que aumentaram. Os resultados obtidos neste trabalho indicam que a RNAP II atua na transcrição de ncRNAs intrônicos, mas que uma fração considerável pode ser transcrita por outra RNA Polimerase
- Imprenta:
- Data da defesa: 16.10.2006
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ABNT
AMARAL, Paulo de Paiva Rosa. Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas. 2006. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2006. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-03012007-000256/. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Amaral, P. de P. R. (2006). Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-03012007-000256/ -
NLM
Amaral P de PR. Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas [Internet]. 2006 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-03012007-000256/ -
Vancouver
Amaral P de PR. Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas [Internet]. 2006 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-03012007-000256/
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