Modelagem molecular das proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeo (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv. citri (2009)
- Authors:
- Autor USP: MOUTRAN, ALEXANDRE - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: MICROBIOLOGIA; MODELAGEM MOLECULAR; OLIGOPEPTÍDEOS; XANTHOMONAS; BIOINFORMÁTICA; PROTEÍNAS DE TRANSPORTE
- Language: Português
- Abstract: Sistemas de transporte tipo ABC são responsáveis pelo transporte de uma grande variedade de substâncias dentre elas os oligopeptídeos e molibdato. Neste trabalho estudamos dois sistemas de transportadores do tipo ABC (mod, envolvido na captação de molibdato e o opp na capação de oligopeptídeos) presentes na bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac). Em particular analisamos a organização genética dos óperons mod e as proteínas ModA e OppA, componentes solúveis localizados no periplasma e responsáveis pela ligação aos substratos. Por meio de técnicas de modelagem molecular, definimos modelos estruturais para as proteínas ModA e OppA. Para a proteína ModA caracterizamos cinco resíduos que compõem a cavidade ligadora e são responsáveis pelas interações com o íon molibdato, assim como a sua similaridade estrutural e sequencial com ortólogos de 3 grupos distintos de bactérias. Para a OppA, descrevemos o seu comportamento na ancoragem de diferentes oligopeptídeos. Avaliamos parâmetros como a extensão da cadeia e estabelecemos uma ordem crescente de afinidade entre os oligopeptídeos com diferente composição residual e a proteína OppA
- Imprenta:
- Data da defesa: 24.04.2009
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ABNT
MOUTRAN, Alexandre. Modelagem molecular das proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeo (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2009. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16072009-100344/. Acesso em: 20 abr. 2024. -
APA
Moutran, A. (2009). Modelagem molecular das proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeo (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv. citri (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16072009-100344/ -
NLM
Moutran A. Modelagem molecular das proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeo (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2009 ;[citado 2024 abr. 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16072009-100344/ -
Vancouver
Moutran A. Modelagem molecular das proteínas captadoras de Molibdato (ModA) e Oligopeptídeo (OppA) de Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2009 ;[citado 2024 abr. 20 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-16072009-100344/
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