Caracterização e dinâmica evolutiva de retrovirus endógenos da familia K (ERV-K) em genoma de primatas (2009)
- Authors:
- Autor USP: ROMANO, CAMILA MALTA - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Subjects: RETROVIRIDAE; EVOLUÇÃO MOLECULAR; FILOGENIA; PRIMATAS
- Language: Português
- Abstract: Retrovírus endógenos (ERVs) são vírus que infectaram células germinativas e proliferaram no genoma do hospedeiro. A família K está integrada apenas no genoma de primatas do Velho Mundo. Os ERVs promovem alterações estruturais nos genomas hospedeiros, sendo fundamentais para a sua evolução. Esse trabalho teve como objetivo realizar uma investigação da distribuição e dinâmica evolutiva de ERV-K nos diferentes hospedeiros. Foram identificados 58 ERV-K em humanos, 38 em chimpanzés, 35 em orangotangos e 19 em macaco rhesus. Análises filogenéticas evidenciaram dois grupos principais, Grupo O/N, que compreende os provirus mais antigos e os mais recentes, e Grupo I, com provirus com tempo de integração intermediário. A dinâmica de espalhamento de ERV-K diferiu entre os hospedeiros. A fixação e eliminação dos ERV-K é resultado de fatores demográficos e populacionais, como gargalos de garrafa e expansões sofridas ao longo da evolução. Análises de quais provírus são ativos em pacientes com HIV e com cancer demonstrou que distintos ERVs são transativados, sugerindo alguma consequencia biológica para o hospedeiro. Além disso, a atividade dos ERVs não depende exclusivamente do tempo de integração, mas sim da integridade de regiões específicas contidas na LTRRetrovírus endógenos (ERVs) são vírus que infectaram células germinativas e proliferaram no genoma do hospedeiro. A família K está integrada apenas no genoma de primatas do Velho Mundo. Os ERVs promovem alterações estruturais nos genomas hospedeiros, sendo fundamentais para a sua evolução. Esse trabalho teve como objetivo realizar uma investigação da distribuição e dinâmica evolutiva de ERV-K nos diferentes hospedeiros. Foram identificados 58 ERV-K em humanos, 38 em chimpanzés, 35 em orangotangos e 19 em macaco rhesus. Análises filogenéticas evidenciaram dois grupos principais, Grupo O/N, que compreende os provirus mais antigos e os mais recentes, e Grupo I, com provirus com tempo de integração intermediário. A dinâmica de espalhamento de ERV-K diferiu entre os hospedeiros. A fixação e eliminação dos ERV-K é resultado de fatores demográficos e populacionais, como gargalos de garrafa e expansões sofridas ao longo da evolução. Análises de quais provírus são ativos em pacientes com HIV e com cancer demonstrou que distintos ERVs são transativados, sugerindo alguma consequencia biológica para o hospedeiro. Além disso, a atividade dos ERVs não depende exclusivamente do tempo de integração, mas sim da integridade de regiões específicas contidas na LTR.
- Imprenta:
- Data da defesa: 11.12.2009
-
ABNT
ROMANO, Camila Malta. Caracterização e dinâmica evolutiva de retrovirus endógenos da familia K (ERV-K) em genoma de primatas. 2009. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2009. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012010-105745/. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Romano, C. M. (2009). Caracterização e dinâmica evolutiva de retrovirus endógenos da familia K (ERV-K) em genoma de primatas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012010-105745/ -
NLM
Romano CM. Caracterização e dinâmica evolutiva de retrovirus endógenos da familia K (ERV-K) em genoma de primatas [Internet]. 2009 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012010-105745/ -
Vancouver
Romano CM. Caracterização e dinâmica evolutiva de retrovirus endógenos da familia K (ERV-K) em genoma de primatas [Internet]. 2009 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-29012010-105745/ - Caracterização molecular e análise comparativa de genomas mitocondriais de Eimeria spp. de galinha doméstica
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