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An efficient and rapid DNA minipreparation procedure suitable for PCR/SSR and RAPD analyses in tropical forest tree species (2009)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: HUAMAN, CARLOS ALBERTO MARTINEZ Y - FFCLRP ; MESTRINER, MOACYR ANTONIO - FMRP
  • USP Schools: FFCLRP; FMRP
  • DOI: 10.1590/s1516-89132009000500020
  • Subjects: ÁRVORES; FLORESTAS TROPICAIS
  • Language: Inglês
  • Abstract: Este trabalho teve como objetivo otimizar um protocolo econômico, rápido e eficaz de minipreparação de DNA genômico, para as espécies florestais Copaifera langsdorffii (Óleo de Copaíba), Hymenaea courbaril (Jatobá), Eugenia uniflora (Pitanga), Tabebuia roseo alba (Ipê Branco) e Cariniana estrellensis (Jequitibá Branco). Este método é uma adaptação da técnica de extração CTAB de Doyle e Doyle (1990), o qual consiste principalmente na adição de PVP para eliminar polifenoles, somente uma etapa de extração com clorofórmio-álcool isoamílico e a adição da RNase A imediatamente após a extração com clorofórmio. O método também dispensa o uso de nitrogênio líquido, o uso do fenol e a adição de proteinase K. Os DNAs das espécies florestais extraídos apresentaram alto rendimento e boa qualidade, com rendimento de 25.7 a 42.1 ‘mu’g de DNA a partir de 100 mg de tecido foliar congelado. Com este protocolo, em apenas 1 dia de trabalho, uma pessoa pode completar o isolamento do DNA de aproximadamente 50 amostras de folhas (dependendo da capacidade da centrífuga). O DNA obtido pode ser usado para métodos de análise baseados em PCR (SSR e RAPD)
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    Informações sobre o DOI: 10.1590/s1516-89132009000500020 (Fonte: oaDOI API)
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    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by-nc
    Informações sobre o Citescore
  • Título: Brazilian Archives of Biology and Technology

    ISSN: 1516-8913

    Citescore - 2017: 0.97

    SJR - 2017: 0.281

    SNIP - 2017: 0.623


  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    FCLRP1815180pcd 1815180 1815180
    How to cite
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    • ABNT

      ALZATE-MARIN, Ana Lilia; GUIDUGLI, Marcela Corbo; SORIANI, Hilda Hildebrand; MARTINEZ, Carlos Alberto; MESTRINER, Moacyr Antonio. An efficient and rapid DNA minipreparation procedure suitable for PCR/SSR and RAPD analyses in tropical forest tree species. Brazilian Archives of Biology and Technology, Curitiba, v. 52, n. 5, p. 1217-1224, 2009. Disponível em: < http://www.scielo.br/pdf/babt/v52n5/v52n5a20.pdf > DOI: 10.1590/s1516-89132009000500020.
    • APA

      Alzate-Marin, A. L., Guidugli, M. C., Soriani, H. H., Martinez, C. A., & Mestriner, M. A. (2009). An efficient and rapid DNA minipreparation procedure suitable for PCR/SSR and RAPD analyses in tropical forest tree species. Brazilian Archives of Biology and Technology, 52( 5), 1217-1224. doi:10.1590/s1516-89132009000500020
    • NLM

      Alzate-Marin AL, Guidugli MC, Soriani HH, Martinez CA, Mestriner MA. An efficient and rapid DNA minipreparation procedure suitable for PCR/SSR and RAPD analyses in tropical forest tree species [Internet]. Brazilian Archives of Biology and Technology. 2009 ; 52( 5): 1217-1224.Available from: http://www.scielo.br/pdf/babt/v52n5/v52n5a20.pdf
    • Vancouver

      Alzate-Marin AL, Guidugli MC, Soriani HH, Martinez CA, Mestriner MA. An efficient and rapid DNA minipreparation procedure suitable for PCR/SSR and RAPD analyses in tropical forest tree species [Internet]. Brazilian Archives of Biology and Technology. 2009 ; 52( 5): 1217-1224.Available from: http://www.scielo.br/pdf/babt/v52n5/v52n5a20.pdf

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    Autor: Ciampi A. Y.
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