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Land-use systems affect archaeal community structure and functional diversity in Western Amazon soils (2011)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: MUI, TSAI SIU - CENA
  • USP Schools: CENA
  • DOI: 10.1590/s0100-06832011000500007
  • Subjects: ECOLOGIA DO SOLO; ECOLOGIA MICROBIANA; MICROBIOLOGIA DO SOLO; SOLO TROPICAL
  • Language: Inglês
  • Abstract: O conhecimento acerca da ecologia de comunidades microbianas do solo em relevantes escalas espaciais é primordial na ampla região da Amazônia devido às mudanças de uso da terra. Neste estudo, a diversidade do Domínio Archaea (estrutura da comunidade) e Archaea oxidadora de amônia (riqueza e composição da comunidade) foi investigada usando-se técnicas moleculares em solos sob diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia ocidental brasileira. Amostras de solo foram coletadas em dois períodos distintos de elevada intensidade pluviométrica (março de 2008 e janeiro de 2009) em Cambissolos sob floresta primária, floresta secundária (5 a 20 anos de regeneração), sistemas agrícolas de povos indígenas e pastagem. A eletroforese em gel com gradiente desnaturante de produtos amplificados pela reação em cadeia da polimerase (PCR-DGGE) usando o gene 16S rRNA como marcador filogenético indicou que as estruturas de comunidades de Archaea em solos sob cultivo agrícola e pastagem são diferentes daquelas encontradas em solos sob floresta primária. Estas, por sua vez, foram mais similares às estruturas de comunidades em solos sob floresta secundária. A análise de sequências de bandas excisadas de géis de DGGE revelou a presença de organismos dos filos Crenarchaeota e Euryarchaeota. Com base em análise de bibliotecas de clones do gene que codifica para a subunidade A da enzima amônia monoxigenase (amoA ) de Archaea (306 sequências), os índices de Shannon-Wiener e Simpson mostraram maior diversidade de Archaea oxidadora de amônia em solos sob floresta primária (H' = 2,1486; D = 0,1366), seguido por menor diversidade em solos sob pastagem (H' = 1,9629; D = 0,1715), cultivo agrícola (H' = 1,4613; D = 0,3309) e floresta secundária (H' = 0,8633; D = 0,5405). Todos os insertos clonados foram similares a clones do gene amoA de Crenarchaeota (identidade >95%) previamente detectados em solos e sedimentos.
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    Informações sobre o DOI: 10.1590/s0100-06832011000500007 (Fonte: oaDOI API)
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    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by-nc

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    • ABNT

      NAVARRETE, Acácio Aparecido; TAKETANI, Rodrigo Gouvêa; MENDES, Lucas William; et al. Land-use systems affect archaeal community structure and functional diversity in Western Amazon soils. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, v. 35, p. 1527-1540, 2011. DOI: 10.1590/s0100-06832011000500007.
    • APA

      Navarrete, A. A., Taketani, R. G., Mendes, L. W., Cannavan, F. de S., Moreira, F. M. de S., & Tsai, S. M. (2011). Land-use systems affect archaeal community structure and functional diversity in Western Amazon soils. Revista Brasileira de Ciência do Solo, 35, 1527-1540. doi:10.1590/s0100-06832011000500007
    • NLM

      Navarrete AA, Taketani RG, Mendes LW, Cannavan F de S, Moreira FM de S, Tsai SM. Land-use systems affect archaeal community structure and functional diversity in Western Amazon soils. Revista Brasileira de Ciência do Solo. 2011 ; 35 1527-1540.
    • Vancouver

      Navarrete AA, Taketani RG, Mendes LW, Cannavan F de S, Moreira FM de S, Tsai SM. Land-use systems affect archaeal community structure and functional diversity in Western Amazon soils. Revista Brasileira de Ciência do Solo. 2011 ; 35 1527-1540.

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