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Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines (2011)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: BRENTANI, HELENA PAULA - FM ; BRENTANI, RICARDO RENZO - FM ; BRENTANI, MARIA MITZI - FM
  • USP Schools: FM; FM; FM
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0021022
  • Subjects: NEOPLASIAS MAMÁRIAS (GENÉTICA); PROGNÓSTICO; FATORES DE CRESCIMENTO; TERAPIA DE REPOSIÇÃO DE ESTRÓGENOS; BIOMARCADORES; ONCOGENES (ANÁLISE); METÁSTASE NEOPLÁSICA
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: PLOS ONE
    • ISSN: 1932-6203
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 6, n. 6, e21022, 2011
  • Acesso online ao documento

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    Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.pone.0021022 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
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    • Cor do Acesso Aberto: hybrid
    • Licença: cc-by
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  • Título: PLoS ONE

    ISSN: 1932-6203

    Citescore - 2017: 3.01

    SJR - 2017: 1.164

    SNIP - 2017: 1.111


  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    FM2276000-10BCSEP 016 2011
    How to cite
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    • ABNT

      CARRARO, Dirce Maria; FERREIRA, Elisa Napolitano; MOLINA, Gustavo de Campos; et al. Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines. PLOS ONE, San Francisco, v. 6, n. 6, 2011. DOI: 10.1371/journal.pone.0021022.
    • APA

      Carraro, D. M., Ferreira, E. N., Molina, G. de C., Puga, R. D., Abrantes, E. F., Trapé, A. P., et al. (2011). Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines. PLOS ONE, 6( 6). doi:10.1371/journal.pone.0021022
    • NLM

      Carraro DM, Ferreira EN, Molina G de C, Puga RD, Abrantes EF, Trapé AP, Ekhardt BL, Nunes DN, Brentani MM, Arap W, Pasqualini R, Brentani H, Dias-Neto E, Brentani RR. Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines. PLOS ONE. 2011 ; 6( 6):
    • Vancouver

      Carraro DM, Ferreira EN, Molina G de C, Puga RD, Abrantes EF, Trapé AP, Ekhardt BL, Nunes DN, Brentani MM, Arap W, Pasqualini R, Brentani H, Dias-Neto E, Brentani RR. Poly (A)+ Transcriptome Assessment of ERBB2-Induced Alterations in Breast Cell Lines. PLOS ONE. 2011 ; 6( 6):

    Referências citadas na obra
    Autor: LJ Veer
    Título: Gene expression proffiling predicts clinical outcome of breast cancer.
    Título do periódico: Nature
    Volume: 415
    Primeira página: 530
    Ano: 2002
    DOI: 10.1038/415530a
    Autor: RR Brentani
    Título: Gene expression arrays in cancer research: methods and applications.
    Título do periódico: Crit Rev Oncol Hematol
    Volume: 54
    Primeira página: 95
    Ano: 2005
    DOI: 10.1016/j.critrevonc.2004.12.006
    Autor: MA Folgueira
    Título: Gene expression profile associated with response to doxorubicin-based therapy in breast cancer.
    Título do periódico: Clin Cancer Res
    Volume: 11
    Primeira página: 7434
    Ano: 2005
    DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-04-0548
    Autor: NP Castro
    Título: Evidence that molecular changes in cells occur before morphological alterations during the progression of breast ductal carcinoma.
    Título do periódico: Breast Cancer Res
    Volume: 10
    Primeira página: R87
    Ano: 2008
    DOI: 10.1186/bcr2157
    Autor: PB Rozenchan
    Título: Reciprocal changes in gene expression profiles of cocultured breast epithelial cells and primary fibroblasts.
    Título do periódico: I J Cancer
    Volume: 125
    Primeira página: 2767
    Ano: 2009
    Autor: FMA Koike
    Título: Gene expression profile of residual breast cancer after doxorubicin and cyclophosphamide neoadjuvant chemotherapy.
    Título do periódico: Oncol Rep
    Volume: 4
    Primeira página: 805
    Ano: 2009
    Autor: CM Perou
    Título: Molecular portraits of human breast tumours.
    Título do periódico: Nature
    Volume: 406
    Primeira página: 747
    Ano: 2000
    DOI: 10.1038/35021093
    Autor: T Sørlie
    Título: Gene expression patterns of breast carcinomas distinguish tumor subclasses with clinical implications.
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 98
    Primeira página: 10869
    Ano: 2001
    DOI: 10.1073/pnas.191367098
    Autor: JS Ross
    Título: The HER-2/neu Oncogene in Breast Cancer: Prognostic Factor, Predictive Factor, and Target for Therapy.
    Título do periódico: Oncologist
    Volume: 3
    Primeira página: 237
    Ano: 1998
    Autor: CI Campbell
    Título: ErbB2 enhances mammary tumorigenesis, oncogene-independent recurrence and metastasis in a model of IGF-IR-mediated mammary tumorigenesis.
    Título do periódico: Molecular Cancer
    Volume: 9
    Primeira página: 235
    Ano: 2010
    DOI: 10.1186/1476-4598-9-235
    Autor: DJ Slamon
    Título: Studies of the HER-2/neu proto-oncogene in human breast and ovarian cancer.
    Título do periódico: Science
    Volume: 244
    Primeira página: 707
    Ano: 1989
    DOI: 10.1126/science.2470152
    Autor: DJ Slamon
    Título: Human breast cancer: correlation of relapse and survival with amplification of the HER-2/neu oncogene.
    Título do periódico: Science
    Volume: 235
    Primeira página: 177
    Ano: 1987
    DOI: 10.1126/science.3798106
    Autor: CA Purdie
    Título: Increased mortality in HER2 positive, oestrogen receptor positiveinvasive breast cancer: a population-based study.
    Título do periódico: B J Cancer
    Volume: 103
    Primeira página: 475
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/sj.bjc.6605799
    Autor: S Ménard
    Título: Biologic and therapeutic role of HER2 in cancer.
    Título do periódico: Oncogene
    Volume: 42
    Primeira página: 6570
    Ano: 2003
    DOI: 10.1038/sj.onc.1206779
    Autor: CL Vogel
    Título: Efficacy and Safety of Trastuzumab as a Single Agent in First-Line Treatment of HER2-Overexpressing Metastatic Breast Cancer.
    Título do periódico: Journal of Clinical Oncology
    Volume: 20
    Primeira página: 719
    Ano: 2002
    DOI: 10.1200/JCO.20.3.719
    Autor: AC Stamps
    Título: Analysis of proviral integration in human mammary epithelial cell lines immortalized by retroviral infection with a temperature-sensitive SV40 T-antigen construct.
    Título do periódico: I J Cancer
    Volume: 57
    Primeira página: 865
    Ano: 1994
    Autor: RA Harris
    Título: New model of ErbB-2 over-expression in human mammary luminal epithelial cells.
    Título do periódico: Int J Cancer
    Volume: 80
    Primeira página: 477
    Ano: 1999
    DOI: 10.1002/(SICI)1097-0215(19990129)80:3<477::AID-IJC23>3.0.CO;2-W
    Autor: ML Dos Santos
    Título: Transcriptome characterization of human mammary cell lines expressing different levels of ERBB2 by serial analysis of gene expression.
    Título do periódico: Int J Oncol
    Volume: 28
    Primeira página: 1441
    Ano: 2006
    Autor: ML Dos Santos
    Título: Transcriptome changes induced by docetaxel in human mammary cell lines expressing different levels of ERBB2.
    Título do periódico: Int J Mol Med
    Volume: 23
    Primeira página: 733
    Ano: 2009
    Autor: BR Graveley
    Título: Alternative splicing: increasing diversity in the proteomic world.
    Título do periódico: Trends Genet
    Volume: 17
    Primeira página: 100
    Ano: 2001
    DOI: 10.1016/S0168-9525(00)02176-4
    Autor: J Harrow
    Título: GENCODE: producing a reference annotation for ENCODE.
    Título do periódico: Genome Biol
    Volume: 7
    Primeira página: S4.1
    Ano: 2006
    DOI: 10.1186/gb-2006-7-s1-s4
    Autor: TT Torres
    Título: Gene expression profiling by massively parallel sequencing.
    Título do periódico: Genome Res
    Volume: 18
    Primeira página: 172
    Ano: 2008
    DOI: 10.1101/gr.6984908
    Autor: CA Maher
    Título: Chimeric transcript discovery by paired-end transcriptome sequencing.
    Título do periódico: Proc Nat Acad Sci U S A
    Volume: 106
    Primeira página: 12353
    Ano: 2009
    DOI: 10.1073/pnas.0904720106
    Autor: F Tang
    Título: mRNA-Seq whole-transcriptome analysis of a single cell.
    Título do periódico: Nature Methods
    Volume: 6
    Primeira página: 377
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nmeth.1315
    Autor: M Yassour
    Título: Ab initio construction of a eukaryotic transcriptome by massively parallel mRNA sequencing.
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 106
    Primeira página: 3264
    Ano: 2009
    DOI: 10.1073/pnas.0812841106
    Autor: ED Pleasance
    Título: A small-cell lung cancer genome with complex signatures of tobacco exposure.
    Título do periódico: Nature
    Volume: 463
    Primeira página: 184
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/nature08629
    Autor: E Dias-Neto
    Título: Shotgun sequencing of the human transcriptome with ORF expressed sequence tags.
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 97
    Primeira página: 3491
    Ano: 2000
    DOI: 10.1073/pnas.97.7.3491
    Autor: V Ramensky
    Título: Human non-synonymous SNPs: server and survey.
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 30
    Primeira página: 3894
    Ano: 2002
    DOI: 10.1093/nar/gkf493
    Autor: E Prifti
    Título: FunNet: an integrative tool for exploring transcriptional interactions.
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 24
    Primeira página: 2636
    Ano: 2008
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btn492
    Autor: A Janus
    Título: The mammalian target of the rapamycin (mTOR) kinase pathway: its role in tumourigenesis and targeted antitumour therapy.
    Título do periódico: Cell Mol Biol Lett
    Volume: 10
    Primeira página: 479
    Ano: 2005
    Autor: CJ Creighton
    Título: A gene transcription signature of the Akt/mTOR pathway in clinical breast tumors.
    Título do periódico: Oncogene
    Volume: 26
    Primeira página: 4648
    Ano: 2007
    DOI: 10.1038/sj.onc.1210245
    Autor: H Heinonen
    Título: Deciphering downstream gene targets of PI3K/mTOR/p70S6K pathway in breast cancer.
    Título do periódico: BMC Genomics
    Volume: 9
    Primeira página: 348
    Ano: 2008
    DOI: 10.1186/1471-2164-9-348
    Autor: A Akcakanat
    Título: The rapamycin-regulated gene expression signature determines prognosis for breast cancer.
    Título do periódico: Mol Cancer
    Volume: 8
    Primeira página: 75
    Ano: 2009
    DOI: 10.1186/1476-4598-8-75
    Autor: F Meric-Bernstam
    Título: Targeting the mTOR signaling network for cancer therapy.
    Título do periódico: J Clin Oncol
    Volume: 27
    Primeira página: 2278
    Ano: 2009
    DOI: 10.1200/JCO.2008.20.0766
    Autor: CA Maher
    Título: Transcriptome sequencing to detect gene fusions in cancer.
    Título do periódico: Nature
    Volume: 458
    Primeira página: 97
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nature07638
    Autor: H Edgren
    Título: Identification of fusion genes in breast cancer by paired-end RNA-sequencing.
    Título do periódico: Genome Biol
    Volume: 19
    Primeira página: 12
    Ano: 2011
    Autor: CJ McManus
    Título: Global analysis of trans-splicing in Drosophila.
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 107
    Primeira página: 12975
    Ano: 2010
    DOI: 10.1073/pnas.1007586107
    Autor: XS Wang
    Título: An integrative approach to reveal driver gene fusions from paired-end sequencing data in cancer.
    Título do periódico: Nat Biotechnol
    Volume: 27
    Primeira página: 1005
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nbt.1584
    Autor: W Gu
    Título: Mechanisms for human genomic rearrangements.
    Título do periódico: Pathogenetics
    Volume: 1
    Primeira página: 4
    Ano: 2008
    DOI: 10.1186/1755-8417-1-4
    Autor: PJ Stephens
    Título: Complex landscapes of somatic rearrangement in human breast cancer genomes.
    Título do periódico: Nature
    Volume: 462
    Primeira página: 1005
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nature08645
    Autor: PP Di Fiore
    Título: Erbb-2 is a potent oncogene when overexpressed in NIHI/3T3 Cells.
    Título do periódico: Science
    Volume: 237
    Primeira página: 178
    Ano: 1987
    DOI: 10.1126/science.2885917
    Autor: EN Ferreira
    Título: Alternative splicing enriched cDNA libraries identify breast cancer-associated transcripts.
    Título do periódico: BMC Genomics
    Volume: 11:
    Primeira página: S4
    Ano: 2010
    DOI: 10.1186/1471-2164-11-S5-S4
    Autor: A Srebrow
    Título: The connection between splicing and cancer.
    Título do periódico: J Cell Sci
    Volume: 119
    Primeira página: 2635
    Ano: 2006
    DOI: 10.1242/jcs.03053
    Autor: J Stingl
    Título: Molecular heterogeneity of breast carcinomas and the cancer stem cell hypothesis.
    Título do periódico: Nat Rev Cancer
    Volume: 7
    Primeira página: 791
    Ano: 2007
    DOI: 10.1038/nrc2212
    Autor: M Allinen
    Título: Molecular characterization of the tumor microenvironment in breast cancer.
    Título do periódico: Cancer Cell
    Volume: 6
    Primeira página: 17
    Ano: 2004
    DOI: 10.1016/j.ccr.2004.06.010
    Autor: E Noblesse
    Título: Lysyl oxidase-like and lysyl oxidase are present in the dermis and epidermis of a skin equivalent and in human skin and are associated to elastic fibers.
    Título do periódico: J Invest Dermatol
    Volume: 122
    Primeira página: 621
    Ano: 2004
    DOI: 10.1111/j.0022-202X.2004.22330.x
    Autor: C Min
    Título: The tumor suppressor activity of the lysyl oxidase propeptide reverses the invasive phenotype of Her-2/neu-driven breast cancer.
    Título do periódico: Cancer Res
    Volume: 67
    Primeira página: 1105
    Ano: 2007
    DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-06-3867
    Autor: A Watahiki
    Título: Libraries enriched for alternatively spliced exons reveal splicing patterns in melanocytes and melanomas.
    Título do periódico: Nat Methods
    Volume: 3
    Primeira página: 233
    Ano: 2004
    DOI: 10.1038/nmeth719
    Autor: WJ Kent
    Título: BLAT–the BLAST-like alignment tool.
    Título do periódico: Genome Res
    Volume: 4
    Primeira página: 656
    Ano: 2002
    DOI: 10.1101/gr.229202. Article published online before March 2002
    Autor: F Hsu
    Título: The UCSC Known Genes.
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 22
    Primeira página: 1036
    Ano: 2006
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btl048
    Autor: ST Sherry
    Título: dbSNP: the NCBI database of genetic variation.
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 29
    Primeira página: 308
    Ano: 2001
    DOI: 10.1093/nar/29.1.308
    Autor: RZ Vêncio
    Título: Bayesian model accounting for within-class biological variability in Serial Analysis of Gene Expression (SAGE).
    Título do periódico: BMC Bioinformatics
    Volume: 5
    Primeira página: 119
    Ano: 2004
    DOI: 10.1186/1471-2105-5-119