Uma generalização do modelo de spins e bósons para a transcrição de genes sob múltiplo controle (2012)
- Authors:
- Autor USP: INNOCENTINI, GUILHERME DA COSTA PEREIRA - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; PROCESSOS ESTOCÁSTICOS; SPIN; BÓSON; FÍSICA TEÓRICA
- Keywords: Gene expression; Noise; Regulação transcricional; Ruído; Soluções exatas; Stochastic process; Transcriptional regulation
- Language: Português
- Abstract: Nesta tese propomos um modelo estocástico multimodal para regulação da expressão gênica em nível de transcrição. A definição de um espaço de parâmetros que contém o conteúdo biológico do sistema aliada à escolha apropriada de uma base para construir a matriz de acoplamento entre os estados do sistema levaram à obtenção de soluções exatas do modelo. Tais soluções são obtidas transformando as equações mestras em equações diferenciais parciais usando a técnica das funções geradoras e escrevendo os coeficientes das equações parciais em termos dos parâmetros biológicos do modelo. No regime estacionário obtivemos uma relação de recorrência para os coeficientes das séries de potências que definem as funções geradoras e a especificação das configurações de equilíbrio do sistema permite que estas séries sejam calculadas exatamente. Com as soluções exatas calculadas não só as distribuições de probabilidade foram obtidas como os momentos das distribuições. As distribuições de probabilidade de equilíbrio apresentam estruturas multimodais com vários picos e a análise do ruído (flutuação) mostra que a existência de um estado intermediário de eficiência transcricional leva a redução do ruído global do sistema. A inspeção dos autovalores da matriz de acoplamento mostrou que existem regiões onde a dinâmica dos momentos é de caráter oscilatória com amortecimento. Diferentes esquemas de acoplamento levam à diferentes regimes transientes, tal característica revela que o sistema multimodal apresentam maior flexibilidade adaptativa quando comparado com sistemas de um ou dois estados.
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2012
- Data da defesa: 04.06.2012
-
ABNT
INNOCENTINI, Guilherme da Costa Pereira. Uma generalização do modelo de spins e bósons para a transcrição de genes sob múltiplo controle. 2012. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-19072012-105018/. Acesso em: 18 abr. 2024. -
APA
Innocentini, G. da C. P. (2012). Uma generalização do modelo de spins e bósons para a transcrição de genes sob múltiplo controle (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-19072012-105018/ -
NLM
Innocentini G da CP. Uma generalização do modelo de spins e bósons para a transcrição de genes sob múltiplo controle [Internet]. 2012 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-19072012-105018/ -
Vancouver
Innocentini G da CP. Uma generalização do modelo de spins e bósons para a transcrição de genes sob múltiplo controle [Internet]. 2012 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-19072012-105018/
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