Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes (2011)
- Authors:
- Autor USP: HIGA, CARLOS HENRIQUE AGUENA - IME
- Unidade: IME
- Sigla do Departamento: MAC
- Assunto: ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Um problema importante na área de Biologia Sistêmica é o de inferência de redes de regulação gênica. Os avanços científicos e tecnológicos nos permite analisar a expressão gênica de milhares de genes simultaneamente. Por "expressão gênica" estamos nos referindo ao nível de mRNA dentro de uma célula. Devido a esta grande quantidade de dados, métodos matemáticos, estatísticos e computacionais têm sido desenvolvidos com o objetivo de elucidar os mecanismos de regulação gênica presentes nos organismos vivos. Para isso, modelos matemáticos de redes de regulação gênica têm sido propostos, assim como algoritmos para inferir estas redes. Neste trabalho, focamos nestes dois aspectos: modelagem e inferência. Com relação à modelagem, estudamos modelos existentes para o ciclo celular da levedura (Saccharomyces cerevisiae). Após este estudo, propomos um modelo baseado em redes booleanas probabilísticas sensíveis ao contexto e em seguida um aprimoramento deste modelo, utilizando cadeias de Markov não homogêneas.
- Imprenta:
- Data da defesa: 17.02.2012
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ABNT
AGUENA HIGA, Carlos Henrique. Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes. 2011. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2011. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-06092012-144108. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Aguena Higa, C. H. (2011). Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-06092012-144108 -
NLM
Aguena Higa CH. Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes [Internet]. 2011 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-06092012-144108 -
Vancouver
Aguena Higa CH. Inferência de redes de regulação gênica utilizando o paradigma de crescimento de sementes [Internet]. 2011 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-06092012-144108 - Coeficientes de determinação, predição intrinsicamente multivariada e genética
- Budding yeast cell cycle modeled by context-sensitive probabilistic Boolean network
- Analysis of gene interactions using restricted boolean networks and time-series data
- Inference of gene regulatory network using temporal coefficient of determination obtained from ergodic Markov chains
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