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Deep diversification and long-term persistence in the South American 'dry diagonal': integrating continent-wide phylogeography and distribution modeling of geckos (2012)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT URBANO - IB
  • USP Schools: IB
  • DOI: 10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x
  • Subjects: MIOCENO; PLEISTOCENO; EVOLUÇÃO; ZOOGEOGRAFIA; HERPETOLOGIA
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: Evolution
    • ISSN: 1558-5646
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. online, p. on-line, May 2012
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    Versões disponíveis em Acesso Aberto do: 10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x (Fonte: Unpaywall API)

    Título do periódico: Evolution

    ISSN: 0014-3820

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    • ABNT

      WERNECK, Fernanda P; GAMBLE, Tony; COLLI, Guarino R; RODRIGUES, Miguel Trefaut Urbano; SITES JR., Jack W. Deep diversification and long-term persistence in the South American 'dry diagonal': integrating continent-wide phylogeography and distribution modeling of geckos. Evolution, Oxford, v. online, p. on-line, 2012. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x > DOI: 10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x.
    • APA

      Werneck, F. P., Gamble, T., Colli, G. R., Rodrigues, M. T. U., & Sites Jr., J. W. (2012). Deep diversification and long-term persistence in the South American 'dry diagonal': integrating continent-wide phylogeography and distribution modeling of geckos. Evolution, online, on-line. doi:10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x
    • NLM

      Werneck FP, Gamble T, Colli GR, Rodrigues MTU, Sites Jr. JW. Deep diversification and long-term persistence in the South American 'dry diagonal': integrating continent-wide phylogeography and distribution modeling of geckos [Internet]. Evolution. 2012 ; online on-line.Available from: http://dx.doi.org/10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x
    • Vancouver

      Werneck FP, Gamble T, Colli GR, Rodrigues MTU, Sites Jr. JW. Deep diversification and long-term persistence in the South American 'dry diagonal': integrating continent-wide phylogeography and distribution modeling of geckos [Internet]. Evolution. 2012 ; online on-line.Available from: http://dx.doi.org/10.1111/j.1558-5646.2012.01682.x

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    Volume: 10
    Primeira página: 118
    Ano: 1998
    DOI: 10.1006/mpev.1997.0478
    Autor: Maciel
    Título: Late Miocene diversification and phylogenetic relationships of the huge toads in the Rhinella marina (Linnaeus, 1758) species group (Anura: Bufonidae)
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 57
    Primeira página: 787
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.ympev.2010.08.025
    Autor: Maddison
    Título: Inferring phylogeny despite incomplete lineage sorting
    Título do periódico: Syst. Biol.
    Volume: 55
    Primeira página: 21
    Ano: 2006
    DOI: 10.1080/10635150500354928
    Autor: McCormack
    Título: Calibrating divergence times on species trees versus gene trees: implications for speciation histoty of Aphelocoma jays
    Título do periódico: Evolution
    Volume: 65
    Primeira página: 184
    Ano: 2011
    DOI: 10.1111/j.1558-5646.2010.01097.x
    Autor: Moraes
    Título: Phylogeography of the cactophilic species Drosophila gouveai: demographic events and divergence timing in dry vegetation enclaves in eastern Brazil
    Título do periódico: J. Biogeogr.
    Volume: 36
    Primeira página: 2136
    Ano: 2009
    DOI: 10.1111/j.1365-2699.2009.02145.x
    Autor: Morando
    Título: Sampling strategies for delimiting species: genes, individuals, and populations in the Liolaemus elongatus-kriegi complex (Squamata: Liolaemidae) in Andean-Patagonian South America
    Título do periódico: Syst. Biol.
    Volume: 52
    Primeira página: 159
    Ano: 2003
    DOI: 10.1080/10635150390192717
    Autor: Moritz
    Título: Diversification of rainforest faunas: an integrated molecular approach
    Título do periódico: Annu. Rev. Ecol. Syst.
    Volume: 31
    Primeira página: 533
    Ano: 2000
    DOI: 10.1146/annurev.ecolsys.31.1.533
    Autor: Moritz
    Título: Identification and dynamics of a cryptic suture zone in tropical rainforest
    Título do periódico: Proc. R. Soc. Lond. B Biol.
    Volume: 276
    Primeira página: 1235
    Ano: 2009
    DOI: 10.1098/rspb.2008.1622
    Autor: Mulch
    Título: Late Miocene climate variability and surface elevation in the central Andes
    Título do periódico: Earth Planet. Sci. Lett.
    Volume: 290
    Primeira página: 173
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.epsl.2009.12.019
    Autor: Nielsen
    Título: Distinguishing migration from isolation: a Markov Chain Monte Carlo approach
    Título do periódico: Genetics
    Volume: 158
    Primeira página: 885
    Ano: 2001
    Autor: Niemiller
    Título: Recent divergence with gene flow in Tennessee cave salamanders (Plethodontidae: Gyrinophilus) inferred from gene genealogies
    Título do periódico: Mol. Ecol.
    Volume: 17
    Primeira página: 2258
    Ano: 2008
    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.03750.x
    Autor: Nogueira
    Título: Vicariance and endemism in a Neotropical savanna hotspot: distribution patterns of Cerrado squamate reptiles
    Título do periódico: J. Biogeogr.
    Volume: 38
    Primeira página: 1907
    Ano: 2011
    DOI: 10.1111/j.1365-2699.2011.02538.x
    Autor: Nosil
    Título: Speciation with gene flow could be common
    Título do periódico: Mol. Ecol.
    Volume: 17
    Primeira página: 2103
    Ano: 2008
    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.03715.x
    Autor: Nuñez
    Título: Amphibian phylogeography in the Antipodes: refugia and postglacial colonization explain mitochondrial haplotype distribution in the Patagonian frog Eupsophus calcaratus (Cycloramphidae)
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 58
    Primeira página: 343
    Ano: 2011
    DOI: 10.1016/j.ympev.2010.11.026
    Autor: Oliveira
    Ano: 2002
    DOI: 10.7312/oliv12042
    Autor: Oliver
    Título: Molecular evidence for ten species and Oligo-Miocene vicariance within a nominal Australian gecko species (Crenadactylus ocellatus, Diplodactylidae)
    Título do periódico: BMC Evol. Biol.
    Volume: 10
    Primeira página: 1
    Ano: 2010
    DOI: 10.1186/1471-2148-10-386
    Autor: Otto-Bliesner
    Título: Simulating Arctic climate warmth and icefield retreat in the Last Interglaciation
    Título do periódico: Science
    Volume: 311
    Primeira página: 1751
    Ano: 2006
    DOI: 10.1126/science.1120808
    Autor: Passoni
    Título: Phylogeny, species limits, and biogeography of the Brazilian lizards of the genus Eurolophosaurus (Squamata: Tropiduridae) as inferred from mitochondrial DNA sequences
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 46
    Primeira página: 403
    Ano: 2008
    DOI: 10.1016/j.ympev.2007.10.022
    Autor: Pavlidis
    Título: msABC: a modification of Hudson's ms to facilitate multi-locus ABC analysis
    Título do periódico: Mol. Ecol. Res.
    Volume: 10
    Primeira página: 723
    Ano: 2010
    DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02832.x
    Autor: Pellegrino
    Título: Pericentric inversion events in karyotypic distinction of Brazilian lizards of genus Phyllopezus (Squamata, Gekkonidae) detected by chromosomal banding patterns
    Título do periódico: Hereditas
    Volume: 127
    Primeira página: 255
    Ano: 1997
    DOI: 10.1111/j.1601-5223.1997.t01-1-00255.x
    Autor: Pellegrino
    Título: Phylogeography and species limits in the Gymnodactylus darwinii complex (Gekkonidae, Squamata): genetic structure coincides with river systems in the Brazilian Atlantic Forest
    Título do periódico: Biol. J. Linn. Soc.
    Volume: 84
    Primeira página: 13
    Ano: 2005
    DOI: 10.1111/j.1095-8312.2005.00472.x
    Autor: Pepper
    Título: Palaeoclimate change drove diversification among isolated mountain refugia in the Australian arid zone
    Título do periódico: Mol. Ecol.
    Volume: 20
    Primeira página: 1529
    Ano: 2011
    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2011.05036.x
    Autor: Phillips
    Título: Maximum entropy modeling of species geographic distributions
    Título do periódico: Ecol. Model
    Volume: 190
    Primeira página: 231
    Ano: 2006
    DOI: 10.1016/j.ecolmodel.2005.03.026
    Autor: Pritchard
    Título: Inference of population structure using multilocus genotype data
    Título do periódico: Genetics
    Volume: 155
    Primeira página: 945
    Ano: 2000
    Autor: R Development Core Team
    Ano: 2010
    Rambaut , A. A. J. Drummond 2007 Tracer Analysis Tool v1.4. Tracer University of Oxford http://beast.bio.ed.ac.uk/
    Autor: Ramos
    Título: Phylogeography of the tree Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae: Caesalpinioideae) and the influence of Quaternary climate changes in the Brazilian Cerrado
    Título do periódico: Ann. Bot.
    Volume: 100
    Primeira página: 1219
    Ano: 2007
    DOI: 10.1093/aob/mcm221
    Autor: Ribas
    Título: A palaeobiogeographic model for biotic diversification within Amazonia over the past three million years
    Título do periódico: Proc. R. Soc. Lond. B Biol.
    Volume: 279
    Primeira página: 681
    Ano: 2012
    DOI: 10.1098/rspb.2011.1120
    Autor: Riccomini
    Título: Quaternary tectonics in Brazil
    Título do periódico: Episodes
    Volume: 22
    Primeira página: 221
    Ano: 1999
    Autor: Riddle
    Primeira página: 47
    Ano: 2011
    Autor: Rocha
    Título: Multigene phylogeny of Malagasy day geckos of the genus Phelsuma
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 52
    Primeira página: 530
    Ano: 2009
    DOI: 10.1016/j.ympev.2009.03.032
    Autor: Rodrigues
    Título: Lizards, snakes, and amphisbaenians from the Quaternary sand dunes of the middle Rio São Francisco, Bahia, Brazil
    Título do periódico: J. Herpetol.
    Volume: 30
    Primeira página: 513
    Ano: 1996
    DOI: 10.2307/1565694
    Autor: Rodrigues
    Primeira página: 181
    Ano: 2003
    Autor: Rozas
    Título: DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 19
    Primeira página: 2496
    Ano: 2003
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btg359
    Autor: Rull
    Título: Speciation timing and neotropical biodiversity: the Tertiary-Quaternary debate in the light of molecular phylogenetic evidence
    Título do periódico: Mol. Ecol.
    Volume: 17
    Primeira página: 2722
    Ano: 2008
    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.03789.x
    Autor: Rull
    Título: Neotropical biodiversity: timing and potential drivers
    Título do periódico: Tree
    Volume: 26
    Primeira página: 508
    Autor: Rull
    Título: Origins of biodiversity
    Título do periódico: Science
    Volume: 331
    Primeira página: 398
    DOI: 10.1126/science.331.6016.398-c
    Autor: Rundell
    Título: Adaptive radiation, nonadaptive radiation, ecological speciation and nonecological speciation
    Título do periódico: Tree
    Volume: 24
    Primeira página: 394
    Ano: 2009
    Autor: Ruskin
    Título: Stable isotope composition of middle Miocene carbonates of the Frontal Cordillera and Sierras Pampeanas: did the Paranaense seaway flood western and central Argentina?
    Título do periódico: Palaeogeogr. Palaeoclimatol. Palaeocol.
    Volume: 308
    Primeira página: 293
    Ano: 2011
    DOI: 10.1016/j.palaeo.2011.05.033
    Autor: Sampaio
    Primeira página: 35
    Ano: 1995
    DOI: 10.1017/CBO9780511753398.003
    Autor: Sérsic
    Título: Emerging phylogeographical patterns of plants and terrestrial vertebrates from Patagonia
    Título do periódico: Biol. J. Linn. Soc.
    Volume: 103
    Primeira página: 475
    Ano: 2011
    DOI: 10.1111/j.1095-8312.2011.01656.x
    Autor: Siedchlag
    Título: Genetic structure, phylogeny, and biogeography of Brazilian eyelid-less lizards of genera Calyptommatus and Nothobachia (Squamata, Gymnophthalmidae) as inferred from mitochondrial DNA sequences
    Título do periódico: Mol Phylogenet Evol
    Volume: 56
    Primeira página: 622
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.ympev.2010.04.027
    Autor: Simon
    Título: Recent assembly of the Cerrado, a neotropical plant diversity hotspot, by in situ evolution of adaptations to fire
    Título do periódico: Proc. Natl. Acad. Sci. USA
    Volume: 106
    Primeira página: 20359
    Ano: 2009
    DOI: 10.1073/pnas.0903410106
    Autor: Smith
    Título: Biodiversity hotspots and beyond: the need for preserving environmental transitions
    Título do periódico: Tree
    Volume: 16
    Primeira página: 431
    Ano: 2001
    Autor: Stamatakis
    Título: RAxML-VI-HPC: maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 22
    Primeira página: 2688
    Ano: 2006
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btl446
    Autor: Tamura
    Título: Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees
    Título do periódico: Mol. Biol. Evol.
    Volume: 10
    Primeira página: 512
    Ano: 1993
    Autor: Tamura
    Título: MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods
    Título do periódico: Mol. Biol. Evol
    Volume: 28
    Primeira página: 2731
    Ano: 2011
    DOI: 10.1093/molbev/msr121
    Autor: Templeton
    Título: Coherent and incoherent inference in phylogeography and human evolution
    Título do periódico: Proc. Natl. Acad. Sci. USA
    Volume: 107
    Primeira página: 6376
    Ano: 2010
    DOI: 10.1073/pnas.0910647107
    Autor: Thomé
    Título: Phylogeography of endemic toads and post-Pliocene persistence of the Brazilian Atlantic Forest
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 55
    Primeira página: 1018
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.ympev.2010.02.003
    Autor: Townsend
    Título: Phylogeny of iguanian lizards inferred from 29 nuclear loci, and a comparison of concatenated and species-tree approaches for an ancient, rapid radiation
    Título do periódico: Mol. Phylogenet. Evol.
    Volume: 61
    Primeira página: 363
    Ano: 2011
    DOI: 10.1016/j.ympev.2011.07.008
    Autor: Uba
    Título: Evolution of the Late Cenozoic Chaco foreland basin, Southern Bolívia
    Título do periódico: Basin Res.
    Volume: 18
    Primeira página: 145
    Ano: 2006
    DOI: 10.1111/j.1365-2117.2006.00291.x
    Autor: VanderWerf
    Título: Stepping stone speciation in Hawaii's flycatchers: molecular divergence supports new island endemics within the elepaio
    Título do periódico: Conserv. Genet.
    Volume: 11
    Primeira página: 1283
    Ano: 2010
    DOI: 10.1007/s10592-009-9958-1
    Autor: Vanzolini
    Título: Sobre o gênero Phyllopezus Peters (Sauria, Gekkonidae)
    Título do periódico: Papéis Avulsos de Zoologia, São Paulo
    Volume: 11
    Primeira página: 353
    Ano: 1953
    Autor: Vanzolini
    Primeira página: 305
    Ano: 1963
    Autor: Vanzolini
    Título: On the lizards of a Cerrado-Caatinga contact, evolutionary and zoogeographical implications (Sauria)
    Título do periódico: Papéis Avulsos de Zoologia, São Paulo
    Volume: 29
    Primeira página: 111
    Ano: 1976
    Autor: Weisrock
    Título: Delimiting species without nuclear monophyly in Madagascar's mouse lemurs
    Título do periódico: PLoS Biol.
    Volume: 5
    Primeira página: e9883
    Ano: 2010
    Autor: Werneck
    Título: The diversification of eastern South American open vegetation biomes: historical biogeography and perspectives
    Título do periódico: Quat. Sci. Rev.
    Volume: 30
    Primeira página: 1630
    Ano: 2011
    DOI: 10.1016/j.quascirev.2011.03.009
    Autor: Werneck
    Título: Phylogeny, biogeography and evolution of clutch size in South American lizards of the genus Kentropyx (Squamata: Teiidae)
    Título do periódico: Mol. Ecol.
    Volume: 18
    Primeira página: 262
    Ano: 2009
    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2008.03999.x
    Autor: Werneck
    Título: Revisiting the historical distribution of Seasonally Dry Tropical Forests: new insights based on palaeodistribution modelling and palynological evidence
    Título do periódico: Glob. Ecol. Biogeogr.
    Volume: 20
    Primeira página: 272
    Ano: 2011
    DOI: 10.1111/j.1466-8238.2010.00596.x
    Autor: Werneck
    Título: Climatic stability in the Brazilian Cerrado: implications for biogeographical connection of South American savannas, species richness, and conservation in a biodiversity hotspot
    Título do periódico: J. Biogeogr.