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Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica (2011)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: MIYAZAKI, FLAVIA AKEMI - BIOINFORMÁTICA
  • USP Schools: BIOINFORMÁTICA
  • Subjects: BIOINFORMÁTICA
  • Language: Português
  • Abstract: As pesquisas em biologia molecular têm produzido uma grande quantidade de dados, os quais embutem informações sobre diferentes fenômenos biológicos. Neste sentido, a bioinformática se destaca como uma área de pesquisa multidisciplinar que visa, principalmente, o desenvolvimento de ferramentas (sistemas) computacionais para auxiliar na descoberta de conhecimento a partir de dados biológicos. Dentro da bioinformática, a área de genômica funcional procura estudar as funções gênicas através da medição simultânea e em larga escala dos níveis de expressão gênica de um genoma. Diferentes ferramentas são utilizadas no processo de análise de expressão gênica, cada qual provê suporte a uma atividade de análise específica. Embora alguns ambientes de descoberta de conhecimento ofereçam suporte integrado a este processo de análise e exploração de dados, a maior parte das ferramentas de análise é desenvolvida independentemente de outras ferramentas e ambientes de descoberta de conhecimento. Este cenário representa um desafio para biologistas que precisam combinar e integrar diferentes ferramentas, muitas vezes de forma ad hoc, custosa e sujeita a erros. Modelos conceituais, tais como ontologias, têm contribuído para o sucesso do desenvolvimento de sistemas computacionais em diferentes domínios de aplicação. O desenvolvimento de tais modelos tem por objetivo representar corretamente, em alto nível de abstração, conceitos e situações pertinentes a um dado domínio de interesse. Esta representação abstrata facilita não apenas o entendimento de um dado domínio, mas também serve como base para o processo de desenvolvimento do sistema como um todo. O objetivo deste trabalho é investigar o desenvolvimento e o uso de modelos conceituais em geral e ontologias em particular, na integração de ferramentas na área de análise de expressão gênica.De forma específica, este trabalho tem por objetivo propor uma abordagem para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica a partir do uso de conectores e de uma ontologia de domínio. Essa abordagem foi aplicada no desenvolvimento de estudos de caso envolvendo a criação de diferentes ambientes integrados para a análise de expressão gênica e mostrou-se eficaz.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 15.12.2011

  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    IME31000069590QH507.T M685a e.2
    How to cite
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    • ABNT

      MIYAZAKI, Flávia Akemi; FARIAS, Cléver Ricardo Guareis de; VÊNCIO, Ricardo Zorzetto Nicoliello. Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica. 2011.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2011.
    • APA

      Miyazaki, F. A., Farias, C. R. G. de, & Vêncio, R. Z. N. (2011). Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica. Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.
    • NLM

      Miyazaki FA, Farias CRG de, Vêncio RZN. Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica. 2011 ;
    • Vancouver

      Miyazaki FA, Farias CRG de, Vêncio RZN. Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica. 2011 ;

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