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Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura (2014)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: MOREIRA, GABRIEL COSTA MONTEIRO - ESALQ
  • USP Schools: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LZT
  • Subjects: FRANGOS DE CORTE; CROMOSSOMOS; POLIMORFISMO; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
  • Language: Português
  • Abstract: Dezoito galinhas de uma população experimental utilizada em um cruzamento recíproco entre as linhagens de frangos de corte (TT) e de postura (CC) foram sequenciadas pela tecnologia de nova geração na plataforma Illumina com uma cobertura média de 10X. A descoberta de variantes genéticas foi realizada em uma região de locos de característica quantitativa (Quantitative Trait Locus, QTL), associado anteriormente com peso e percentagem de gordura abdominal no cromossomo 3 da galinha (GGA3), entre os marcadores microssatélites LEI0161 e ADL0371 (33,595,706-42,632,651 pb). O programa SAMtools foi utilizado na identificação de 136.054 SNPs únicos e 15.496 INDELs únicas nos 18 animais sequenciados e após a filtragem das mutações, 92.518 SNPs únicos e 9.298 INDELs únicas foram mantidas. Uma lista de 77 genes foi analisada buscando genes relacionados ao metabolismo de lipídios. Variantes localizadas na região codificante (386 SNPs e 15 INDELs) foram identificadas e associadas com vias metabólicas importantes. Variantes nos genes LOC771163, EGLN1, GNPAT, FAM120B, THBS2 e GGPS1 foram identificadas e podem ser responsáveis pela associação do QTL com a deposição de gordura na carcaça em galinhas
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 12.02.2014
  • Acesso online ao documento

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    ESABC12700014665t636.513 M872i e.1 105927
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    • ABNT

      MOREIRA, Gabriel Costa Monteiro; COUTINHO, Luiz Lehmann. Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura. 2014.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2014. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-19032014-113330/ >.
    • APA

      Moreira, G. C. M., & Coutinho, L. L. (2014). Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-19032014-113330/
    • NLM

      Moreira GCM, Coutinho LL. Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-19032014-113330/
    • Vancouver

      Moreira GCM, Coutinho LL. Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-19032014-113330/