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Rearrangements of 2.5 Kilobases of Noncoding DNA from the Drosophila even-skipped Locus Define Predictive Rules of Genomic cis-Regulatory Logic (2013)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: RAMOS, ALEXANDRE FERREIRA - EACH
  • USP Schools: EACH
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1003243
  • Subjects: DROSOPHILA; EXPRESSÃO GÊNICA; GENÔMICA; DNA
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: PLoS Genetics
    • ISSN: 1553-7390
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 9, n. 2, p. e1003243-1 - e1003243-18, feb. 2013
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    Título do periódico: PLoS Genetics

    ISSN: 1553-7404

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    Informações sobre o Citescore
  • Título: PLoS Genetics

    ISSN: 1553-7390

    Citescore - 2017: 5.57

    SJR - 2017: 4.829

    SNIP - 2017: 1.364


  • How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      KIM, Ah-Ram; MARTINEZ, Carlos; IONIDES, John; et al. Rearrangements of 2.5 Kilobases of Noncoding DNA from the Drosophila even-skipped Locus Define Predictive Rules of Genomic cis-Regulatory Logic. PLoS Genetics, San Francisco, v. 9, n. 2, p. e1003243-1 - e1003243-18, 2013. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1003243 > DOI: 10.1371/journal.pgen.1003243.
    • APA

      Kim, A. -R., Martinez, C., Ionides, J., Ramos, A. F., Ludwig, M. Z., Ogawa, N., et al. (2013). Rearrangements of 2.5 Kilobases of Noncoding DNA from the Drosophila even-skipped Locus Define Predictive Rules of Genomic cis-Regulatory Logic. PLoS Genetics, 9( 2), e1003243-1 - e1003243-18. doi:10.1371/journal.pgen.1003243
    • NLM

      Kim A-R, Martinez C, Ionides J, Ramos AF, Ludwig MZ, Ogawa N, Sharp DH, Reinitz J. Rearrangements of 2.5 Kilobases of Noncoding DNA from the Drosophila even-skipped Locus Define Predictive Rules of Genomic cis-Regulatory Logic [Internet]. PLoS Genetics. 2013 ; 9( 2): e1003243-1 - e1003243-18.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1003243
    • Vancouver

      Kim A-R, Martinez C, Ionides J, Ramos AF, Ludwig MZ, Ogawa N, Sharp DH, Reinitz J. Rearrangements of 2.5 Kilobases of Noncoding DNA from the Drosophila even-skipped Locus Define Predictive Rules of Genomic cis-Regulatory Logic [Internet]. PLoS Genetics. 2013 ; 9( 2): e1003243-1 - e1003243-18.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1003243

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    Título: Gene regulatory functions of Drosophila Fish-hook, a high mobility group domain Sox protein
    Título do periódico: Mechanisms of Development
    Volume: 73
    Primeira página: 169
    Ano: 1998
    DOI: 10.1016/S0925-4773(98)00050-1
    Autor: N Kirov
    Título: Conversion of a silencer into an enhancer: evidence for a co-repressor in dorsal-mediated repression in Drosophila
    Título do periódico: The EMBO Journal
    Volume: 12
    Primeira página: 3193
    Ano: 1993
    Autor: N Kirov
    Título: The transcriptional corepressor DSP1 inhibits activated transcription by disrupting TFIIA-TBP complex formation
    Título do periódico: The EMBO Journal
    Volume: 15
    Primeira página: 7079
    Ano: 1996
    Autor: TK Kerppola
    Título: Fos-Jun heterodimers and Jun homodimers bend DNA in opposite orientations: Implications for transcription factor cooperativity
    Título do periódico: Cell
    Volume: 66
    Primeira página: 317
    Ano: 1991
    DOI: 10.1016/0092-8674(91)90621-5
    Autor: SJ Maerkl
    Título: A systems approach to measuring the binding energy landscapes of transcription factors
    Título do periódico: Science
    Volume: 315
    Primeira página: 233
    Ano: 2007
    DOI: 10.1126/science.1131007
    Autor: S Barolo
    Título: Hairy mediates dominant repression in the Drosophila embryo
    Título do periódico: The EMBO Journal
    Volume: 16
    Primeira página: 2883
    Ano: 1997
    DOI: 10.1093/emboj/16.10.2883
    Autor: M Sedighi
    Título: Epigenetic chromatin silencing: bistability and front propagation
    Título do periódico: Physical Biology
    Volume: 4
    Primeira página: 246
    Ano: 2007
    DOI: 10.1088/1478-3975/4/4/002
    Autor: JM Gottesfeld
    Título: The length of nucleosome-associated DNA is the same in both transcribed and nontranscribed regions of chromatin
    Título do periódico: Nature
    Volume: 273
    Primeira página: 317
    Ano: 1978
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    Rubel O, Weber GH, Keranen SVE, Fowlkes CC, Hendriks LCL, et al. (2006) PointCloudXplore: Visual Analysis of 3D Gene Expression Data Using Physical Views and Parallel Coordinates. In: Eurographics/IEEE-VGTC Symposium on Visualization. pp. 203–210.
    Autor: MD Abramoff
    Título: Image Processing with Image J
    Título do periódico: Biophotonics International
    Volume: 11
    Primeira página: 36
    Ano: 2004
    Autor: E Roulet
    Título: High-throughput SELEX SAGE method for quantitative modeling of transcription-factor binding sites
    Título do periódico: Nature Biotechnology
    Volume: 20
    Primeira página: 831
    Ano: 2002
    DOI: 10.1038/nbt718
    Autor: N Orgawa
    Título: High-Throughput SELEX Determination of DNA Sequences Bound by Transcription Factors In Vitro
    Título do periódico: Methods in Molecular Biology
    Volume: 786
    Primeira página: 51
    Ano: 2012
    DOI: 10.1007/978-1-61779-292-2_3
    Autor: TL Bailey
    Título: MEME: discovering and analyzing dna and protein sequence motifs
    Título do periódico: Nucleic acids research
    Volume: 34
    Primeira página: 369
    Ano: 2006
    DOI: 10.1093/nar/gkl198
    Autor: N Rajewsky
    Título: Computational detection of genomic cis-regulatory modules applied to body patterning in the early Drosophila embryo
    Título do periódico: BMC Bioinformatics
    Volume: 3
    Primeira página: 30
    Ano: 2002
    DOI: 10.1186/1471-2105-3-30
    Autor: BP Berman
    Título: Exploiting transcription factor binding site clustering to identify cis-regulatory modules involved in pattern formation in the Drosophila genome
    Título do periódico: Proceedings of the National Academy of Sciences USA
    Volume: 99
    Primeira página: 757
    Ano: 2002
    DOI: 10.1073/pnas.231608898
    Autor: MB Noyes
    Título: A systematic characterization of factors that regulate drosophila segmentation via a bacterial one-hybrid system
    Título do periódico: Nucleic Acids Research
    Primeira página: 1
    Ano: 2008
    Autor: X Li
    Título: Transcription factors bind thousands of active and inactive regions in the Drosophila blastoderm
    Título do periódico: PLoS Biol
    Volume: 6
    Primeira página: e27
    Ano: 2008
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    Gilbert DG (2005). DroSpeGe, a public database of Drosophila species genomes. Http://insects.eugenes.org/DroSpeGe/.
    Autor: DG Gilbert
    Título: DroSpeGe: rapid access database for new Drosophila species genomes
    Título do periódico: Nucleic Acids Research
    Volume: 35
    Primeira página: D480
    Ano: 2007
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    Autor: DK Hawley
    Título: Mechanism of activation of transcription initiation from the lambda-PRM promoter
    Título do periódico: The Journal of Molecular Biology
    Volume: 157
    Primeira página: 493
    Ano: 1982
    DOI: 10.1016/0022-2836(82)90473-9